cluster # 378

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Schistosoma mansoni
cluster # 378 cluster # 378 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_378#0 length = 420 sequences # 2

consensusID : consensus_378#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 420
fasta sequence

                              [TGTGTTTGTTGTTGTAGGTGAGTGTTGATTGAGTTGTTTGTGTTGATAGTTGTGATCTGAATGTTAGTTACGTCTTAATAAATCATGATGACGACTAGTTGTTCATAGAAGTCGTTAATTAGACTTTGATGAATGAGTGATTGAGTGACTGAATGAATTGGTTGTTGAGAATTGAGTAGTTTCGCACTGTTATTGTATTTTGATAGTGAGCTCTTAGTACTTGTGTATGGATGTGTATTTGCGTTTGTTTATTTTTGAGGTTGTGGCGAAGATGGAGAGTGGTGTATTGAGTATGGTTGTATTCTGTATTTCGAGGATGTTTGTATATCTGAGTAAGTGTATAATTG-AA--GTGTAGA-TTG-ATTTGTTGTTGTTGTTG-TTGTTGTTTGAGTTGTTTGTGTTGATAGNTGTGATCTGAATGGT]

[+] EMBL CD134695             [TGTGTTTGTTGTTGTAGGTGAGTGTTGATTGAGTTGTTTGTGTTGATAGTTGTGATCTGAATGTTAGTTACGTCTTAATAAATCATGATGACGACTAGTTGTTCATAGAAGTCGTTAATTAGACTTTGATGAATGAGTGATTGAGTGACTGAATGAATTGGTTGTTGAGAATTGAGTAGTTTCGCACTGTTATTGTATTTTGATAGTGAGCTCTTAGTACTTGTGTATGGATGTGTATTTGCGTTTGTTTATTTTTGAGGTTGTGGCGAAGATGGAGAGTGGTGTATTGAGTATGGTTGTATTCTGTATTTCGAGGATGTTTGTATATCTGAGTAAGTGTATAATTG AA  GTGTAGA TTG ATTTGTTGTTGTTGTTG TTGTTGT                                     ]
[+] EMBL CD146124             [                                            GATAGTTGTGATCTGAATGTTAGTTACGTCTTAATAAATCATGATGACGACTAGTTGTTCATAGAAGTCGTTAATTAGACTTTGATGAATGAGTGATTGAGTGACTGAATGAATTGGTTGTTGAGAATTGAGTAGTTTCGCACTGTTATTGTATTTTGATAGTGAGCTCTTAGTACTTGTGTATGGATGTGTATTTGCGTTTGTTTATTTTTGAGGTTGTGGCGAAGATGGAGAGTGGTGTATTGAGTATGGTTGTATTCTGTATTTCGAGGATGTTTGTATATCTGAGTAAGTGTA AATTGTAATTGTGTAGAGTTGTGTTTGTTGTTGTAGGTGAGTGTTGATTGAGTTGTTTGTGTTGATAGNTGTGATCTGAATGGT]




>consensus_378#0
TGTGTTTGTTGTTGTAGGTGAGTGTTGATTGAGTTGTTTGTGTTGATAGTTGTGATCTGA
ATGTTAGTTACGTCTTAATAAATCATGATGACGACTAGTTGTTCATAGAAGTCGTTAATT
AGACTTTGATGAATGAGTGATTGAGTGACTGAATGAATTGGTTGTTGAGAATTGAGTAGT
TTCGCACTGTTATTGTATTTTGATAGTGAGCTCTTAGTACTTGTGTATGGATGTGTATTT
GCGTTTGTTTATTTTTGAGGTTGTGGCGAAGATGGAGAGTGGTGTATTGAGTATGGTTGT
ATTCTGTATTTCGAGGATGTTTGTATATCTGAGTAAGTGTATAATTGAAGTGTAGATTGA
TTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTTGAGTTGTTTGTGTTGATAGNTGTGATCTGAATGGT

clustalw multiple alignements is not computed in this case