Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 5181 cluster # 5181       Sequences # 3       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5181#0 length = 909 sequences # 3  
consensusID : consensus_5181#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 909
fasta sequence 
                              [AAAATTTGGTGGATCTTATTTTCAGTAAATTGGTTACGTATTATGGCTATTTGGAATTTTAACCATTTACACTGTGTGACATGTTTATAAATTATATCAACTATTAACCTTACACATCTTATCGAATAAATTTTGAGGATATGATTACTCTATTGGTTTATTGTGTGAGTGTAAATGAATATGACATTTGAACTGTAAGCATACTTTTCAGTAGAACTATTTTTGAAAACAATGAATGAAGAAGTACAACACAAATCTCCAATATACATTTTTACCAATTCCATTTTGTAAGGTCATTTTTCCCTAAGTTTGCCAAAATTCGTTATTTCATCAACCAAAGTTAATTGTGTAAATCAGTGATCATATAGAGGCCTGATCATTTCGATTTAAAGCCATTCACTTCATCGTGAATGTTATTAATACTATTTACTTTTTCAGGTAGCATTATAAATTGACTGAAAGTTTGAATTTATCACCCTGATACAAAAAGCCAAAGCCTTTTGATCACTGAACTATCGATTCACTTTTATAATTGTTAGCTGAATTTCAATGCCCTTGCANAATTTATTTATATTTTAAATTTGTCGAATTATTAGTAATTAGCAATGAAAGTTGTGGTTTATATCATGAACTAACCTTGATTAGATAATTATTAAAAACTAGGAGGTACTGGACATTTATTTCAACATTGAACTTAGTAGTGAACATTTGAGAACCCAACAGGAATTAGATCTAGGATCTTTAAGCCTTGAGGCTAGTAGTTAACCTTTAGATCACTAAGTGGAGCTACCACAGCTGACGTATCCCATGCAAGGATGGAATAGTTGTATAAAACTCTACAATTTTCAATGGCTGGTTAGTTAGAAATATTTTATAAATTAAAACATTTAACTATTTCCACAACTCAGT]

[+] EMBL AI976503             [AAAATTTGGTGGATCTTATTTTCAGTAAATTGGTTACGTATTATGGCTATTTGGAATTTTAACCATTTACACTGTGTGACATGTTTATAAATTATATCAACTATTAACCTTACACATCTTATCGAATAAATTTTGAGGATATGATTACTCTATTGGTTTATTGTGTGAGTGTAAATGAATATGACATTTGAACTGTAAGCATACTTTTCAGTAGAACTATTTTTGAAAACAATGAATGAAGAAGTACAACACAAATCTCCAATATACATTTTTACCAATTCCATTTTGTAAGGTCATTTTTCCCTAAGTTTGCCAAAATTCGTTATTTCATCAACCAAAGTTAATTGTGTAAATCAGTGATCATATAGAGGCCTGATCATTTCGATTTAAAGCCATTCACTTCATCGTGAATGTTATTAATACTATTTACTTTTTCAGGTAGCATTATAAATTGACTGAAAGTTTGAATTTATCACCCTGATACAAAAAGCCAAAGCCTTTTGATCACTGAACTATCGATTCACTTTTATAATTGTTAGCTGAATTTCAATGCCCTTGCANAATTTATTTATATTTTAAATTTGTCGAATTATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL AI975891             [AAAATTTGGTGGATCTTATTTTCAGTAAATTGGTTACGTATTATGGCTATTTGGAATTTTAACCATTTACACTGTGTGACATGTTTATAAATTATATCAACTATTAACCTTACACATCTTATCGAATAAATTTTGAGGATATGATTACTCTATTGGTTTATTGTGTGAGTGTAAATGAATATGACATTTGAACTGTAAGCATACTTTTCAGTAGAACTATTTTTGAAAACAATGAATGAAGAAGTACAACACAAATCTCCAATATACATTTTTACCAATTCCATTTTGTAAGGTCATTTTTCCCTAAGTTTGCCAAAATTCGTTATTTCATCAACCAAAGTTAATTGTGTAAATCAGTGATCATATAGAGGCCTGATCATTTCGATTTAAAGCCATTCACTTCATCGTGAATGTTATTAATACTATTTACTTTTTCAGGTAGCATTATAAATTGACTGAAAGTTTGAATTTATCACCCTGATACAAAAAGCCAAAGCCTTTTGATCACTGAACTATCGATTCACTTTTATAATTGTTAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL AI976526             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TTCATCAACCAAAGTTAATTGTGTAAATCAGTGATCATATAGAGGCCTGATCATTTCGATTTAAAGCCATTCACTTCATCGTGAATGTTATTAATACTATTTACTTTTTCAGGTAGCATTATAAATTGACTGAAAGTTTGAATTTATCACCCTGATACAAAAAGCCAAAGCCTTTTGATCACTGAACTATCGATTCACTTTTATAATTGTTAGCTGAATTTCAATGCCCTTGCAAAATTTATTTATATTTTAAATTTGTCGAATAATTAGTAATTAGCAATGAAAGTTGTGGTTTATATCATGAACTAACCTTGATTAGATAATTATTAAAAACTAGGAGGTACTGGACATTTATTTCAACATTGAACTTAGTAGTGAACATTTGAGAACCCAACAGGAATTAGATCTAGGATCTTTAAGCCTTGAGGCTAGTAGTTAACCTTTAGATCACTAAGTGGAGCTACCACAGCTGACGTATCCCATGCAAGGATGGAATAGTTGTATAAAACTCTACAATTTTCAATGGCTGGTTAGTTAGAAATATTTTATAAATTAAAACATTTAACTATTTCCACAACTCAGT]




>consensus_5181#0
AAAATTTGGTGGATCTTATTTTCAGTAAATTGGTTACGTATTATGGCTATTTGGAATTTT
AACCATTTACACTGTGTGACATGTTTATAAATTATATCAACTATTAACCTTACACATCTT
ATCGAATAAATTTTGAGGATATGATTACTCTATTGGTTTATTGTGTGAGTGTAAATGAAT
ATGACATTTGAACTGTAAGCATACTTTTCAGTAGAACTATTTTTGAAAACAATGAATGAA
GAAGTACAACACAAATCTCCAATATACATTTTTACCAATTCCATTTTGTAAGGTCATTTT
TCCCTAAGTTTGCCAAAATTCGTTATTTCATCAACCAAAGTTAATTGTGTAAATCAGTGA
TCATATAGAGGCCTGATCATTTCGATTTAAAGCCATTCACTTCATCGTGAATGTTATTAA
TACTATTTACTTTTTCAGGTAGCATTATAAATTGACTGAAAGTTTGAATTTATCACCCTG
ATACAAAAAGCCAAAGCCTTTTGATCACTGAACTATCGATTCACTTTTATAATTGTTAGC
TGAATTTCAATGCCCTTGCANAATTTATTTATATTTTAAATTTGTCGAATTATTAGTAAT
TAGCAATGAAAGTTGTGGTTTATATCATGAACTAACCTTGATTAGATAATTATTAAAAAC
TAGGAGGTACTGGACATTTATTTCAACATTGAACTTAGTAGTGAACATTTGAGAACCCAA
CAGGAATTAGATCTAGGATCTTTAAGCCTTGAGGCTAGTAGTTAACCTTTAGATCACTAA
GTGGAGCTACCACAGCTGACGTATCCCATGCAAGGATGGAATAGTTGTATAAAACTCTAC
AATTTTCAATGGCTGGTTAGTTAGAAATATTTTATAAATTAAAACATTTAACTATTTCCA
CAACTCAGT

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)