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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_5262#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 3 consensus length = 861 fasta sequence
[ATAACAATATATTATTTATCTTATTCAAATGATGACAAATAAATATAACCAACGAGTCAGATATATTTTTAAATTTTAAGCGCTACACCATGGATTAAGAATAAAAGATAAACTGAATATCAACATGAAATAAGTTTGTGAGATTGTTTAGTTCACTATTCATTTGAACTCAATTCATCTTGAATGAAAAGCTTAATGTGTAACAACAAGGAATAGGAAGTTGATGCTTAGAATGATTAATAATATGTGATAACTTTGTGTTGTTAAAATACAAAAGTTTATCAACGTTGTTTTTATGTCCAACAAAGTTCATACAACAATATTACTGTTATTATTATAGTTTAGATATTTCTGTGCTATTAATAACATCATTTTGTCAACAATCAGTTGATCTATTATTATCATTATTACTATTACTATCACTACTTTTATTAAAATTTGTCTCTACGTTATTTTTTAAGTGTACAATTCTTCCATGTTTTCAGTGAATCTCATTTGTTTACTGGAAAATTTCACCACTTAACTTTGACTGATTCCTCTGCAGACGTAGATCCATGTCTACGTTGGAATAATTTGGTCGAATTCGATGATGTGTGATCATCGCTAAATGATGCAGCTTTTATTGGAATGTATGAATTTCGCTTCATATTCATAATAGATAAATGTTGTTTATAGAAATGTTGAGTGGTTAGTAATTTTCGGGATGTTTTTTCAATCACCGACCACGAATAATCAATATCTTCAATACAAGCCTTTTCATGATTTATAGAAAATCGAATAAAATAGATATCTCTGGCCATCGAAGGTACAATATGAATTTCCCGGTTCGTATTAATAAGATGAACTAAACATTGAGTCAAT]
[+] EMBL CD073148 [ATAACAATATATTATTTATCTTATTCAAATGATGACAAATAAATATAACCAACGAGTCAGATATATTTTTAAATTTTAAGCGCTACACCATGGATTAAGAATAAAAGATAAACTGAATATCAACATGAAATAAGTTTGTGAGATTGTTTAGTTCACTATTCATTTGAACTCAATTCATCTTGAATGAAAAGCTTAATGTGTAACAACAAGGAATAGGAAGTTGATGCTTAGAATGATTAATAATATGTGATAACTTTGTGTTGTTAAAATACAAAAGTTTATCAACGTTGTTTTTATGTCCAACAAAGTTCATACAACAATATTACTGTTATTATTATAGTTTAGATATTTCTGTGCTATTAATAACATCATTTTGTCAACAATCAGTTGATCTATTATTATCATTATTACTATTACTATCACTACTTTTATTAAAATTTGTCTCTACGTTATTTTTTAAGTGTACAATTCTTCCATGTTTTCAGTGAATCTCATTTGTTTACTGGAAAATTTCACCACTTAACTTTGACTGATTCCTCTGCAGACGTAGATCCATGTCTACGTTGGAATAATTTGGTCGAATTCGATGATGTGTGATCATCGCTAAATGATGCAGC ]
[+] EMBL SMW786 [ ATATATTATTTATCTTATTCAAATGATGACAAATAAATATAACCAACGAGTCAGATATATTTTTAAATTTTAAGCGCTACACCATGGATTAAGAATAAAAGATAAACTGAATATCAACATGAAATAAGTTTGTGAGATTGTTTAGTTCACTATTCATTTGAACTCAATTCATCTTGAATGAAAAGCTTAATGTGTAACAACAAGGAATAGGAAGTTGATGCTTAGAATGATTAATAATATGTGATAACTTTGTGTTGTTAAAATACAAAAGTTTATCAACGTTGTTTTTATGTCCAACAAAGTTCATACAACAATATTACTGTTATTATTATAGTTTAGATATTTCTGTGCTATTAATAACATCATTT ]
[-] EMBL CD078685 [ AATACAAAAGTTTATCANCGTTGTTTTTATGTCCAACAAAGTTCATACAACAATATTACTGTTATTATTATAGTTTAGATATTTCTGTGCTATTAATAACATCATTTTGTCAACAATCAGTTGATCTATTATTATCATTATTACTATTACTATCACTACTTTTATTAAAATTTGTCTCTACGTTATTTTTTAAGTGTACAATTCTTCCATGTTTTCAGTGAATCTCATTTGTTTACTGGAAAATTTCACCACTTAACTTTGACTGATTCCTCTGCAGACGTAGATCCATGTCTACGTTGGAATAATTTGGTCGAATTCGATGATGTGTGATCATCGCTAAATGATGCAGCTTTTATTGGAATGTATGAATTTCGCTTCATATTCATAATAGATAAATGTTGTTTATAGAAATGTTGAGTGGTTAGTAATTTTCGGGATGTTTTTTCAATCACCGACCACGAATAATCAATATCTTCAATACAAGCCTTTTCATGATTTATAGAAAATCGAATAAAATAGATATCTCTGGCCATCGAAGGTACAATATGAATTTCCCGGTTCGTATTAATAAGATGAACTAAACATTGAGTCAAT]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||