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Schistosoma mansoni
cluster # 5975 cluster # 5975       Sequences # 3       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5975#0 length = 969 sequences # 3  
consensusID : consensus_5975#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 969
fasta sequence 
                              [ACAAAATTTGTATTTAAAATAGTATTGTATACAATGTAAGGTATATATATATATATATATATATATCAAAAATGAGTACAGAATTTAGTTGTATAGTCCAGAAAGGATTTATTCAATATAATTTGTTTCAATTGTTCAACAGTTGAGCTTCTCGTTCATGAATTTGCTTCATAACTAATCTCATTTTCAAAATACAATTGGTTCGACGTCTTCGTAGATCGTGCAAAATTTCATCCTCAGGGAATCTTTCATCAGGTTCTTCCACATTATTCAAATTTTCCTCCATATAACGCGCAATTGTTAAACCTATTTGAACCTCCTTATCGAAAGTAGATTTACTGGATGTAAATTCAGTAGACGTAGGACCAGGTAAGTGAGTAGAGGTTTGATTTGATATTTTTTCA-GATGGGTAGGATGGATGGTGTTGTTGATAATCCATTTCTTGTCCAATATAACTATCGCAAGTACTAGTTGTTAAGTGATTTGAATTCTTATCATTTCTTATTGACGGAGGAGTTGCAGGCCATATCCAACTGTCAGATTCAATTGATTGAGCACTTTCAGAGATATCAACCGGTAGAAATCGAGGGATACGAGGATCATAATCCACTAGTGTATTGTTATCAGCAATGGTAGTATCATTGGTCATAGTCATAGTTGTTGTCTGTTGGTGCTGTTGATAAGATGTTTTATCCACAGATATGCATAAGTTTTTATTCAGGGGGCGATTATTTGAACCATTTGTTATATTGGATGGTATCATATTCAATGGTGTTTGTAGTTTAACATTTCTTGATTGTGGTCGACCCATAACACGAATAGATTTGTGTTTTGCTTCCAAACCTGTTTTAGAAATAATTCCATCTGTTGTTGTCCCAACATCACGTATATTCGATTCATTGAACAAATTGATTGATTTTAAACAATTAAATGAAGCATTCAAAACACTTTGATTTGTTAGCATTTGTA]

[+] EMBL CD076442             [ACAAAATTTGTATTTAAAATAGTATTGTATACAATGTAAGGTATATATATATATATATATATATATCAAAAATGAGTACAGAATTTAGTTGTATAGTCCAGAAAGGATTTATTCAATATAATTTGTTTCAATTGTTCAACAGTTGAGCTTCTCGTTCATGAATTTGCTTCATAACTAATCTCATTTTCAAAATACAATTGGTTCGACGTCTTCGTAGATCGTGCAAAATTTCATCCTCAGGGAATCTTTCATCAGGTTCTTCCACATTATTCAAATTTTCCTCCATATAACGCGCAATTGTTAAACCTATTTGAACCTCCTTATCGAAAGTAGATTTACTGGATGTAAATTCAGTAGACGTAGGACCAGGTAAGTGAGTAGAGGTTTGATTTGATATTTTTTCA GATGGGTAGGATGGATGGTGTTGTTGATAATCCATTTCTTGTCCAATATAACTATCGCAAGTACTAGTTGTTAAGTGATTTGAATTCTTATCATTTCTTATTGACGGAGGAGTTGCAGGCCATATCCAACTGTCAGATTCAATTGATTGAGCACTTTCAGAGATATCAACCGGTAGAAATCGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD077126             [ACAAAATTTGTATTTAAAATAGTATTGTATACAATGTAAGGTATATATATATATATATATATATATCAAAAATGAGTACAGAATTTAATTGTATAGTCCAAAAAGGATTTATTCAATATAATTTGTTTCAATTGTTCAACAGTTGAGCTTCTCGTTCATGAATTTGCTTCATAACTAATCTCATTTTCAAAATACAATTGGTTCGACGTCTTCGTAGATCGTGCAAAATTTCATCCTCAGGGAATCTTTCATCAGGTTCTTCCACATTATTCAAATTTTCCTCCATATAACGCGCAATTGTTAAACCTATTTGAACCTCCTTATCGAAAGTAGATTTACTGGATGTAAATTCAGTAGACGTACGACCAGGTAAGTGAGTAGAGGTTTGATTTGATATTTTTTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD082857             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TTTTCANGATGGGTAGGATGGATGGTGTTGTTGATAATCCATTTCTTGTCCAATATAACTATCGCAAGTACTAGTTGTTAAGTGATTTGAATTCTTATCATTTCTTATTGACGGAGGAGTTGCAGGCCATATCCAACTGTCAGATTCAATTGATTGAGCACTTTCAGAGATATCAACCGGTAGAAATCGAGGGATACGAGGATCATAATCCACTAGTGTATTGTTATCAGCAATGGTAGTATCATTGGTCATAGTCATAGTTGTTGTCTGTTGGTGCTGTTGATAAGATGTTTTATCCACAGATATGCATAAGTTTTTATTCAGGGGGCGATTATTTGAACCATTTGTTATATTGGATGGTATCATATTCAATGGTGTTTGTAGTTTAACATTTCTTGATTGTGGTCGACCCATAACACGAATAGATTTGTGTTTTGCTTCCAAACCTGTTTTAGAAATAATTCCATCTGTTGTTGTCCCAACATCACGTATATTCGATTCATTGAACAAATTGATTGATTTTAAACAATTAAATGAAGCATTCAAAACACTTTGATTTGTTAGCATTTGTA]




>consensus_5975#0
ACAAAATTTGTATTTAAAATAGTATTGTATACAATGTAAGGTATATATATATATATATAT
ATATATCAAAAATGAGTACAGAATTTAGTTGTATAGTCCAGAAAGGATTTATTCAATATA
ATTTGTTTCAATTGTTCAACAGTTGAGCTTCTCGTTCATGAATTTGCTTCATAACTAATC
TCATTTTCAAAATACAATTGGTTCGACGTCTTCGTAGATCGTGCAAAATTTCATCCTCAG
GGAATCTTTCATCAGGTTCTTCCACATTATTCAAATTTTCCTCCATATAACGCGCAATTG
TTAAACCTATTTGAACCTCCTTATCGAAAGTAGATTTACTGGATGTAAATTCAGTAGACG
TAGGACCAGGTAAGTGAGTAGAGGTTTGATTTGATATTTTTTCAGATGGGTAGGATGGAT
GGTGTTGTTGATAATCCATTTCTTGTCCAATATAACTATCGCAAGTACTAGTTGTTAAGT
GATTTGAATTCTTATCATTTCTTATTGACGGAGGAGTTGCAGGCCATATCCAACTGTCAG
ATTCAATTGATTGAGCACTTTCAGAGATATCAACCGGTAGAAATCGAGGGATACGAGGAT
CATAATCCACTAGTGTATTGTTATCAGCAATGGTAGTATCATTGGTCATAGTCATAGTTG
TTGTCTGTTGGTGCTGTTGATAAGATGTTTTATCCACAGATATGCATAAGTTTTTATTCA
GGGGGCGATTATTTGAACCATTTGTTATATTGGATGGTATCATATTCAATGGTGTTTGTA
GTTTAACATTTCTTGATTGTGGTCGACCCATAACACGAATAGATTTGTGTTTTGCTTCCA
AACCTGTTTTAGAAATAATTCCATCTGTTGTTGTCCCAACATCACGTATATTCGATTCAT
TGAACAAATTGATTGATTTTAAACAATTAAATGAAGCATTCAAAACACTTTGATTTGTTA
GCATTTGTA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)