cluster # 5799

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Schistosoma mansoni
cluster # 5799 cluster # 5799 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_5799#0 length = 662 sequences # 3

consensusID : consensus_5799#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 662
fasta sequence

                              [ATGCAAATTTATGATATATCAGTAAACAATTGAAACTATTATTGTCCACTAAGTTTTATGAATTTAATTTGTTACATGAGAAATATTGGGTTTTTTCATCCACTTATTATTATTCTTCTTTTATGGACTATTTCAGCCAGCCAAAGATAAGATTTTCTCCAACTTTTTAATTTCAACTTCTGGTCCTTTAACTTGTTCAGCACCTTTCTTTTCCTTTGGTAATTTACGTAGATTCGGTGATAGCTTCAAGCTATTCACTTGACCATGATCATCACCAACAATAATTATGCTGTATTGTGGATTAAATGCAATATGCGTTAATTTTGTATTCTTTTTTGTTACTATCAGTTGATTACATAATGGATCATATTTGTTAATTGAAAGATCATAAACATGTACACGCCCATCAGCTGTAACTGCTGCAAATACAGTAGACGAATAAGGTGCCCATGCAACATCACCCACTGGTGAGCCTAAATCAAATGTAAACATTGGAGTACTTTTTGCCTGATCCCATATTTTAACTGTCCAATCGGCTGAACATGTAATAAATATATCAGGATGAAACAAATTCCATGCTACACGATAAACAGCCATATGATGAGCCTCATAAGTGGCTAGATATTGAGATGTATATGCCTTGCTACATTTGAACACCATTC]

[+] EMBL CD074505             [ATGCAAATTTATGATATATCAGTAAACAATTGAAACTATTATTGTCCACTAAGTTTTATGAATTTAATTTGTTACATGAGAAATATTGGGTTTTTTCATCCACTTATTATTATTCTTCTTTTATGGACTATTTCAGCCAGCCAAAGATAAGATTTTCTCCAACTTTTTAATTTCAACTTCTGGTCCTTTAACTTGTTCAGCACCTTTCTTTTCCTTTGGTAATTTACGTAGATTCGGTGATAGCTTCAAGCTATTCACTTGACCATGATCATCACCAACAATAATTATGCTGTATTGGGGATTAAATGCAATATGCGTTAATTTTGTATTCTTTTTTGTTACTATCAGTTGATTACATAATGGATCATATTTGTTAATTGAAAGATCATAAACATGTACACGCCCATCAGCTGTAACTGCTGCAAATACAGTAGACGAATAAGGTGCCCATGCAACATCACCCACTGGTGAGCCTAAATCAAATGTAAACATTGGAGTACTTTTTGCCTGATCCCATATTTTAACTGTCCAATCGGCTGAACATGTAATAAATATATCAGGATGAAACAAATTCCATGCTACACGATAAACAGCCATATGATGAGCCTCATAAGTGGCTAGATATTGAGATGTATATGCCTTGCTACATTTGAACACCATTC]
[+] EMBL CD074327             [ATGCAAATTTATGATATATCAGTAAACAATTGAAACTATTATTGTCCACTAAGTTTTATGAATTTAATTTGTTACATGAGAAATATTGGGTTTTTTCATCCACTTATTATTATTCTTCTTTTATGGACTATTTCAGCCAGCCAAAGATAAGATTTTCTCCAACTTTTTAATTTCAACTTCTGGTCCTTTAACTTGTTCAGCACCTTTCTTTTCCTTTGGTAATTTACGTAGATTCGGTGATAGCTTCAAGCTATTCACTTGACCATGATCATCACCAACAATAATTATGCTGTATTGTGGATTAAATGCAATATGCGTTAATTTTGTATTCTTTTTTGTTACTATCAGTTGATTACATAATGGATCATATTTGTTAATTGAAAGATCATAAACATGTACACGCCCATCAGCTGTAACTGCTGCAAATACAGTAGACGAATAAGGTGCCCATGCAACATCACCCACTGGTGAGCCTAAATCAAATGTAAACATTGGAGTACTTTTTGCCTGATCCCATATTTTAACTGTCCAATCGGCTGAACATGTAATAAATATATCAGGATGAAACAAATTCCATGCTACACGATAAACAGCCATATGATGAGCCTCATAAGTGGCTAGATATTGAGAT                               ]
[-] EMBL CD080414             [ TGCAAATNTATGATATATCAGTAAACAATTGAAACTATTATTGTCCACTAAGTTTTATGAATTTAATTTGTTACATGAGAAATATTGGGTTTTTTCATCCACTTATTATTATTCTTCTTTTATGGACTATTTCAGCCAGCCAAAGATAAGATTTTCTCCAACTTTTTAATTTCAACTTCTGGTCCTTTAACTTGTTCAGCACCTTTCTTTTCCTTTGGTAATTTACGTAGATTCGGTGATAGCTTCAAGCTATTCACTTGACCATGATCATCACCAACAATAATTATGCTGTATTGTGGATTAAATGCAATATGCGTTAATTTTGTATTCTTTTTTGTTACTATCAGTTGATTACATAATGGATCATATTTGTTAATTGAAAGATCATAAACATGTACACGCCCATCAGCTGTAACTGCTGCAAATACAGTAGACGAATAAGGTGCCCATGCAACATCACCCACTGGTGAGCCTAAATCAAATGTAAACATTGGAGTACTTTTTGCCTGATCCCATATTTTAACTGTCCAATCGGCTGAACATGTAATAAATATATCAGGATGAAACAAATTCCATGCTACACGATAAACAGCCATATGATGAGCCTCATAAGTGGCTAGATATTGAGATGTATATGCCTTGCTACATTTGAACACCATT ]




>consensus_5799#0
ATGCAAATTTATGATATATCAGTAAACAATTGAAACTATTATTGTCCACTAAGTTTTATG
AATTTAATTTGTTACATGAGAAATATTGGGTTTTTTCATCCACTTATTATTATTCTTCTT
TTATGGACTATTTCAGCCAGCCAAAGATAAGATTTTCTCCAACTTTTTAATTTCAACTTC
TGGTCCTTTAACTTGTTCAGCACCTTTCTTTTCCTTTGGTAATTTACGTAGATTCGGTGA
TAGCTTCAAGCTATTCACTTGACCATGATCATCACCAACAATAATTATGCTGTATTGTGG
ATTAAATGCAATATGCGTTAATTTTGTATTCTTTTTTGTTACTATCAGTTGATTACATAA
TGGATCATATTTGTTAATTGAAAGATCATAAACATGTACACGCCCATCAGCTGTAACTGC
TGCAAATACAGTAGACGAATAAGGTGCCCATGCAACATCACCCACTGGTGAGCCTAAATC
AAATGTAAACATTGGAGTACTTTTTGCCTGATCCCATATTTTAACTGTCCAATCGGCTGA
ACATGTAATAAATATATCAGGATGAAACAAATTCCATGCTACACGATAAACAGCCATATG
ATGAGCCTCATAAGTGGCTAGATATTGAGATGTATATGCCTTGCTACATTTGAACACCAT
TC

clustalw multiple alignements is not computed in this case