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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6080#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 1212 fasta sequence
[GCGGATGGTAGATCCACACGTTCTAATCCTCGTCATACACGACGTAGCCTAACGATATCAGAGAGATTACGTGCAAAAGGTAGTAGTGGTATTACGTCAGCGTTGGCGGGGGTGACAACTCGTTCAAACAATAATGGTCAAAATGGTATCGATGATGTACGTGCTGCTCAAACAATGTATTTACGACGTAGGCAAGTTAGCTTTGAAGATACTTTATCTCATCTTCCAGTCAGTTTAGATACCCCTCTACCAAATGATTCAAATTGTGAATCAATTCCACCAACTTCATCAAATTCTGATACAAATACCATTGAATAAACAGATCCATCTAGTTCAACAAATACAATAACAAATACTACCTCAAGATTAGAGTCTTCACCTAATGAACAAGGTATAGATCATGTAGATAAAAATCGTCGAATTGGTGAAATAGTTTTAGGCTTAGATATTGCTCCGGGTGAAGAACCACTTCCACAAGGTTGGGAATTAGCTAGAACTGCAAGTGGTCGAAAATTTTTCATTAATCATAATGAACATACTACTACTTGGGATGATCCTAGAGTTATCCGATCAAATAATCAAATAATCAATGGTTCTTTATTAACCCATGAAGCACAACGACATGTCATGAAAGATTTAGGCCCATTACCGCCTGGTTGGGAAGAACGTGTACATAGTAATGGTCGTATTTTCTACATTAATCATAATGCTCGAACTACTCAATGGGAAGATCCTCGACTAGAACGTTTAGGCGGTCCAGCTGTTCCTTATTCAAGAAATTATAAACAGAAATATGATTATTTCCGATCAAGGTTACGAGCTCCACGTGATCCACAAGCTAAATTTGAATTACGTGTTACACGAGCTGGTATATTCGAAGATTCATTCCGTCTAATTTATGGAATAAAAAGACCAGAAGTTCTAATGCATCGATTGTGGATTGAATTTATTGGTGAAAAAGGCTTAGATTATGGTGGTGTACAGCGAGAATGGTTCTTCTTATTATCACGTGAAATGTTTAATCCTTATTATGGTCTATTCGAATATTCAGCCGCTGATAATTATACTCTACAAATTAATCCCCTTTCTGGTATGGCAAATGAAGAACATTTAAAATATTTTAAATTTATTGGACGGGTTGTTGGTATGGCTGTATATCATGGAAAATCAGTTGATGGATTTTTTATTAGACCATTTTATAAAATGATGCTT]
[+] EMBL BG932324 [GCGGATGGTAGATCCACACGTTCTAATCCTCGTCATACACGACGTAGCCTAACGATATCAGAGAGATTACGTGCAAAAGGTAGTAGTGGTATTACGTCAGCGTTGGCGGGGGTGACAACTCGTTCAAACAATAATGGTCAAAATGGTATCGATGATGTACGTGCTGCTCAAACAATGTATTTACGACGTAGGCAAGTTAGCTTTGAAGATACTTTATCTCATCTTCCAGTCAGTTTAGATACCCCTCTAC ]
[-] EMBL CD115180 [ AACAATAATGGTCAAAATGGTATCGATGATGTACGTGCTGCTCAAACAATGTATTTACGACGTAGGCAAGTTAGCTTTGAAGATACTTTATCTCATCTTCCAGTCAGTTTAGATACCCCTCTACCAAATGATTCAAATTGTGAATCAATTCCACCAACTTCATCAAATTCTGATACAAATACCATTGAATAAACAGATCCATCTAGTTCAACAAATACAATAACAAATACTACCTCAAGATTAGAGTCTTCACCTAATGAACAAGGTATAGATCATGTAGATAAAAATCGTCGAATTGGTGAAATAGTTTTAGGCTTAGATATTGCTCCGGGTGAAGAACCACTTCCACAAGGTTGGGAATTAGCTAGAACTGCAAGTGGTCGAAAATTTTTCATTAATCATAATGAACATACTACTACTTGGGATGATCCTAGAGTTATCCGATCAAATAATCAAATAATCAATGGTTCTTTATTAACCC ]
[+] EMBL CD124993 [ AATGTA TTACGACGTAGGCAAGTTAGCTTTGACTATACTTTATCTCATCTTCCAGTCAGTTTAGATACCCCTCTACCAAATGATTCAGATTGTGAATCAATTCCACCAACTTCATCAAATTCTGATACAAATACCATTGAATTAACAGATCCATCTAGTTCAACAAATACAATAACAAATACTACCTCAAGATTAGAGTCTTCACCTAATGAACAAGGTATAGATCATGTAGATAAAAATCGTCGAATTGGTGAAATAGTTTTAGGC ]
[+] EMBL CD155230 [ TCCTAGAGTTATCCGATCAAATAATCAAATAATCAATGGTTCTTTATTAACCCATGAAGCACAACGACATGTCATGAAAGATTTAGGCCCATTACCGCCTGGTTGGGAAGAACGTGTACATAGTAATGGTCGTATTTTCTACATTAATCATAATGCTCGAACTACTCAATGGGAAGATCCTCGACTAGAACGTTTAGGCGGTCCAGCTGTTCCTTATTCAAGAAATTATAAACAGAAATATGATTATTTCCGATCAAGGTTACGAGCTCCACGTGATCCACAAGCTAAATTTGAATTACGTGTTACACGAGCTGGTATATTCGAAGATTCATTCCGTCTAATTTATGGAATAAAAAGACCAGAAGTTCTAATGCATCGATTGTGGATTGAATTTATTGGTGAAAAAGGCTTAGATTATGGTGGTGTACAGCGAGAATGGTTCTTCTTATTATCACGTGAAATGTTTAATCCTTATTATGGTCTATTCGAATATTCAGCCGCTGATAATTATACTCTACAAATTAATCCCCTTTCTGGTATGGCAAATGAAGAACATTTAAAATATTTTAAATTTATTGGACGGGTTGTTGGTATGGCTGTATATCATGGAAAATCAGTTGATGGATTTTTTATTAGACCATTTTATAAAATGATGCTT]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||