cluster # 6000

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Schistosoma mansoni
cluster # 6000 cluster # 6000 Sequences # 3 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

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consensus_6000#0 length = 964 sequences # 3
consensusID : consensus_6000#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 964
fasta sequence
                              [GTTGCATGAATGTTTTCTTGCCTACAGCTAATCAATGCCGTTTATCAGGACTTCCAATCTGCACATACTTTAATATCATACTTAGTATCGGAGATTAAACAGCTAGCAAAAATTGAAGCTAAAGCAGTACGCGCTGTTCGTATCGCTTTTGTTATCCTAGCTTGTTTATTGTACTTGTTGATAGAGTGCAATATTAGTAATAGCTTAACGTTGACAGCATTTACACATTTGTTGATATTCGACTTATTATCGGTTATTGTCGCTCTAATAAGCTTTTGGACTAACAGAAAAAAAGCCTCCGTTGAATCGTATAGCTTGGGGTATGAAAGATTTGAAGTAGTTGCCGTTTTCGCTTCCACTATCTTGGCTATTCTCTTATCGTTTTTCGAAATAAAAGAGGCTGTCGAACGAATATTTGAACCTGCAGAGATCTCTTCCAATCATATGCTTACGCCTTGTTTAATAGCGTTTGGTGTTCATCTTCTTTCAATTTATGGAGTTGATAATATGGCTTTTGCACATGTTATCCAAGCTTGTGGATCAAGTTGGTTACAAGAGCATACGACTGATATAAGCCGGACAATCTGTCGAATTATTCCCGGGTTATCACGTGTTCTTTTGCCACGAGTTAACCCGATCTCACTGATTGGTGTAACCACAACTACAACGGNCTGTATTGTTTATCTTATCTTAATCAATATGTCAAAAACGTCACAACACATAAACTTCCCAGACCCTTTGCCTGATACTTTGGGTGGAATGATAATTTCCCTCATGTTATTTGGAACAATGATGCCTATGATGCTGTACAGTGGGAGGATACTACTTCAGACGACACCCGCTCACTTAGTTAGCCCCTTAGATAAAGCGCTTCGAGAAGCCTCTACAGTTGATGGTGTTCTTGAGCTGCAAAATGAGCACATATGGTCGATCGGATACAATGACCTTGCAGGAAGTTTGTATG]

[+] EMBL CD082846             [GTTGCATGAATGTTTTCTTGCCTACAGCTAATCAATGCCGTTTATCAGGACTTCCAATCTGCACATACTTTAATATCATACTTAGTATCGGAGATTAAACAGCTAGCAAAAATTGAAGCTAAAGCAGTACGCGCTGTTCGTATCGCTTTTGTTATCCTAGCTTGTTTATTGTACTTGTTGATAGAGTGCAATATTAGTAATAGCTTAACGTTGACAGCATTTACACATTTGTTGATATTCGACTTATTATCGGTTATTGTCGCTCTAATAAGCTTTTGGACTAACAGAAAAAAAGCCTCCGTTGAATCGTATAGCTTGGGGTATGAAAGATTTGAAGTAGTTGCCGTTTTCGCTTCCACTATCTTGGCTATTCTCTTATCGTTTTTCGAAATAAAAGAGGCTGTCGAACGAATATTTGAACCTGCAGAGATCTCTTCCAATCATATGCTTACGCCTTGTTTAATAGCGTTTGGTGTTCATCTTCTTTCAATTTATGGAGTTGATAATATGGCTTTTGCACATGTTATCCAAGCTTGTGGATCAAGTTGGTTACAAGAGCATACGACTGATATAAGCCGGACAATCTGTCGAATTATTCCCGGGTTATCAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD183354             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TGGTTACAAGAGCATACGACTGATATAAGCCGGACAATCTGTCGAATTATTCCCGGGTTATCACGTGTTCTTTTGCCACGAGTTAACCCGATCTCACTGATTGGTGTAACCACAACTACAACGGNCTGTATTGTTTATCTTATCTTAATCAATATGTCAAAAACGTCACAACACATAAACTTCCCAGACCCTTTGCCTGATACTTTGGGTGGAATGATAATTTCCCTCATGTTATTTGGAACAATGATGCCTATGATGCTGTACAGTGGGAGGATACTACTTCAGACGACACCCGCTCACTTAGTTAGCCCCTTAGATAAAGCGCTTCGAGAAGCCTCTACAGTTGATGGTGTTCTTGAGCTGCAAAATGAGCACATATGGTCGATCGGATACAATGACCTTGCAGGAAGTTTGTATG]
[-] EMBL BG931396             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tCTGTATTGTTTATCTTATCTTAATCAATATGTCAAAAACGTCACAACACATAAACTTCCCAGACCCTTTGCCTGATACTTTGGGTGGAATGATAATTTCCCTCATGTTATTTGGAACAATGATGCCTATGATGCTGTACAGTGGGAGGATACTACTTCAGACGACACCCGCTCACTTAGTTAGCCCCTTAGATAAAGCGCTTCGAGAAGCCTCCACAGTTGATGGTGTTCTTGAGCTGCAAAATGAt                                              ]




>consensus_6000#0
GTTGCATGAATGTTTTCTTGCCTACAGCTAATCAATGCCGTTTATCAGGACTTCCAATCT
GCACATACTTTAATATCATACTTAGTATCGGAGATTAAACAGCTAGCAAAAATTGAAGCT
AAAGCAGTACGCGCTGTTCGTATCGCTTTTGTTATCCTAGCTTGTTTATTGTACTTGTTG
ATAGAGTGCAATATTAGTAATAGCTTAACGTTGACAGCATTTACACATTTGTTGATATTC
GACTTATTATCGGTTATTGTCGCTCTAATAAGCTTTTGGACTAACAGAAAAAAAGCCTCC
GTTGAATCGTATAGCTTGGGGTATGAAAGATTTGAAGTAGTTGCCGTTTTCGCTTCCACT
ATCTTGGCTATTCTCTTATCGTTTTTCGAAATAAAAGAGGCTGTCGAACGAATATTTGAA
CCTGCAGAGATCTCTTCCAATCATATGCTTACGCCTTGTTTAATAGCGTTTGGTGTTCAT
CTTCTTTCAATTTATGGAGTTGATAATATGGCTTTTGCACATGTTATCCAAGCTTGTGGA
TCAAGTTGGTTACAAGAGCATACGACTGATATAAGCCGGACAATCTGTCGAATTATTCCC
GGGTTATCACGTGTTCTTTTGCCACGAGTTAACCCGATCTCACTGATTGGTGTAACCACA
ACTACAACGGNCTGTATTGTTTATCTTATCTTAATCAATATGTCAAAAACGTCACAACAC
ATAAACTTCCCAGACCCTTTGCCTGATACTTTGGGTGGAATGATAATTTCCCTCATGTTA
TTTGGAACAATGATGCCTATGATGCTGTACAGTGGGAGGATACTACTTCAGACGACACCC
GCTCACTTAGTTAGCCCCTTAGATAAAGCGCTTCGAGAAGCCTCTACAGTTGATGGTGTT
CTTGAGCTGCAAAATGAGCACATATGGTCGATCGGATACAATGACCTTGCAGGAAGTTTG
TATG
clustalw multiple alignements is not computed in this case