Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 4390 cluster # 4390       Sequences # 3       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4390#0 length = 522 sequences # 3  
consensusID : consensus_4390#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 522
fasta sequence 
                              [TGACACGTGCTTATTATTCCTCTTACTTTTTAATATCTTAACCACAGTGTGCACATATGCCAATTAGAGACTGACCAGTTGCAGTCCTAACACATCGATGGGAAGATTCAAACAAACAATACTAGGTCAGTTAGAATTTTGTTTTAGAGAAATCTACAGGCTAACAAATTTAAACCATAGAAATATTTCATGTTATTGACGTTAAGTCCTATTGAAATTGATCAGACTCACATCCCAACAGTTGAAAGCTTCAATGTAGACTTTTAAGTTCATTAATCACAGAGTAAATAGGGACTCGATTGTTCACTTTTGTGACCTCATTAGTTTCGAAATTAGTTCTTTCATTCGATCGATAAAGTAAATTTTATAGTAAATCTTAATTGTAATAAGTATCTCCTAAATTTAGATCAAATTATCAATTAATATCGCATCCTTTACCGTTTCGTATTATCTTCTATGTAATTTGAAATCATATTTCCATTGATTATGTACTCTGATAAAGCCTACTTTTGATCTCTTTGT]

[+] EMBL CD090005             [TGACACGTGCTTATTATTCCTCTTACTTTTTAATATCTTAACCACAGTGTGCACATATGCCAATTATAGACTGACCAGTTGCAGTCCTAACACATCGATGGGAAGATTCAAACAAACAATACTAGGTCAGCTATAATTTTGGTTTAGAGAAATCTACAGGCTAACAAATTTAAACCATAGAAATATTTCATGTTATTGACGCTAAGTCCTATTGAAATTGATCAGACTCACATCCCAACAGTTGAAAGCTTCAATGTAGACTTTTAAGTTCATTAATCACATAGTAAATAGGGACTCGATTGTTCACTTTTGTGACCTCATTACTTTCGAAATTAACTCTTTAATTCGATCGATAAAGTAAATTTTATAGTAAATCTTAATTGTAATAAGTATCTCCTACATTTAGATCAAATTATCAATTAATATCGGATCCTTTACCGCTTCGTATTATCTTCTATGCAATTCGAAATCATATTTCCATTGATTATGTACTCTGATAAAGCCTACTTTTGATCTCTTTGT]
[+] EMBL CD090127             [TGACACGTGCTTATTATTCCTCTTACTTTTTAATATCTTAACCACAGTGTGCACATATGCCAATTAGAGACTGACCAGTTGCAGTCCTAACACATCGATGGGAAGATTCAAACAAACAATACTAGGTCAGTTAGAATTTTGTTTTAGAGAAATCTACAGGCTAACAAATTTAAACCATAGAAATATTTCATGTTATTGACGTTAAGTCCTATTGAAATTGATCAGACTCACATCCCAACAGTTGAAAGCTTCAATGTAGACTTTTAAGTTCATTAATCGCAGAGTAAATAGGGACTCGATTGTTCACTTTTGTGACCTCATTAGTTTCGAAATTAGTTCTTTCATTCGATCGATAAAGTAAATTTTATAGTAAATCTTAATTGTAATAAGTATCTCCTAAATTTAGATCAAATTATCAATTAATATCGCATCCTTTACCGTTTCGTATTATCTTCTATGTAATTTGAAATCATATTTCCATTGATTATGTACTCTGATAAAGCCTACTTTTGATCTCTTTGT]
[+] EMBL CD090125             [TGACACGTGCTTATTATTCCTCTTACTTTTTAATATCTTAACCACAGTGTGCACATATGCCAATTAGAGACTGACCAGTTGCAGTCCTAACACATCGATGGGAAGATTCAAACAAACAATACTAGGTCAGTTAGAATTTTGTTTTAGAGAAATCTACAGGCTAACAAATTTAAACCATAGAAATATTTCATGTTATTGACGTTAAGTCCTATTGAAATTGATCAGACTCACATCCCAACAGTTGAAAGCTTCAATGTAGACTTTTAAGTTCATTAATCACAGAGTAAATAGGGACTCGATTGTTCACTTTTGTGACCTCATTAGTTTCGAAATTAGTTCTTTCATTCGATCGATAAAGTAAATTTTATAGTAAATCTTAATTGTAATAAGTATCTCCTAAATTTAGATCAAATTATCAATTAATATCGCATCCTTTACCGTTTCGTATTATCTTCTATGTAATTTGAAATCATATTTCCATTGATTATGTACTCTGATAAAGCCTACTTTTGATCTCTTTGT]




>consensus_4390#0
TGACACGTGCTTATTATTCCTCTTACTTTTTAATATCTTAACCACAGTGTGCACATATGC
CAATTAGAGACTGACCAGTTGCAGTCCTAACACATCGATGGGAAGATTCAAACAAACAAT
ACTAGGTCAGTTAGAATTTTGTTTTAGAGAAATCTACAGGCTAACAAATTTAAACCATAG
AAATATTTCATGTTATTGACGTTAAGTCCTATTGAAATTGATCAGACTCACATCCCAACA
GTTGAAAGCTTCAATGTAGACTTTTAAGTTCATTAATCACAGAGTAAATAGGGACTCGAT
TGTTCACTTTTGTGACCTCATTAGTTTCGAAATTAGTTCTTTCATTCGATCGATAAAGTA
AATTTTATAGTAAATCTTAATTGTAATAAGTATCTCCTAAATTTAGATCAAATTATCAAT
TAATATCGCATCCTTTACCGTTTCGTATTATCTTCTATGTAATTTGAAATCATATTTCCA
TTGATTATGTACTCTGATAAAGCCTACTTTTGATCTCTTTGT

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)