cluster # 5727

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Schistosoma mansoni
cluster # 5727 cluster # 5727 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_5727#0 length = 557 sequences # 3

consensusID : consensus_5727#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 557
fasta sequence

                              [TTGTTATTGGTCCTTCAAGTTGTTGGCTTACTGTTGTTGACTTATTGCTGTAGTGATTGTTATTAACTCGATACCGACAAGCTCCAGTCACTTTCGGAACATCACCACTATTCGGTAACAGGTATAACTTTTCATAACCATATGGATACTGTGTATGCATCGGTGGTTGACGAGGTTTCACTGGTGTGAAAATACGTGAGTTTCCAGGATTTTTAGAATTTTCAGTTTGTTTCTCTAATGATGGTGGATCATTTCTTAATTTACATTTCATTGCAGAAACTACTACATTATTCTCTATATTTTGTTGTTGTACATGAACATGCAACTCTTTCTGTGTTTGATCATTAGTTTCACTTGGTACTACATCTTGACAAGTTATATTTAACAATTTAGTAGATTCAGTTACCTTTTCAGTAGTTACCATACTGTTATGATTATTATTTTTCAATTTAAATGATGTCTGTTTATTTTCTACTACTACTCCCGGTGATAACTGATGACATGAATTAGTAGTATTATTCTCATTATTTGTATCTATGTTTACTTGTTCATGAGTT]

[+] EMBL CD124853             [TTGTTATTGGTCCTTCAAGTTGTTGGCTTACTGTTGTTGACTTATTGCTGTAGTGATTGTTATTAACTCGATACCGACAAGCTCCAGTCACTTTCGGAACATCACC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL SMRAP012             [ TGTTATTGGTCCTTCAAGTTGTTGGCTTACNGTTGTTNACTTATTGCTGTAGTGATTGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD096848             [                       TGGCTTACTGTTGTTGACTTATTGCTGTAGTGATTGTTAGTAACTCGATACCGACAAGCTCTAGTCACTTTCTGAATATCACCACTATTCGGTAACAGGTATAACTTTTCATAACCATATGGATACTGTGTATGCATCGGTGGTTGACGAGGTTTCACTGGTGTGAAAATACGTGAGTTTCCAGGATTTTTAGAATTTTCAGTTTGTTTCTCTAATGATGGTGGATCATTTCTTAATTTACATTTCATTGCAGAAACTACTACATTATTCTCTATATTTTGTTGTTGTACATGAACATGCAACTCTTTCTGTGTTTGATCATTAGTTTCACTTGGTACTACATCTTGACAAGTTATATTTAACAATTTAGTAGATTCAGTTACCTTTTCAGTAGTTACCATACTGTTATGATTATTATTTTTCAATTTAAATGATGTCTGTTTATTTTCTACTACTACTCCCGGTGATAACTGATGACATGAATTAGTAGTATTATTCTCATTATTTGTATCTATGTTTACTTGTTCATGAGTT]




>consensus_5727#0
TTGTTATTGGTCCTTCAAGTTGTTGGCTTACTGTTGTTGACTTATTGCTGTAGTGATTGT
TATTAACTCGATACCGACAAGCTCCAGTCACTTTCGGAACATCACCACTATTCGGTAACA
GGTATAACTTTTCATAACCATATGGATACTGTGTATGCATCGGTGGTTGACGAGGTTTCA
CTGGTGTGAAAATACGTGAGTTTCCAGGATTTTTAGAATTTTCAGTTTGTTTCTCTAATG
ATGGTGGATCATTTCTTAATTTACATTTCATTGCAGAAACTACTACATTATTCTCTATAT
TTTGTTGTTGTACATGAACATGCAACTCTTTCTGTGTTTGATCATTAGTTTCACTTGGTA
CTACATCTTGACAAGTTATATTTAACAATTTAGTAGATTCAGTTACCTTTTCAGTAGTTA
CCATACTGTTATGATTATTATTTTTCAATTTAAATGATGTCTGTTTATTTTCTACTACTA
CTCCCGGTGATAACTGATGACATGAATTAGTAGTATTATTCTCATTATTTGTATCTATGT
TTACTTGTTCATGAGTT

clustalw multiple alignements is not computed in this case