cluster # 5374

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Schistosoma mansoni
cluster # 5374 cluster # 5374 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_5374#0 length = 586 sequences # 3

consensusID : consensus_5374#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 586
fasta sequence

                              [AAGGCAGTTTGTATAGATTTATAGGAATCAATCTCAGACGTTTTAAATTATTTTTATTTAATGGGTTACGTTTACTGAAAACCAGCAATAATTAACTAAATTTTCATGTTTGACTGAAAGGATATATGGGCTAAATTGTAATGATTGTTAAGGTAAGGAATATTAACATTATCACGCTCAAGTTTTTATTTGTATACGGCATATTATATTTTAGCTAGTGTGTAGTTTGTTTTAGACATGCCTTTATCAACGCGACTATAAGCGTTTTTCAGCTTAAAAGTAATCACAATCTTTTTAAATATTATTAGCTGTCTCCGCTGTGTGGTCATGCTGGGGTCCATTTATTACGCACTATTTTATGGATGTATTTTGTACCACAAAACGGCGAAATATGATTTTTCTAGATGATGTTGAAAGACTTTATTTTCAAGTTTTATGTTATATAGCTACTTTGATCATTTTGCGTAAATGTTATGTCCAGTCGCTTGTCTTTTTCGTAATGTCTTTACATATTCCATTACCTAGGACAGAATTTGTTGTACTGATTGATTAAGATGAGTTGTTCAAATATCTCGGAACCAATACT]

[+] EMBL CD157042             [AAGGCAGTTTGTATAGATTTATAGGAATCAATCTCAGACGTTTTAAATTATTTTTATTTAATGGGTTACGTTTACTGAAAACCAGCAATAATTAACTAAATTTTCATGTTTGACTGAAAGGATATATGGGCTAAATTGTAATGATTGTTAAGGTAAGGAATATTAACATTATCACGCTCAAGTTTTTATTTGTATACGGCATATTATATTTTAGCTAGTGTGTAGTTTGTTTTAGACATGCCTTTATCAACGCGACTATAAGCGTTTTTCAGCTTAAAAGTAATCACAATCTTTTTAAATATTATTAGCTGTCTCCGCTGTGTGGTCATGCTGGGGTCCATTTATTACGCACTATTTTATGGATGTATTTTGTACCACAAAACGGCGAAATATGATTTTTCTAGATGATGTTGAAAGACTTTATTTTCAAGTTTTATGTTATATAGCTACTTTGATCATTTTGCGTANATGTTATGTCCAGTCGCTTGTCTTTTTCGTAATGTCTTTACATATTCCATTACCTAGGACAGAATTTGTTGTACTGATTGATTAAGATGAGTTGTTCAAATATCTCGGAACCAATACT]
[+] EMBL CD156871             [AAGGCAGTTTGTATAGATTTATAGGAATCAATCTCAGACGTTTTAAATTATTTTTATTTAATGGGTTACGTTTACTGAAAACCAGCAATAATTAACTAAATTTTCATGTTTGACTGAAAGGATATATGGGCTAAATTGTAATGATTGTTAAGGTAAGGAATATTAACATTATCACGCTCAAGTTTTTATTTGTATACGGCATATTATATTTTAGCTAGTGTGTAGTTTGTTTTAGACATGCCTTTATCAACGCGACTATAAGCGTTTTTCAGCTTAAAAGTAATCACAATCTTTTTAAATATTATTAGCTGTCTCCGCTGTGTGGTCATGCTGGGGTCCATTTATTACGCACTATTTTATGGATGTATTTTGTACCACAAAACGGCGAAATATGATTTTTCTAGATGATGTTGAAAGACTTTATTTTCAAGTTTTATGTTATATAGCTACTTTGATCATTTTGCGTAAATGTTATGTCCAGTCGCTTGTCTTTTTCGTAATGTCTTTACATATTCCATTACCTANGACAGAATTTGTTGTACTGATTGATTAAGATGAGTTGTT AAATATCTCGGAA CAATAC ]
[+] EMBL CD156889             [AAGGCAGTTTGTATAGATTTATAGGAATCAATCTCCGACGTTTTAAATTATTTTTATTTAATGGGTTACGTTTACTGAAAACCAGCAATAATTAACTAAATTTTCATGTTAGACTGAAAGGATATATGGGCTAAATTGTAATGATTGTTAAGGTAAGGAATATTAACATTATCACGCTCAAGTTTTTATTTGTATACGGCATATTATATTTTAGCTAGTGTGTAGTTTGTTTTAGACATGCCTTTATCAACGCGACTATAAGCGTTTTTCAGCTTAAAAGTAATCACAATCTTTTTAAATATTATTAGCTGTCTCCGCTGTGTGGTCATGCTGGGGTCCATTTATTACGCACTATTTTATGGATGTATTTTGTACCACAAAACGGCGAAATATGATTTTTCTAGATGATGTTGAAAGACTTTATTTTCAAGTTTTATGTTATATAGCTACTTTGATCATTTTGCGTAAATGTTATGTCCAGTCGCTTGTCTTTTTCGTAATGTCTTTACATATTCCATTACCTAGGACAGAATTTGTTGTACTGATTGATTAAGATGAGTTGTT                      ]




>consensus_5374#0
AAGGCAGTTTGTATAGATTTATAGGAATCAATCTCAGACGTTTTAAATTATTTTTATTTA
ATGGGTTACGTTTACTGAAAACCAGCAATAATTAACTAAATTTTCATGTTTGACTGAAAG
GATATATGGGCTAAATTGTAATGATTGTTAAGGTAAGGAATATTAACATTATCACGCTCA
AGTTTTTATTTGTATACGGCATATTATATTTTAGCTAGTGTGTAGTTTGTTTTAGACATG
CCTTTATCAACGCGACTATAAGCGTTTTTCAGCTTAAAAGTAATCACAATCTTTTTAAAT
ATTATTAGCTGTCTCCGCTGTGTGGTCATGCTGGGGTCCATTTATTACGCACTATTTTAT
GGATGTATTTTGTACCACAAAACGGCGAAATATGATTTTTCTAGATGATGTTGAAAGACT
TTATTTTCAAGTTTTATGTTATATAGCTACTTTGATCATTTTGCGTAAATGTTATGTCCA
GTCGCTTGTCTTTTTCGTAATGTCTTTACATATTCCATTACCTAGGACAGAATTTGTTGT
ACTGATTGATTAAGATGAGTTGTTCAAATATCTCGGAACCAATACT

clustalw multiple alignements is not computed in this case