cluster # 5291

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 5291 cluster # 5291 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_5291#0 length = 568 sequences # 3

consensusID : consensus_5291#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 568
fasta sequence

                              [TTTCGGGCGACTTAAGTGCATTGGCCTTGTTCTGGTAAT-CAAGAATGTAAAGGATACTTCATTTATCCACA-GGGAAGAAATGCTCATCAGCTAGGATGTAATTATGCATTAAAACATCGAATAAGAA-GATGGACAGTTGGACTTAAAAAAAAATGTGGATTCATTCGAGAAAGGAATTATTTTATGAATGATGATGAAATAGG-TTGTGTTAAACTATCACGTAT-GGGTGTTATAACATACTGTAGGAAATTAGATTGAAGTCCATTTTGTTTTTAACGTACCACCGAACACAATATTAATTAGTTTAGTTGTTTTTTTACAGTTTTCAAGCTGTCACCTAAAAAAAATAGTCTTTAATAAAATGATAAATTAAAGACTTTTCAATAATCTCTTTCTTATGGATAAAAAATTGATCAGTATATGACCAAAGAGTGAGATCAAAAATATTGATTATCCAGTGGATATATATATCTATATACATATATATTACAAAACGATGTTACTCTGTACATTTAGACTAATGGTAAGTCACATTAAGGTGTTTGAAATCTACTATTCATTACTAAGT]

[+] EMBL AW063004             [TTTCGGGCGACTTAAGTGCATTGGCCTTGTTCTGGTAAT CCAGAATGTAAAGGATACTTCATTTATCCACAGGGGAAGAAATGCTCATCAGCTAGGATGTAATTATGCATTAAAACATCGAATAAGAAGGATGGACAGTTGGACTT AAAAAAAATGTGGATTCATTCGAGAAAGGAATTATTTTATGAATGATGATGAAATAGGTTTGTGTTAAACTATCACGTATGGGGTGTTATAACATACTGTAGGAAATTAGATTGAAGTCCATTTTGTTTTTAACGTACCACCGAACACAATATTAATTAGTTTAGTTGTTTTTTTACAGTTTTCAAGCTGTCACCTAAAAAAAATAGTCTTTAATAAAATGATAAATTAAAGACTTTTCAATAATCTCTTTCTTATGGATAAAAAATTGATCAGTATATGACCAAAGAGTGAGATCAAAAATATTGATTATCCAGTGGATATATATATCTATATACATATATATTACAAAACGATGTTACTCTGTACATTTAGACTAATGGTAAGTCACATTAAGGTGTTTGAAATCTACTATTCATTACTAAGT]
[+] EMBL AI820453             [                           TGTTCTGGTAATGCAAGAATGTAAAGGATACTTCATTTATCCACA GGGAAGAAATGCTCATCAGCTAGGATGTAATTATGCATTAAAACATCGAATAAGAA GATGGACAGTTGGACTTAAAAAAAAATGTGGATTCATTCGAGAAAGGAATTATTTTATGAATGATGATGAAATAGG TTGTGTTAAACTATCACGTAT GGGTGTTATAACATACTGTAGGAAATTAGATTGAAGTCCATTTTGTTTTTAACGTACCACCGAACACAATATTAATTAGTTTAGTTGTTTTTTTTCAGTTTTCAAGCTGTCACCTAAAAAAAATAGTCTTTAATAAAATGATAAATTAAAG                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL AI882640             [                           TGTTCTGGTAAT NNAGAATGTAAAGGATACTTCATTTATCCACA GGGAAGAAATGCTCATCAGCTAGGATGTAATTATGCATTAAAACATCGAATAAGAA GATGGACAGTTGGACTTAAAAAAAAATGTGGATTCATTCGAGAAAGGAATTATTTTATGAATGATGATGAAATAGG TTGTGTTAAACTATCACGTAT GGGTGTTATAACATACTGTAGGAAATTAGATTGAAGTCCATTTTGTTTTTAACGTACCACCGACCACAATATTAATTAGTTTAGTTGTTTTTTT CAG TTTCCAGCTGTCA CT AAAAAAATAGTCTTTAAT AAATGAT AATTAAA                                                                                                                                                                                                  ]




>consensus_5291#0
TTTCGGGCGACTTAAGTGCATTGGCCTTGTTCTGGTAATCAAGAATGTAAAGGATACTTC
ATTTATCCACAGGGAAGAAATGCTCATCAGCTAGGATGTAATTATGCATTAAAACATCGA
ATAAGAAGATGGACAGTTGGACTTAAAAAAAAATGTGGATTCATTCGAGAAAGGAATTAT
TTTATGAATGATGATGAAATAGGTTGTGTTAAACTATCACGTATGGGTGTTATAACATAC
TGTAGGAAATTAGATTGAAGTCCATTTTGTTTTTAACGTACCACCGAACACAATATTAAT
TAGTTTAGTTGTTTTTTTACAGTTTTCAAGCTGTCACCTAAAAAAAATAGTCTTTAATAA
AATGATAAATTAAAGACTTTTCAATAATCTCTTTCTTATGGATAAAAAATTGATCAGTAT
ATGACCAAAGAGTGAGATCAAAAATATTGATTATCCAGTGGATATATATATCTATATACA
TATATATTACAAAACGATGTTACTCTGTACATTTAGACTAATGGTAAGTCACATTAAGGT
GTTTGAAATCTACTATTCATTACTAAGT

clustalw multiple alignements is not computed in this case