cluster # 5778

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 5778 cluster # 5778 Sequences # 3 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5778#0 length = 987 sequences # 3
consensusID : consensus_5778#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 987
fasta sequence
                              [CTCGNAGGCCANAATTCGGCACGAGGCAAAACCTCGTCATCGAACAGTCTATTTAATGAGTATTCTTGCATTAAAACGTAATTTAGAATGTGATTTAGACCAGTCCATTAAAAATACATTACGTTCATGTAAATTCATTGGTTTTATTGATGAAACAAGATGTTTAGCACAACACCATACAGAATTATTACTTATACGTTTAAAACCTTTAAGTCAAGCATTATTTTATCAATTATTATTAACAAATTTTGGCAATCATGGTGAAATAATTCTCCGTGAACCAGCCCCATTAGCAGATCTTTTATCAATAGGACATGAATATCTTCGGAAATCTTCACGATACTTATCTAATCTCAGTTCAATTGAATTTATTAAAGAAGCTACCGCTACTCTTGTTAAGCATGCATCTATGCTCTGGGATTATTTCTCAATTAAAATAACTACTGATTCAAATGGAAATCAAGTGCTTACTGGGATTCCTTTAATTATAGCTGATTATATACCCGAATTGAACCAGCTTCCAATTTATGTGACAAAATTAGCTACACAAGTTAGTTGGTCAGTTGAATCCATTTGCTTTGAAAATATTTGCTGTATCACAGCGAATTTCTATGCAGTATCATCAAGTTTATTCAACGATTGTTCTTCATCGCCCATATCATCTTCCACATCAATTATTGATGATAAGTCAGATAAAGAAAACACTGTATCGTCATCGTCATTATCACCTCGTGAATGGATGATTCAACATATACTATGGCCTATTTTATGTTCTTCTTTATTACCTAGTCGAAGATATCCTAATTTCGATTTAGATCATAATGAAAATGACAATAAATCGTTCTCTTTACAATCTTGTTTCATTCGTCTTACGTCATTAACAGATTTATATAAAGTATTTGAACGTTGTTAAATTGTTTTAAGTTGTGCATTTATTATTGTTATTTGATTTAATTACTGTTGTTATTCAAGAGATTCAAATTATAT]

[+] EMBL CD080366             [CTCGNAGGCCANAATTCGGCACGAGGCAAAACCTCGTCATCGAACAGTCTATTTAATGAGTATTCTTGCATTAAAACGTAATTTAGAATGTGATTTAGACCAGTCCATTAAAAATACATTACGTTCATGTAAATTCATTGGTTTTATTGATGAAACAAGATGTTTAGCACAACACCATACAGAATTATTACTTATACGTTTAAAACCTTTAAGTCAAGCATTATTTTATCAATTATTATTAACAAATTTTGGCAATCATGGTGAAATAATTCTCCGTGAACCAGCCCCATTAGCAGATCTTTTATCAATAGGACATGAATATCTTCGGAAATCTTCACGATACTTATCTAATCTCAGTTCAATTGAATTTATTAAAGAAGCTACCGCTACTCTTGTTAAGCATGCATCTATGCTCTGGGATTATTTCTCAATTAAAATAACTACTGATTCAAATGGAAATCAAGTGCTTACTGGGATTCCTTTAATTATAGCTGATTATATACCCGAATTGAACCAGCTTCCAATTTATGTGACAAAATTAGCTACACAAGTTAGTTGGTCAGTTGAATCCATTTGCTTTGAAAATATTTGCTGTATCACAGCGAATTTCTATGCAGTATCATCAAGTTTATTCAACGATTGTTCTTCATCGCCCATATCATCTTCCACATCAATTATTGATGANTAGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD074462             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TCACGATACTTATCTAATCTCAGTTCAATTGAATTTATTAAAGAAGCTACCGCTACTCTTGTTAAGCATGCATCTATGCTCTGGGATTATTTCTCAATTAAAATAACTACTGATTCAAATGGAAATCAAGTGCTTACTGGGATTCCTTTAATTATAGCTGATTATATACCCGAATTGAACCAGCTTCCAATTTATGTGACAAAATTAGCTACACAAGTTAGTTGGTCAGTTGAATCCATTTGCTTTGAAAATATTTGCTGTATCACAGCGAATTTCTATGCAGTATCATCAAGTTTATTCAACGATTGTTCTTCATCGCCCATATCATCTTCCACATCAATTATTGATGATAAGTCAGATAAAGAAAACACTGTATCGTCATCGTCATTATCACCTCGTGAATGGATGATTCAACATATACTATGGCCTATTTTATGTTCTTCTTTATTACCTAGTCGAAGATATCCTAATTTCGATTTAGATCATAATGAAAATGACAATAAATCGTTCTCTTTACAATCTTGTTTCATTCGTCTTACGTCATTAACAGATTTATATAAAGTATTTGAACGTTGTTAAATTGTTTTAAGTTGTGCATTTATTATTGTTATTTGATTTAATTACTGTTGTTATTCAAGAGATTCAAATTATAT]
[-] EMBL CD074282             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TAAGCATGCATCTATGCTCTGGGATTATTTCTCAATTAAAATAACTACTGATTCAAATGGAAATCAAGTGCTTACTGGGATTCCTTTAATTATAGCTGATTATATACCCGAATTGAACCAGCTTCCAATTTATGTGACAAAATTAGCTACACAAGTTAGTTGGTCAGTTGAATCCATTTGCTTTGAAAATATTTGCTGTATCACAGCGAATTTCTATGCAGTATCATCAAGTTTATTCAACGATTGTTCTTCATCGCCCATATCATCTTCCACATCAATTATTGATGATAAGTCAGATAAAGAAAACACTGTATCGTCATCGTCATTATCACCTCGTGAATGGATGATTCAACATATACTATGGCCTATTTTATGTTCTTCTTTATTACCTAGTCGAAGATATCCTAATTTCGATTTAGATCATAATGAAAATGACAATAAATCGTTCTCTTTACAATCTTGTTTCATTCGTCTTACGTCATTAACAGATTTATATAAAGTATTTGAACGTTGTTAAATTGTTTTAAGTTGTGCATTTATTATTGTTATTTGATTTAATTACTGTTGTTATTCAAGAGATTCAAATTATAT]




>consensus_5778#0
CTCGNAGGCCANAATTCGGCACGAGGCAAAACCTCGTCATCGAACAGTCTATTTAATGAG
TATTCTTGCATTAAAACGTAATTTAGAATGTGATTTAGACCAGTCCATTAAAAATACATT
ACGTTCATGTAAATTCATTGGTTTTATTGATGAAACAAGATGTTTAGCACAACACCATAC
AGAATTATTACTTATACGTTTAAAACCTTTAAGTCAAGCATTATTTTATCAATTATTATT
AACAAATTTTGGCAATCATGGTGAAATAATTCTCCGTGAACCAGCCCCATTAGCAGATCT
TTTATCAATAGGACATGAATATCTTCGGAAATCTTCACGATACTTATCTAATCTCAGTTC
AATTGAATTTATTAAAGAAGCTACCGCTACTCTTGTTAAGCATGCATCTATGCTCTGGGA
TTATTTCTCAATTAAAATAACTACTGATTCAAATGGAAATCAAGTGCTTACTGGGATTCC
TTTAATTATAGCTGATTATATACCCGAATTGAACCAGCTTCCAATTTATGTGACAAAATT
AGCTACACAAGTTAGTTGGTCAGTTGAATCCATTTGCTTTGAAAATATTTGCTGTATCAC
AGCGAATTTCTATGCAGTATCATCAAGTTTATTCAACGATTGTTCTTCATCGCCCATATC
ATCTTCCACATCAATTATTGATGATAAGTCAGATAAAGAAAACACTGTATCGTCATCGTC
ATTATCACCTCGTGAATGGATGATTCAACATATACTATGGCCTATTTTATGTTCTTCTTT
ATTACCTAGTCGAAGATATCCTAATTTCGATTTAGATCATAATGAAAATGACAATAAATC
GTTCTCTTTACAATCTTGTTTCATTCGTCTTACGTCATTAACAGATTTATATAAAGTATT
TGAACGTTGTTAAATTGTTTTAAGTTGTGCATTTATTATTGTTATTTGATTTAATTACTG
TTGTTATTCAAGAGATTCAAATTATAT
clustalw multiple alignements is not computed in this case