cluster # 4634

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Schistosoma mansoni
cluster # 4634 cluster # 4634 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_4634#0 length = 617 sequences # 3

consensusID : consensus_4634#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 617
fasta sequence

                              [TACATTACCCGAACAATCTACCAAAAGTCGCTGGGTCTTGCTCTAAGAATGTAACAGTGGTTCCTAACCGACTAAACTAAATTCAGATAATAGACTATCACCTTAATCACACCTCATTAAACCATTCACAAGTCTATAATTAAAAGACTATATATTATGCTACCTTAGCACGATCAAGAATCGCGGCTATTTAAACAAACTTCTTCACTGAGCAGGCCTTACTATTAAATAATTAACTAATA-GCAATGTTTTTAATAAAC-GTTGAGTGCAATACTGAAAAAAGAAACAATCAATAATCTAACCTACTTATTCCACCATCGTTATATATCTAATTTTACTAAATGAC-ATC-CAAAACCAACAAGATTTTTCTCAATCAATCTTCTAAGCTATGTAAATAACTTTACTAACCTAAGACAATCTTAATCTCAGACCCTATCACATAATAATTACAATATCTCTGTCCTAAATAACCAACACACTCAGCTATTCCCTAAGTTCGATAAATAAAGTCACTAACCAGATATCAGATCACACGAATAATTTATCACCTACCTACATAGTGTCTCTAATTATACTTACTTAGTAACTTATCCAACCTCACCAACTAACTATAATTA]

[-] EMBL AA917158             [TACATTACCCGAACAATCTACCAAAAGTCGCTGGGTCTTGCTCTAAGAATGTAACAGTGGTTCCTAACCGACTAAACTAAATTCAGATAATAGACTATCACCTTAATCACACCTCATTAAACCATTCACAAGTCTATAATTAAAAGACTATATATTATGCTACCTTAGCACGATCAAGAATCGCGGCTATTTAAACAAACTTCTTCACTGAGCAGGCCTTACTATTAAATAATTAACTAATAGGCATTGTTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL AA883013             [                                                                                                                                                           TATGCTACCTT GCACGATCAATAATCGCGGCTATTTAAAC GGCTTCTTCACTGAGCAGGCCTTACTATTAAATAATTAACTAATA GCAATGTTTTTAATAAAC GTTGAGTGCAATACTGAAAAAAGAAACAATCAATAATCTAACCTACTTATTCCACCATCGTTATATATCTAATTTTACTAAATGACTATC CAAAACCAACAAGATTTTTCT                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL BG932318             [                                                                                                                                                                                      cCGGCTATTTAAACAAACTTCTTCACTGAGCAGGCCTTACTATTAAACAATTAACTAATA GCAATGTTTTTAATAAACAGTTGAGTGCAATACTGAAAAAAGAAACAATCAATAATCTAACCTACTTATTCCACCATCATTATATATCTAATTTTACTAAATGAC CTCTCTTAACCAACAAGATTTTTATCAATCAATCTTCTAAGCTATGTAAATAACTTTACTAACCTAAGACAATCTTAATCTCAGACCCTATCACATAATAATTACAATATCTCTGTCCTAAATAACCAACACACTCAGCTATTCCCTAAGTTCGATAAATAAAGTCACTAACCAGATATCAGATCACACGAATAATTTATCACCTACCTACATAGTGTCTCTAATTATACTTACTTAGTAACTTATCCAACCTCACCAACTAACTATAATTA]




>consensus_4634#0
TACATTACCCGAACAATCTACCAAAAGTCGCTGGGTCTTGCTCTAAGAATGTAACAGTGG
TTCCTAACCGACTAAACTAAATTCAGATAATAGACTATCACCTTAATCACACCTCATTAA
ACCATTCACAAGTCTATAATTAAAAGACTATATATTATGCTACCTTAGCACGATCAAGAA
TCGCGGCTATTTAAACAAACTTCTTCACTGAGCAGGCCTTACTATTAAATAATTAACTAA
TAGCAATGTTTTTAATAAACGTTGAGTGCAATACTGAAAAAAGAAACAATCAATAATCTA
ACCTACTTATTCCACCATCGTTATATATCTAATTTTACTAAATGACATCCAAAACCAACA
AGATTTTTCTCAATCAATCTTCTAAGCTATGTAAATAACTTTACTAACCTAAGACAATCT
TAATCTCAGACCCTATCACATAATAATTACAATATCTCTGTCCTAAATAACCAACACACT
CAGCTATTCCCTAAGTTCGATAAATAAAGTCACTAACCAGATATCAGATCACACGAATAA
TTTATCACCTACCTACATAGTGTCTCTAATTATACTTACTTAGTAACTTATCCAACCTCA
CCAACTAACTATAATTA

clustalw multiple alignements is not computed in this case