cluster # 4101

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Schistosoma mansoni
cluster # 4101 cluster # 4101 Sequences # 3 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4101#0 length = 1430 sequences # 3
consensusID : consensus_4101#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1430
fasta sequence
                              [TCGAGGCCAGAATTTGGCACGAGGTCCACTTAAACCGTTTGTAAATACGTGCAATTATGATACATCACATGTATATTCATTATCGTACAATGTGACCACGCCATTGCCTAGAAGTTTAGAACTTGTTTCACGTGCTACACGCATTTCAGATTCTGGCAAATTAACTACGTTAGATTACCTTCTTTCTGAATTGAAATCAAATGGACATCGTGTATTAATTTATTCACAAATGACACGTATGATTGATATATTAGAGGAGTTTATGTTATATCGTAAACATGCTTATCTACGATTGGATGGTTCATCACGTTTATCCGATCGTAGAGATATGGTTGCTCAATGGCAGACTAATCCACGTTGGTTTGTATTCTTATTATCAACCCGTGCTGGTGGCCTTGGTATTAATTTAACTGCAGCTGATACAGTTATATTTTATGATTCTGACTGGAATCCAACTGTAGATCAACAAGCAATGGATCGTGCACATCGTCTAGGTCAAACAAAACCTGTTACAGTTTATAGGCTTATTTGCAAAAATACAGTCGAAGGTCGTATGTTGCGTCGTGCAGAAGAGAAACGTGCCATGCAACAAATGGTAATCCAATCAGGTCAAGGAGGATTAAACAATCTATTGTCAAATGTAACAAATTCGTCAAGTTCCACGGAACATATGACT---TCCGATATGGTTTCTTTGTTACTTGATGATGATGAGTTGGT-AAACGACTTC-AATACGTAGACGATTAC-ACCTC-ACGTGGTCGCCCAGCTAAAAATCAAGCAGCCAAAAGACTAATAGCCTCTGAAAATGTAACTAATCTTTCAAACGCAGACGCTGAGGCACATGTAATTGGACGGTCATCATCAAGTGGTTTCAATCCCACAAAATCAAGTTCGCGTCCTCAGGCCGCATCAGATATCAGTGCTGTTGATGAAGATTTGCTTGAACGAAAACGTCAAGCAGCTTGGGCTGAACAACCTCGTGGGGGCCGCATTAAAAAGATCCGTCCAATGGAATCAATCGGGCCGGCGACTATTTCTCCATTTGACAGCTCTGTAACAACTTGTGANTATGATAATAATTCTAATAGTAATAGTAGTAACAATACGACATAAGTGCTTATTGGAATAGGAATTATTTTATTATTATCAGTTATATTCTTTTGTCGCCATTGATATTTTGTCCGAAATTCTTCTTGGTTTCATCATTACCATAAACCAGATAATTTCGTAATGCATTTCTATAATTTTCTGAGCAAATAAATGTATATAGAGATAACGAACCACTTTAATTGGTGTATTTTCTATTAACAATTCGATGTTTTATTTTACAAAAATGAAAAGGAACTTATAATTACAACATATTATGTATCCTATATTTTTTTAGTGTACCTTCAGCCTTTTACCGATTTTGTTAAAATGGAAATAAAAGCGAT]

[+] EMBL CD081131             [TCGAGGCCAGAATTTGGCACGAGGTCCACTTAAACCGTTTGTAAATACGTGCAATTATGATACATCACATGTATATTCATTATCGTACAATGTGACCACGCCATTGCCTAGAAGTTTAGAACTTGTTTCACGTGCTACACGCATTTCAGATTCTGGCAAATTAACTACGTTAGATTACCTTCTTTCTGAATTGAAATCAAATGGACATCGTGTATTAATTTATTCACAAATGACACGTATGATTGATATATTAGAGGAGTTTATGTTATATCGTAAACATGCTTATCTACGATTGGATGGTTCATCACGTTTATCCGATCGTAGAGATATGGTTGCTCAATGGCAGACTAATCCACGTTGGTTTGTATTCTTATTATCAACCCGTGCTGGTGGCCTTGGTATTAATTTAACTGCAGCTGATACAGTTATATTTTATGATTCTGACTGGAATCCAACTGTAGATCAACAAGCAATGGATCGTGCACATCGTCTAGGTCAAACAAAACCTGTTACAGTTTATAGGCTTATTTGCAAAAATACAGTCGAAGGTCGTATGTTGCGTCGTGCAGAAGAGAAACGTGCCATGCAACAAATGGTAATCCAATCAGGTCAAGGAGGATTAAACAATCTATTGTCAAATGTAACAAATTCGTCAAGTTCCACGGAACATATGACT   TCCGATATGGTTTCTTTGTTACTTGATGATGATGAGTTGGT AAACGACTTC AATACGTAGACGATTAC ACCTC ACGTGGTCG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD080540             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ATGATTCTGACTGGAATCCAACTGTAGATCAACAAGCAATGGATCGTGCACATCGTCTAGGTCAAACAAAACCTGTTACAGTTTATAGGCTTATTTGCAAAAATACAGTCGAAGGTCGTATGTTGCGTCGTGCAGAAGAGAAACGTGCCATGCAACAAATGGTAATCCAATCAGGTCAAGGAGGATTAAACAATCTATTGTCAAATGTAACAAATTCGTCAAGTTCCACGGAACATATGACTTCATCCGATATGGTTTCTTTGTTACTTGATGATGATGAGTTGGTAAAACGACTTCAAATACGTAGACGATTACAACCTCAACGTGGTCGCCCAGCTAAAAATCAAGCAGCCAAAAGACTAATAGCCTCTGAAAATGTAACTAATCTTTCAAACGCAGACGCTGAGGCACATGTAATTGGACGGTCATCATCAAGTGGTTTCAATCCCACAAAATCAAGTTCGCGTCCTCAGGCCGCATCAGATATCAGTGCTGTTGATGAAGATTTGCTTGAACGAAAACGTCAAGCAGCTTGGGCTGAACAACCTCGTGGGGGCCGCATTAAAAAGATCCGTCCAATGGAATCAATCGGGCCGGCGACTATTTCTCCATTTGACAGCTCTGTAACAACTTGTGANTATGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD074954             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GACTAATAGCCTCTGAAAATGTAACTAATCTTTCAAACGCAGACGCTGAGGCACATGTAATTGGACGGTCATCATCAAGTGGTTTCAATCCCACAAAATCAAGTTCGCGTCCTCAGGCCGCATCAGATATCAGTGCTGTTGATGAAGATTTGCTTGAACGAAAACGTCAAGCAGCTTGGGCTGAACAACCTCGTGGGGGCCGCATTAAAAAGATCCGTCCAATGGAATCAATCGGGCCGGCGACTATTTCTCCATTTGACAGCTCTGTAACAACTTGTGATAATGATAATAATTCTAATAGTAATAGTAGTAACAATACGACATAAGTGCTTATTGGAATAGGAATTATTTTATTATTATCAGTTATATTCTTTTGTCGCCATTGATATTTTGTCCGAAATTCTTCTTGGTTTCATCATTACCATAAACCAGATAATTTCGTAATGCATTTCTATAATTTTCTGAGCAAATAAATGTATATAGAGATAACGAACCACTTTAATTGGTGTATTTTCTATTAACAATTCGATGTTTTATTTTACAAAAATGAAAAGGAACTTATAATTACAACATATTATGTATCCTATATTTTTTTAGTGTACCTTCAGCCTTTTACCGATTTTGTTAAAATGGAAATAAAAGCGAT]




>consensus_4101#0
TCGAGGCCAGAATTTGGCACGAGGTCCACTTAAACCGTTTGTAAATACGTGCAATTATGA
TACATCACATGTATATTCATTATCGTACAATGTGACCACGCCATTGCCTAGAAGTTTAGA
ACTTGTTTCACGTGCTACACGCATTTCAGATTCTGGCAAATTAACTACGTTAGATTACCT
TCTTTCTGAATTGAAATCAAATGGACATCGTGTATTAATTTATTCACAAATGACACGTAT
GATTGATATATTAGAGGAGTTTATGTTATATCGTAAACATGCTTATCTACGATTGGATGG
TTCATCACGTTTATCCGATCGTAGAGATATGGTTGCTCAATGGCAGACTAATCCACGTTG
GTTTGTATTCTTATTATCAACCCGTGCTGGTGGCCTTGGTATTAATTTAACTGCAGCTGA
TACAGTTATATTTTATGATTCTGACTGGAATCCAACTGTAGATCAACAAGCAATGGATCG
TGCACATCGTCTAGGTCAAACAAAACCTGTTACAGTTTATAGGCTTATTTGCAAAAATAC
AGTCGAAGGTCGTATGTTGCGTCGTGCAGAAGAGAAACGTGCCATGCAACAAATGGTAAT
CCAATCAGGTCAAGGAGGATTAAACAATCTATTGTCAAATGTAACAAATTCGTCAAGTTC
CACGGAACATATGACTTCCGATATGGTTTCTTTGTTACTTGATGATGATGAGTTGGTAAA
CGACTTCAATACGTAGACGATTACACCTCACGTGGTCGCCCAGCTAAAAATCAAGCAGCC
AAAAGACTAATAGCCTCTGAAAATGTAACTAATCTTTCAAACGCAGACGCTGAGGCACAT
GTAATTGGACGGTCATCATCAAGTGGTTTCAATCCCACAAAATCAAGTTCGCGTCCTCAG
GCCGCATCAGATATCAGTGCTGTTGATGAAGATTTGCTTGAACGAAAACGTCAAGCAGCT
TGGGCTGAACAACCTCGTGGGGGCCGCATTAAAAAGATCCGTCCAATGGAATCAATCGGG
CCGGCGACTATTTCTCCATTTGACAGCTCTGTAACAACTTGTGANTATGATAATAATTCT
AATAGTAATAGTAGTAACAATACGACATAAGTGCTTATTGGAATAGGAATTATTTTATTA
TTATCAGTTATATTCTTTTGTCGCCATTGATATTTTGTCCGAAATTCTTCTTGGTTTCAT
CATTACCATAAACCAGATAATTTCGTAATGCATTTCTATAATTTTCTGAGCAAATAAATG
TATATAGAGATAACGAACCACTTTAATTGGTGTATTTTCTATTAACAATTCGATGTTTTA
TTTTACAAAAATGAAAAGGAACTTATAATTACAACATATTATGTATCCTATATTTTTTTA
GTGTACCTTCAGCCTTTTACCGATTTTGTTAAAATGGAAATAAAAGCGAT
clustalw multiple alignements is not computed in this case