cluster # 4748

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Schistosoma mansoni
cluster # 4748 cluster # 4748 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_4748#0 length = 581 sequences # 3

consensusID : consensus_4748#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 581
fasta sequence

                              [ATGATCATAGTAACCGATTATTAGGATTTTTTTAGTGAAATGGCTTGAAAGCGTTCACAATGATACAATGGCATCTACTCTTAATCTTTCTTTAGTCTCAAAGTCCCAAAATCTCGTTTCTTTCGTTTTACACCTAATATTTTCTACTAATACTGACACTGTTACTGCTTCTACTACCATGGAAGTTCTTCTTAATAATTTTATCCCTGTGCTAATTAAATGTCGCAGCTTCAGCCGATGCACATATGTGAGTTTCTACGCTGCTGATAACTAATAAGTAACTTATGATCGACAGCCGGGAAGTAATAGCTACCTTTGACACCACCCGAAATCACCTTTCCCACAATTAAATCTCCGTTATTTCGCAGCATCTCTCCTGTGCCCGTAATTAACCCACAAGTATTTGCGGAGTAATGGCTTAGTGTTTACGGCGTCCGACTTCCTGCCATCGAGCCTAAGATTCGAACCAGGCTCCAACTAATTCTTTTTAGACGACAGGATTATATCATTAGCACTCACAAATAAAATACGGCTCATACCTAAGGACCTAGTGAGTGAGCTAATTTTTGTTTTTACTTAAT]

[+] EMBL CD178133             [ATGATCATAGTAACCGATTATTAGGATTTTTTTAGTGAAATGGCTTGAAAGCGTTCACAATGATACAATGGCATCTACTCTTAATCTTTCTTTAGTCTCAAAGTCCCAAAATCTCGTTTCTTTCGTTTTACACCTAATATTTTCTACTAATACTGACACTGTTACTGCTTCTACTACCATGGAAGTTCTTCTTAATAATTTTATCCCTGTGCTAATTAAATGTCGCAGCTTCAGCCGATGCACATATGTGAGTTTCTACGCTGCTGATAACTAATAAGTAACTTATGATCGACAGCCGGGAAGTAATAGCTACCTTTGACACCACCCGAAATCACCTTTCCCACAATTAAATCTCCGTTATTTCGCAGCATCTCTCCTGTGCCCGTAATTAACCCACAAGTATTTGCGGAGTAATGGCTTACTGTTTACGGCGTCCGACTTCCTGCCATCGAGCCTAAGATTCGAAC                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD069087             [                                                                                                                                                                                                    gagggTATCCCTGTGCTAATTAGATGTCGCAGCTTCAGCCGATGCACATATGTGAGTTTCTACGCTGCTGATAACTAATAAGTAACTTATGATCGACAGCCGGGAAGTAATAGCTACCTTTGACACCACCCGAAATCACCTTTCCCACAATTAAATCTCCGTTATTTCGCAGCATCTCTCCTGTGCCCGTAATTAACCCACAAGTATTTGCGGAGTAATGGCTTAGTGTTTACGGCGTCCGACTTCCTGCCATCGAGCCTAAGATTCGAACCAGGCTCCAACTAATTCTTTTTAGACGACAGGATTATATCATTAGCACTCACAAATAAAATACGGCTCATACCTAAGGACCTAGTGAGTGAGCTAATTTTTGTTTTTACTTAAT]
[+] EMBL CD087369             [                                                                                                                                                                                                                                                            tacCTTCGCTGTTGATAACTAATAAGTAACTTATGATCGACAGCCGGGAAGTAATAGCTACCTTTGACACCACCCGAAATCACCTTTCCCACAATTAAATCTCCGTTATTTCGCAGCATCTCTCCTGTGCCCGTAATTAACCCACAAGTATTTGCGGAGTAATGGCTTAGTGTTTACGGCGTCCGACTTCCTGCCATCGAGCCTAAGATTCGAACCAGGCTCCAACTAATTCTTTTTAGACGACAGGATTATATCATTAGCACTCACAAATAAAATACGGCTCATACCTAAG                                     ]




>consensus_4748#0
ATGATCATAGTAACCGATTATTAGGATTTTTTTAGTGAAATGGCTTGAAAGCGTTCACAA
TGATACAATGGCATCTACTCTTAATCTTTCTTTAGTCTCAAAGTCCCAAAATCTCGTTTC
TTTCGTTTTACACCTAATATTTTCTACTAATACTGACACTGTTACTGCTTCTACTACCAT
GGAAGTTCTTCTTAATAATTTTATCCCTGTGCTAATTAAATGTCGCAGCTTCAGCCGATG
CACATATGTGAGTTTCTACGCTGCTGATAACTAATAAGTAACTTATGATCGACAGCCGGG
AAGTAATAGCTACCTTTGACACCACCCGAAATCACCTTTCCCACAATTAAATCTCCGTTA
TTTCGCAGCATCTCTCCTGTGCCCGTAATTAACCCACAAGTATTTGCGGAGTAATGGCTT
AGTGTTTACGGCGTCCGACTTCCTGCCATCGAGCCTAAGATTCGAACCAGGCTCCAACTA
ATTCTTTTTAGACGACAGGATTATATCATTAGCACTCACAAATAAAATACGGCTCATACC
TAAGGACCTAGTGAGTGAGCTAATTTTTGTTTTTACTTAAT

clustalw multiple alignements is not computed in this case