cluster # 4009

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Schistosoma mansoni
cluster # 4009 cluster # 4009 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_4009#0 length = 716 sequences # 2

consensusID : consensus_4009#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 716
fasta sequence

                              [TCACCAGAAACACACAATCGGTCTAAATCTATCACACATCTGAAAAAAATTGACTGTCGTTTAGACAACTATACCTAAAGTCAAGTTTAATACAATGCAACATAATTAAATAAAACTTAAACCGATTAAAAAGGTGAACTTTGCAAGTTTGTATAATACATGATACAAATCTATTAGTGTTAATCTGCTTATTAATTTGGTTATGACCGATTAACAAATACAATATGGTAACTAAACTAGACGACGTAAGTGTCCAACACCAAGAAGACTTTTCCTTGGATTAATTCTGCCTGGCTGTCCTCCACTTTTAGGAACTGTCAAATTTATAAATAAAATACTTGAAAATATACTTGAACATTTTTAACCACCAAACCATTGATAACGACAAAAACAGTGACTAGGTTGTGTGTTGTAGTTTGATAATTAGATTTCAGTGAAACTTTGTTTATACTTTTTTGTTTGATACTTTCCGTCCACGTGAATCGTTCCCGAATAGCATACTTAGCANATTTANAACTTATGTTGGACCAATANAAACATTCTTCTATATACCCTATGAAATAATTCTGNTATTAGGAAAACTGGAAGCAACTTTAAGTAGATTGATGAANAACTTGTTTNCTGAC-ATGTCTGTTAGAGTACCTGAAACAGGNAGTGGACCCNGTT-CATTTGTTCCGTGTCAAACCAA-TGGTATTGCAGGTGCGTACGATAATTGT]

[+] EMBL CD154334             [TCACCAGAAACACACAATCGGTCTAAATCTATCACACATCTGAAAAAAATTGACTGTCGTTTAGACAACTATACCTAAAGTCAAGTTTAATACAATGCAACATAATTAAATAAAACTTAAACCGATTAAAAAGGTGAACTTTGCAAGTTTGTATAATACATGATACAAATCTATTAGTGTTAATCTGCTTATTAATTTGGTTATGACCGATTAACAAATACAATATGGTAACTAAACTAGACGACGTAAGTGTCCAACACCAAGAAGACTTTTCCTTGGATTAATTCTGCCTGGCTGTCCTCCACTTTTAGGAACTGTCAAATTTATAAATAAAATACTTGAAAATATACTTGAACATTTTTAACCACCAAACCATTGATAACGACAAAAACAGTGACTAGGTTGTGTGTTGTAGTTTGATAATTAGATTTCAGTGAAACTTTGTTTATACTTTTTTGTTTGATACTTTCCGTCCACGTGAATCGTTCCCGAATAGCATACTTAGCANATTTANAACTTATGTTGGACCAATANAAACATTCTTCTATATACCCTATGAAATAATTCTGNTATTAGGAAAACTGGAAGCAACTTTAAGTAGATTGATGAANAACTTGTTTNCTGAC ATGTCTGTTAGAGTACCTGAAACAGGNAGTGGACCCNGTT CATTTGTTCCGTGTCAAACCAA TGGTATTGCAGGTGCGTACGATAAT   ]
[-] EMBL CD154778             [                                                                                                                                 AAAGGTGAACTNTGCAAGTNTGTATAATACATGATACAAATCTATTAGTGTTAATCTGCTTATTAATTTGGTTATGACCGATTAACAAATACAATATGGTAACTAAACTAGACGACGTAAGTGTCCAACACCAAGAAGACTTTTCCTTGGATTAATTCTGCCTGGCTGTCCTCCACTTTTAGGAACTGTCAAATTTATAAATAAAATACTTGAAAATATACTTGAACATTTTTAACCACCAAACCATTGATAACGACAAAAACAGTGACTAGGTTGTGTGTTGTAGTTTGATAATTAGATTTCAGTGAAACTTTGTTTATACTTTTTTGTTTGATACTTTCCGTCCACGTGAATCGTTCCCGAATAGCATACTTAGCAAATTTAAAACTTATGTTGGACCAATAAAAACATTCTTCTATATACCCTATGAAATAATTCTGTTATTAGGAAAACTGGAAGCAACTTTAAGTAGATTGATGAAAAACTTGTTT CTGACAATGTCTGTTAGAGTACCTGAAACAAGGAGTGGACCC GTTCCATTTGTTCCGTGTCAAACCAATTAGTATTGCAGTTGCGTACGATAAATGT]




>consensus_4009#0
TCACCAGAAACACACAATCGGTCTAAATCTATCACACATCTGAAAAAAATTGACTGTCGT
TTAGACAACTATACCTAAAGTCAAGTTTAATACAATGCAACATAATTAAATAAAACTTAA
ACCGATTAAAAAGGTGAACTTTGCAAGTTTGTATAATACATGATACAAATCTATTAGTGT
TAATCTGCTTATTAATTTGGTTATGACCGATTAACAAATACAATATGGTAACTAAACTAG
ACGACGTAAGTGTCCAACACCAAGAAGACTTTTCCTTGGATTAATTCTGCCTGGCTGTCC
TCCACTTTTAGGAACTGTCAAATTTATAAATAAAATACTTGAAAATATACTTGAACATTT
TTAACCACCAAACCATTGATAACGACAAAAACAGTGACTAGGTTGTGTGTTGTAGTTTGA
TAATTAGATTTCAGTGAAACTTTGTTTATACTTTTTTGTTTGATACTTTCCGTCCACGTG
AATCGTTCCCGAATAGCATACTTAGCANATTTANAACTTATGTTGGACCAATANAAACAT
TCTTCTATATACCCTATGAAATAATTCTGNTATTAGGAAAACTGGAAGCAACTTTAAGTA
GATTGATGAANAACTTGTTTNCTGACATGTCTGTTAGAGTACCTGAAACAGGNAGTGGAC
CCNGTTCATTTGTTCCGTGTCAAACCAATGGTATTGCAGGTGCGTACGATAATTGT

clustalw multiple alignements is not computed in this case