cluster # 4482

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Schistosoma mansoni
cluster # 4482 cluster # 4482 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_4482#0 length = 660 sequences # 3

consensusID : consensus_4482#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 660
fasta sequence

                              [CCTGATGGTCCTGGATTCAATCTTCACTTGGACCGTTGGTAGACAGTGCTGAAGAGTAGCATACTAAAACGAAACAACTATCCACTTCTTCCCAACTCCCAGTGATTTCTTATCAAAAGTCAATTCATTATGTAAAACTCCAAAGTCAATAATTTACAGAACATACTATAACAGTCATGTTATTATTTGAATTTTCGAACTACATATTTTACTGCTATTATTTTGTTAATATAAAATTTTTGACCCCATAAATTCATCTGTTTTCGCCATGTATTTCTCGAGTAAG-CAGTCA-C-CGAG-TTTAACTGGT-TCTGTGGGAATGTTGTCTTACGTTTCATATAGTTGTTACTGAAAAAAATAATTATGTGATAATAATGAACGTTTATGACTTCTGCTAATAGCCATTATCTACATAGGTTGGGGCTGCATTTCTTATATCTGTCGTATATTACTAACACAAACATCACAACTTCTTAATATTTCTTCTATGAGGTTTTAATGTCCTAATCTTTTATTAAAATGGCCAACAAGTTTCACTAGCTAGGATTCTAAATTTTTTGTCCCATTAATATATAATGCATTTCTGAAACCCCACTCCAGGATCCGATTAATTCACTTTTCCTATGACCTATGAGAGTCATTCATCATATATCTACAGTCTCG]

[+] EMBL CD164620             [CCTGATGGTCCTGGATTCAATCTTCACTTGGACCGTTGGTAGACAGTGCTGAAGAGTAGCATACTAAAACGAAACAACTATCCACTTCTTCCCAACTCCCAGTGATTTCTTATCAAAAGTCAATTCATTATGTAAAACTCCAAAGTCAATAATTTACAGAACATACTATAACAGTCATGTTATTATTTGAATTTTCGAACTACATATTTTACTGCTATTATTTTGTTAATATAAAATTTTTGACCCCATAAATTCATCTGTTTTCGCCATGTATTTCTCGAGTAAG CAGTCA C CGAG TTTAACTGGT TCTGTGGGAATGTTGTCTTACGTTTCATATAGTTGTTACTGAAAAAAATAATTATGTGATAATAATGAACGTTTATGACTTCTGCTAATAGCCATTATCTACATAGGTTGGGGCTGCATTTCTTATATCTGTCGTATATTACTAACACAAACATCACAACTTCTTAATATTTCTTCTATGAGGTTTTAATGTCCTAATCTTTTATTAAAATGGCCAACAAGTTTCACTAGCTAGGATTCTAAATTTTTTGTCCCATTAATATATAATGCATTTCTGAAACCCCACTCCAGGATCCGATTAATTCACTTTTCCTATGACCTATGAGAGTCATTCATCATATATCTACAGTCTC ]
[-] EMBL CD164524             [                                                                                                                                                                                                                                                                       TCGCCATGTATTTCTCGAGTAAG CAGTCA CGCGAG TTTAACTGGTNTCTGTGGGAATGTTGTCTTACGTCTCATATAGTTGTCACTGAAAAAAATAATTATGTGATAATAATGAACGTTTATGACTTCTGCTAATAGCCATTATCTACATAGGTTGGGGCTGCATTTCTTATATCTGTCGTATATTACTAACACAAACATCACAACTTCTTAATATTTCTTCTATGAGGTTTTAATGTCCTAATCTTTTATTAAAATGGCCAACAAGTTTCACTAGCTAGGATTCTAAATTTTTTGTCCCATTAATATATAATGCATTTCTGAAACCCCACTCCAGGATCCGATTAATTCACTTTTCCTATGACCTATGAGAGTCATTCATCATATATCTACAGTCTCG]
[-] EMBL CD164522             [                                                                                                                                                                                                                                                                              GTATTTCTCGAGTAAGCCAGTCACC CGAGTTTTAACTGGT TCTGTGGGAATGTTGTCTTACGTTTCATATAGTTGTTACTGAAAAAAATAATTATGTGATAATAATGAACGTTTATGACTTCTGCTAATAGCCATTATCTACATAGGTTGGGGCTGCATTTCTTATATCTGTCGTATATTACTAACACAAACATCACGACTTCTTAATATTTCTTCTATGAGGTTTTAATGTCCTAATCTTTTATTAAAATGGCCAACAAGTTTCACTAGCTAGGATTCTAAATTTTTTGTCCCATTAATAAATAATGCATTTCTGAAACCCCACTCCAGGATCCGATTAATTCACTTTTCCTATGACCTATGAGAGTCATTCATCATATATCTACAGTCTCG]




>consensus_4482#0
CCTGATGGTCCTGGATTCAATCTTCACTTGGACCGTTGGTAGACAGTGCTGAAGAGTAGC
ATACTAAAACGAAACAACTATCCACTTCTTCCCAACTCCCAGTGATTTCTTATCAAAAGT
CAATTCATTATGTAAAACTCCAAAGTCAATAATTTACAGAACATACTATAACAGTCATGT
TATTATTTGAATTTTCGAACTACATATTTTACTGCTATTATTTTGTTAATATAAAATTTT
TGACCCCATAAATTCATCTGTTTTCGCCATGTATTTCTCGAGTAAGCAGTCACCGAGTTT
AACTGGTTCTGTGGGAATGTTGTCTTACGTTTCATATAGTTGTTACTGAAAAAAATAATT
ATGTGATAATAATGAACGTTTATGACTTCTGCTAATAGCCATTATCTACATAGGTTGGGG
CTGCATTTCTTATATCTGTCGTATATTACTAACACAAACATCACAACTTCTTAATATTTC
TTCTATGAGGTTTTAATGTCCTAATCTTTTATTAAAATGGCCAACAAGTTTCACTAGCTA
GGATTCTAAATTTTTTGTCCCATTAATATATAATGCATTTCTGAAACCCCACTCCAGGAT
CCGATTAATTCACTTTTCCTATGACCTATGAGAGTCATTCATCATATATCTACAGTCTCG

clustalw multiple alignements is not computed in this case