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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6033#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 726 fasta sequence
[CAATTCACATGATGTTGCTGATGTTGGTATGATAGATATAAGTATTGATCAAGATGGATTGTATGAAAATAACCAAAAGTTAGAGTTATGTGCTGCTATGGTTCGTTTAGGCGATTGGACAAATGCTCAACGTCTGTTAGAACGCCTACCTGGTTATTGGGCGACTACATATGAACCTTTAACACGAGACATATGCAATTTGTTGCATTGCTTAATTGAACCTTTGTACAATAAAGCTTGCCCTTTACCTGCCTGTTTACAACGTAACCGTTCTCGGCCGAGAATCGAGTCATTCAAAGCACTAAATACATATATTATTCTAGA-TGGTATTGATGAGAAATCGTCTGTTGATTGTGAAATAAATGAAGTCAATCGGACCATTACAAATAATAATAACAATAATAATAATTGTATTCTCTTATCACCTGTTCATGATTTTGTTGACCTTGCCAAGTATGTAATACCGATAGCAATTTATTTGGGCCCACATATGTCGTATGACTTAATATTAATAGTGAAGTTTTGTCGTCTTGGTCAAATATATCTCTCTGAACAACAACAAAACCTTCGGTCTGACAAGATTGGAATTGTTTATCAAGGATTTTTTAATTTACTAGATGAAGTACTACTTCCGTCGTTGAGTTTGGTTGATGCTAATTGTTGTTTAGCTGAAGAAATTTGGCAAATGTTACGATTTATGCCTTATGAACATCGATATCGGTTCAT]
[+] EMBL CD161376 [CAATTCACATGATGTTGCTGATGTTGGTATGATAGATATAAGTATTGATCAAGATGGATTGTATGAAAATAACCAAAAGTTAGAGTTATGTGCTGCTATGGTTCGTTTAGGCGATTGGACAAATGCTCAACGTCTGTTAGAACGCCTACCTGGTTATTGGGCGACTACATATGAACCTTTAACACGAGACATATGCAATTTGTTGCATTGCTTAATTGAACCTTTGTACAATAAAGCTTGCCCTTTACCTGCCTGTTTACAACGTAACCGTTCTCGGCCGAGAATCGAGTCATTCAAAGCACTAAATACATATATTATTCTAGA TGGTATTGATGAGAAATCGTCTGTTGATTGTGAAATAAATGAAGTCAATCGGACCATTACAAATAATAATAACAATAATAATAATTGTATTCTCTTATCACCTGTTCATGATTNTGTTGACCTTGCCAAGTATGTAATACCGATAGCAATTTATTTGGGCCCACATATGTCGTATGACTTAATATTAATAGTGAAGTTTTGTCGTCTTGGTCAAATATATCT ]
[+] EMBL CD113834 [ TATTATTCTAGAGTGGAATTGATGAGAAATCGTCTGTTGATTGTGAAATAAATGAAGTCAATCGGACCATTACAAATAATAATAACAATAATAATAATTGTATTCTCTTATCACCTGTTCATGATTTTGTTGACCTTGCCAAGTATGTAATACCGATAGCAATTTATTTGGGCCCACATATGACGTATGACTTAATATTAATAGTGAAGTTTTGTCGTCTTGGTCAAATATATCTCTCTGAACAACAACAAAACCTTCGGTCTGACAAGATCGGAATTGTTTATCAAGGATTTTTTAATTTACTAGATGAAGTACTACTTCCGTCGTTGAGTTTGGTTGATGCTAATTGTTGTTTAGCTGAAGAAATTTGGCAAATGTTACGATTTATGCCTTATGAACATCGATATCGGTTCAT]
[+] EMBL CD113739 [ TGATGAGAAACCGTCTGTTGATTGTGAAATAAATGAAGTCACTCGGACCATTACAAATAATAATAACAATAATAATAATTGTATACTCTTATCACCTGTTCATGATTTTGTTGACCTTGCCAAGTAAGTAATACCGATAGCAATTTATTTGGGCCCACATATGTCGTATGACTTAATATTAATAGTGAAGTTTTGTCGTCTTGGTCAAATATATCTCTCTGAACAACAACAAAACCTTCGGTCTGACAAGATTGGAATTGTT ]
[+] EMBL CD171447 [ ACTTAATATTAATAGTGAAGTTTTGTCGTCTTGGTCAAATATATCTCTCTGAACAACAACAAAACCTTCGGTCTGACAAGACTGGAATTGT ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||