cluster # 5913

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 5913 cluster # 5913 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_5913#0 length = 629 sequences # 3

consensusID : consensus_5913#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 629
fasta sequence

                              [AAGACAACTAGTTTTCAATCAAATGTGATTGAGTTGATGCTATGATTAGTTATTAATGCATTCGAGTTGATCATATTCATGAACATATTCATCACTCATTCATTCTACGACAATTAATCAATTTCTCCTTGTCCTCTTTCTTGAAACATGATGATACCCCCCCCAGTTACGTATCAGTTTACATCTCTTCTAGGGCTCCCTAATCAAGTATGATCGAGTTGATGTTATGATTAGTTATTAATGTATTTACGATAATTATATTCATGAACAAATCGATCATTCATTCATTCTATGTCAATCAATCTCTCCTTATCTTCTTTCTTGGAACACAATGTTACCCAGTTACTTAATATTTTACCACTCTTCTAGAGTTTCTCAAACAAATGTCATTGAGTTGATGTTATGATCAGTTATTAATGCATTTGAATTGATTATATTCATGAACAAATTGATCATTCATTCATTCTATGTCAATCAATTCCTTATTTTCTTTTTGAAATATGGTGATACTCAGTTACGTAACAGTTTACACCTCTTTTAGAGTTTCCCAATCAAATGTGATTGAGTAGATATTATGAACACTTATTAATGAATTTAAGTTGATTATATTCAATCAATCAATTAATCGA]

[-] EMBL CD195684             [AAGACAACTAGTTTTCAATCAAATGTGATTGAGTTGATGCTATGATTAGTTATTAATGCATTCGAGTTGATCATATTCATGAACATATTCATCACTCATTCATTCTACGACAATTAATCAATTTCTCCTTGTCCTCTTTCTTGAAACATGATGATACCCCCCCCAGTTACGTATCAGTTTACATCTCTTCTAGGGCTCCCTAATCAAGTATGATCGAGTTGATGTTATGATTAGTTATTAATGTATTTACGATAATTATATTCATGAACAAATCGATCATTCATTCATTCTATGTCAATCAATCTCTCCTTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL AI975316             [                    AAATGTGATTGAGTTGATGCTATGATTAGTTATTAATGCATTCGAGTTGATCATATTCATGAACATATTCATCACTCATTCATTCTACGACAATTAATCAATTTCTCCTTGTCCTCTTTCTTGAAACATGATGATACCCCCCCCAGTTACGTATCAGTTTACATCTCTTCTAGAGCTCCCTAATCAAGTATGATCGAGTTGATGTTATGATTAGTTATTAATGTATTTACGATAATTATATTCATGAACAAATCGATCATTCATTCATTCTATGTCAATCAATCTCTCCTTATCTTCTTTCTTGGAACACAATGTTACCCAGTTACTTAATATTTTACCACTCTTCTAGAGTTTCTCAAACAAATGTCATTGAGTTGATGTTATGATCAGTTATTAATGCATTTGAATTGATTATATTCATGAACAAATTGATCATTCATTCATTCTATGTCAATCAATTCCTTATTTTCTTTTTGAAATATGGTGATACTCAGTTACGTAACAGTTTACACCTCTTTTAGAGTTTCCCAATCAAATGTGATTGAGTAGATATTATGAACACTTATTAATGAATTTAAGTTGATTATATTCAATCAATCAATTAATCGA]
[-] EMBL CD135281             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TACCCAGTTACTTAATATTTTACCACTCTTCTAGAGTTTCTCAAACAAATGTCATTGAGTTGATGTTATGATCAGTTATTAATGCATTTGAATTGATTATATTCATGAACAAATTGATCATTCATTCATTCTATGTCGATCAATTCCTTATTTTCTTTTTGAAATATGGTGATACTCAGTTACGTAACAGTTTACACTTCTTTTAGAGTTTCCCAATCAAA                                                                         ]




>consensus_5913#0
AAGACAACTAGTTTTCAATCAAATGTGATTGAGTTGATGCTATGATTAGTTATTAATGCA
TTCGAGTTGATCATATTCATGAACATATTCATCACTCATTCATTCTACGACAATTAATCA
ATTTCTCCTTGTCCTCTTTCTTGAAACATGATGATACCCCCCCCAGTTACGTATCAGTTT
ACATCTCTTCTAGGGCTCCCTAATCAAGTATGATCGAGTTGATGTTATGATTAGTTATTA
ATGTATTTACGATAATTATATTCATGAACAAATCGATCATTCATTCATTCTATGTCAATC
AATCTCTCCTTATCTTCTTTCTTGGAACACAATGTTACCCAGTTACTTAATATTTTACCA
CTCTTCTAGAGTTTCTCAAACAAATGTCATTGAGTTGATGTTATGATCAGTTATTAATGC
ATTTGAATTGATTATATTCATGAACAAATTGATCATTCATTCATTCTATGTCAATCAATT
CCTTATTTTCTTTTTGAAATATGGTGATACTCAGTTACGTAACAGTTTACACCTCTTTTA
GAGTTTCCCAATCAAATGTGATTGAGTAGATATTATGAACACTTATTAATGAATTTAAGT
TGATTATATTCAATCAATCAATTAATCGA

clustalw multiple alignements is not computed in this case