cluster # 5335

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Schistosoma mansoni
cluster # 5335 cluster # 5335 Sequences # 3 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5335#0 length = 1361 sequences # 3
consensusID : consensus_5335#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1361
fasta sequence
                              [TGAAAATGTTTGTTTTCGTTTTTTTTTGTTAAAAATAAGGTTTCATATGATCACAGACAAGCATTCTGTTCCCCACCACTCCCCTCCCCCCTACACACCAGAAAATACTATTACATATTTGATAATAGTAATAATTATTATTGTTATATAACCTAGTATCTAGATCAGTTGTCAAGATGTGTAGAAAGAAAACAAAGATAAATAAGTCATTCAAATAAATGCAATACTGAGCAAAATCTAGAACTGAGAGAGACAGAGAGCCGCGGCGGGGTGTGTGTGGAAAGCANAAAACTAAAGTGAGTACGAATTGGTGATGATCAAGAAGAGAGGTGAATGATTTATTATAATTGTTTCATTGATACATAAGAAATTAAATGCTCCGGTAATGGTAAACGATTTGCTTTAACTCTTAATGAATCAGCATAACCAAGTGCACGTTGTATAACTACACGACAAATATGTTTTAATGAATGTACATTACATTCTTCCCAACGTAACCATTGTGCTAATTCATCATCACCATGTATACATTCTTCTGGAATTATTCCATGTACTAAAAGCCAACGTGTAAAACTTGCTAAATTCACTGGATCACATCCATAATTTAATAATAACTNTACCATAGGTATATCTAATTTAGGAAATTTAACTGCCATATGTAAAGGACCAAGACCTTCACGATCTACACGATTAACTGATGCACCAGCGTCTAATAGTTTACGTGCTAATGCTAAATGTCCATGTAATACGGCAACATAAAGTGGAGTTTTACCATTTTTATCAGCTGCATTAACATTAGCACCGGCTGTTAGTAGAAGATCAACAATTTCCGATCGTCCATGATAAGTAGCAACATGGAGTGGAGTTTTTCTATGTGAATCCATTTGATCGACCTGTGCACCATGACGTAATAGGGCATTGGTTATTTCCAAATAACCAAAATAAGCACTAATATATAAAGGTGACTTATTCTCTTTGTTAGTAATATGTATATCAGCTGAATGACATAGTAAATAATTTACAACTTCACTATGTCCACGACATGCAGCTAAATAAATTAAAGTTCGACCATATNTATCTTGAGTATTTAATAATTCAGGATTTGAAAGACGACTTGTAGTTAGTGGTTGTGGTGCTGATCCTAACATTGACAATTGGACATTCATGTTACTATTACTACTGTTATTAGGACATATTGATCCTGATGCATTTAACGATGATATAATCGATGTAGAAAGAAGACATGACAACCGAGCATTGGAACCATTCAATAGACTGTTAGTTTTTGAAATTGATGCAGACGTAGTGGCCATCGTCGTCGCCGTAGTAGTACAAATAGTTGTTGTTGTTGTCGTCATAGT]

[+] EMBL CD073300             [TGAAAATGTTTGTTTTCGTTTTTTTTTGTTAAAAATAAGGTTTCATATGATCACAGACAAGCATTCTGTTCCCCACCACTCCCCTCCCCCCTACACACCAGAAAATACTATTACATATTTGATAATAGTAATAATTATTATTGTTATATAACCTAGTATCTAGATCAGTTGTCAAGATGTGTAGAAAGAAAACAAAGATAAATAAGTCATTCAAATAAATGCAATACTGAGCAAAATCTAGAACTGAGAGAGACAGAGAGCCGCGGCGGGGTGTGTGTGGAAAGCANAAAACTAAAGTGAGTACGAATTGGTGATGATCAAGAAGAGAGGTGAATGATTTATTATAATTGTTTCATTGATACATAAGAAATTAAATGCTCCGGTAATGGTAAACGATTTGCTTTAACTCTTAATGAATCAGCATAACCAAGTGCACGTTGTATAACTACACGACAAATATGTTTTAATGAATGTACATTACATTCTTCCCAACGTAACCATTGTGCTAATTCATCATCACCATGTATACATTCTTCTGGAATTATTCCATGTACTAAAAGCCAACGTGTAAAACTTGCTAAATTCACTGGATCACATCCATAATTTAATAATAACTN                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD115531             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         actggcACGTTCTTCTGGAATTATTCCATGTACTAGAAGCCAACGTGTAAAACTTGCTAAATTCACTGGATCACATCCATAATTTAATAATAACTTTACCATAGGTATATCTAATTTAGGAAATTTAACTGCCATATGTAAAGGACCAAGACCTTCACGATCTACACGATTAACTGATGCACCAGCGTCTAATAGTTTACGTGCTAATGCTAAATGTCCATGTAATACGGCAACATAAAGTGGAGTTTTACCATTTTTATCAGCTGCATTAACATTAGCACCGGCTGTTAGTAGAAGATCAACAATTTCCGATCGTCCATGATAAGTAGCAACATGGAGTGGAGTTTTTCTATGTGAATCCATTTGATCGACCTGTGCACCATGACGTAATAGGGCATTGGTTATTTCCAAATAACCAAAATAAGCACTAATATATAAAGGTGACTTATTCTCTTTGTTAGTAATATGTATATCAGCTGAATGACATAGTAAATAATTTACAACTTCACTATGTCCACGACATGCAGCTAAATAAATTAAAGTTCGACCATATNTATCTTGAGTATTTAATAATTCAGGATTTGAAAGACGACTTGTA                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD078840             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TAAAGTGGAGTTTTACCATTTTTATCAGCTGCATTANCATTAGCACCGGCTGTTAGTAGAAGATCAACAATTTCCGATCGTCCATGATAAGTAGCAACATAGAGTGGAGTTTTTCTATGTGAATCCATTTGATCGACCTGTGCACCATGACGTAATAGGGCATTGGTTATTTCCAAATAACCAAAATAAGCACTAATATATAAAGGTGACTTATTTTCTTTGTTAGTAATATGTATATCAGCTGAATGACATAGTAAATAATTTACAACTTCACTATGTCCACGACATGCAGCTAAATAAATTAAAGTTCGACCATATTTATCTTGAGTATTTAATAATTCAGGATTTGAAAGACGACTTGTAGTTAGTGGTTGTGGTGCTGATCCTAACATTGACAATTGGACATTCATGTTACTATTACTACTGTTATTAGGACATATTGATCCTGATGCATTTAACGATGATATAATCGATGTAGAAAGAAGACATGACAACCGAGCATTGGAACCATTCAATAGACTGTTAGTTTTTGAAATTGATGCAGACGTAGTGGCCATCGTCGTCGCCGTAGTAGTACAAATAGTTGTTGTTGTTGTCGTCATAGT]




>consensus_5335#0
TGAAAATGTTTGTTTTCGTTTTTTTTTGTTAAAAATAAGGTTTCATATGATCACAGACAA
GCATTCTGTTCCCCACCACTCCCCTCCCCCCTACACACCAGAAAATACTATTACATATTT
GATAATAGTAATAATTATTATTGTTATATAACCTAGTATCTAGATCAGTTGTCAAGATGT
GTAGAAAGAAAACAAAGATAAATAAGTCATTCAAATAAATGCAATACTGAGCAAAATCTA
GAACTGAGAGAGACAGAGAGCCGCGGCGGGGTGTGTGTGGAAAGCANAAAACTAAAGTGA
GTACGAATTGGTGATGATCAAGAAGAGAGGTGAATGATTTATTATAATTGTTTCATTGAT
ACATAAGAAATTAAATGCTCCGGTAATGGTAAACGATTTGCTTTAACTCTTAATGAATCA
GCATAACCAAGTGCACGTTGTATAACTACACGACAAATATGTTTTAATGAATGTACATTA
CATTCTTCCCAACGTAACCATTGTGCTAATTCATCATCACCATGTATACATTCTTCTGGA
ATTATTCCATGTACTAAAAGCCAACGTGTAAAACTTGCTAAATTCACTGGATCACATCCA
TAATTTAATAATAACTNTACCATAGGTATATCTAATTTAGGAAATTTAACTGCCATATGT
AAAGGACCAAGACCTTCACGATCTACACGATTAACTGATGCACCAGCGTCTAATAGTTTA
CGTGCTAATGCTAAATGTCCATGTAATACGGCAACATAAAGTGGAGTTTTACCATTTTTA
TCAGCTGCATTAACATTAGCACCGGCTGTTAGTAGAAGATCAACAATTTCCGATCGTCCA
TGATAAGTAGCAACATGGAGTGGAGTTTTTCTATGTGAATCCATTTGATCGACCTGTGCA
CCATGACGTAATAGGGCATTGGTTATTTCCAAATAACCAAAATAAGCACTAATATATAAA
GGTGACTTATTCTCTTTGTTAGTAATATGTATATCAGCTGAATGACATAGTAAATAATTT
ACAACTTCACTATGTCCACGACATGCAGCTAAATAAATTAAAGTTCGACCATATNTATCT
TGAGTATTTAATAATTCAGGATTTGAAAGACGACTTGTAGTTAGTGGTTGTGGTGCTGAT
CCTAACATTGACAATTGGACATTCATGTTACTATTACTACTGTTATTAGGACATATTGAT
CCTGATGCATTTAACGATGATATAATCGATGTAGAAAGAAGACATGACAACCGAGCATTG
GAACCATTCAATAGACTGTTAGTTTTTGAAATTGATGCAGACGTAGTGGCCATCGTCGTC
GCCGTAGTAGTACAAATAGTTGTTGTTGTTGTCGTCATAGT
clustalw multiple alignements is not computed in this case