cluster # 5485

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Schistosoma mansoni
cluster # 5485 cluster # 5485 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_5485#0 length = 614 sequences # 3

consensusID : consensus_5485#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 614
fasta sequence

                              [GTTTAATTACAGGTCTAGATAATCGATTAGTTGTAACCTGTAAATATGCATTTGGTCCTCTTCCAGCTCTTGATACAGCTGACAGCGCAAATCGGTAGTAATAACCTGGAATAAGATTTGGTAATCTCAGCACTCTGCGACCAGGAAGATAAGCGGAAGGCCCATGGAAAGCACCACGTGGATGAGTTTGGATCCTTAATTCATAATGAGTTAGTGGCAAACCACCTGTCTCATTTGGAGGTTCAACACACAATTCAATTAAAGTTGCTTCAACTCTACAAGCTCTTAAAGCTGGTCTACCAGGATGGCTAGCTAGCTGCAGTCGAACATGCCCAGTAGCATGGCCTAATCTATTAGTTGCAGTACATGAATAAGTACCAAATACCCCGACATTCCAATAACCCGCGGGAACAGTTAATTCAGTTACAGAGTATTCACCGTCTTGATAGTCCATTTTGATATAACCTTTCGGATCATTTAGTTCACCTAATGGTACACTTGGTCCACTTTGTGGTCCCACCCATTTCCATTGAGGTGTTGGTTGTCCTAGTGCTTGACAAGCTATTTTAGAAGGTAAATGAGATAAACCATANNACACATATTTGCCAGGTTGA]

[+] EMBL CD123474             [GTTTAATTACAGGTCTAGATAATCGATTAGTTGTAACCTGTAAATATGCATTTGGTCCTCTTCCAGCTCTTGATACAGCTGACAGCGCAAATCGGTAGTAATAACCTGGAATAAGATTTGGTAATCTCAGCACTCTGCGACCAGGAAGATAAGCGGAAGGCCCATGGAAAGCACCACGTGGATGAGTTTGGATCCTTAATTCATAATGAGTTAGTGGCAAACCACCTGTCTCATTTGGAGGTTCAACACACAATTCAATTAAAGTTGCTTCAACTCTACAAGCTCTTAAAGCTGGTCTACCAGGATGGCTAGCTAGCTGCAGTCGAACATGCCCAGTAGCATGGCCTAATCTATTAGTTGCAGTACATGAATAAGTACCAAATACCCCGACATTCCAATAACCCGCGGGAACAGTTAATTCAGTTACAGAGTATTCACCGTCTTGATAGTCCATTTTGATATAACCTTTCGGATCATTTAGTTCACCTAATGGTACACTTGGTCCACTTTGTGGTCCCACCCATTTCCATTGAGGTGTTGGTTGTCCTAGTGCTTGACAAGCTATTTTAGAAGGTAAATGAGATAAACCATANNACACATATTTGCCAGGTTGA]
[+] EMBL CD123461             [GTTTAATTACAGGTCTAGATAATCGATTAGTTGTAACCTGTAAATATGCATTTGGTCCTCTTCCAGCTCTTGATACAGCTGACAGCGCAAATCGGTAGTAATAACCTGGAATAAGATTTGGTAATCTCAGCACCCTGCGACCAGGAAGATAAGCGAAAGGCCCATGGAAAGCACCACGTGGATGAGTTTGGATCCTTAATTCATAATGAGTTAGTGGCAAACCACCTGTCTCATTTGGAGGTTCAACACACAATTCAATTAAAGTTGCTTCAACTCTACAAGCTCTTAAAGCTGGTCTACCAGGATGGCTAGCTAGCTGCAGTCGAACATGCCCAGTAGCATGGCCTAATCTATTAGTTGCAGTACATGAATAAGTACCAAATACCCCGACATTCCAATAACCCGCGGGAACAGTTAATTCAGTTACAGAGTATTCACCGTCTTGATAGTCCATTTTGATATAACCTTTCGGATCATTTAGTTCACCTAATGGTACACTTGGTCCACTTTGTGGTCCCACCCATTTCCATTGAGGTGTTGGTTGTCCTAGTGCTTGACAAGCTA TTTAGAAGGTAAATGAGATAAACCATAaacaac                ]
[-] EMBL CD169747             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ACATGAATAAGTACCAAATACCCCGACATTCCAATAACCCGCGGGAACAGTTAATTCAGTTACAGAGTATTCACCGTCTTGATAGTCCATTTTGATATAACCTTTCGGATCATTTAGTTCACCTAATGGTACACTTGGTCCACTTTGTG                                                                                                     ]




>consensus_5485#0
GTTTAATTACAGGTCTAGATAATCGATTAGTTGTAACCTGTAAATATGCATTTGGTCCTC
TTCCAGCTCTTGATACAGCTGACAGCGCAAATCGGTAGTAATAACCTGGAATAAGATTTG
GTAATCTCAGCACTCTGCGACCAGGAAGATAAGCGGAAGGCCCATGGAAAGCACCACGTG
GATGAGTTTGGATCCTTAATTCATAATGAGTTAGTGGCAAACCACCTGTCTCATTTGGAG
GTTCAACACACAATTCAATTAAAGTTGCTTCAACTCTACAAGCTCTTAAAGCTGGTCTAC
CAGGATGGCTAGCTAGCTGCAGTCGAACATGCCCAGTAGCATGGCCTAATCTATTAGTTG
CAGTACATGAATAAGTACCAAATACCCCGACATTCCAATAACCCGCGGGAACAGTTAATT
CAGTTACAGAGTATTCACCGTCTTGATAGTCCATTTTGATATAACCTTTCGGATCATTTA
GTTCACCTAATGGTACACTTGGTCCACTTTGTGGTCCCACCCATTTCCATTGAGGTGTTG
GTTGTCCTAGTGCTTGACAAGCTATTTTAGAAGGTAAATGAGATAAACCATANNACACAT
ATTTGCCAGGTTGA

clustalw multiple alignements is not computed in this case