cluster # 6105

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 6105 cluster # 6105 Sequences # 4 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_6105#0 length = 669 sequences # 4

consensusID : consensus_6105#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 669
fasta sequence

                              [TTTGTGACAGTTCATCCTAATCCATGTTATCGACCTGCTGTTGAATGGCTTGTTAAATTGGGTCAAGAATTACAGCTTATATGCAAAGTAGTTGAAATCGTTCCAGATAATCCTATCGTCATCATGCGTTGGGATGGATATCAACCGGAATTACCGGCAATCATGTTAAATTCACATATGGACGTAGTACCAGTAGTCGAAGAAAAATGGTCATATCCTCCATTCAGTGGTATGATTACACCCGATGGTAAAATATACGGTCGAGGTACTCAGGATATGAAATCAATTGGTATTCAACAGTTGGAGGCTATTCGAAGATTAAAATCATGTGGATGCCACCAGTTACGTCGTACAGTTTACTTGACTTTTGTACCTGACGAGGAGTTGGGTGGTGTGAAAGGAATGAAACCATTTGTATCAAACCATAATGGATGTAATAATCATCATTCCGAAGAAATTAGATTTCAAGATATGAATATTGGGTTTTGTTTAGATGAGGGTATACCAAGTTGTTCGGAAGATTATTTAGCATTTTATGATGAACGTCGTCCAGTTTGGATAAATGTACACTTTCACGGTAATGCTGGTCATGGTCTTGCTTTGATTGAAAATACGGCCGCTGAAAAATTCCGGATATTTTTAAATCATATTTACAGTTTTCGTAATGAA]

[+] EMBL CD063412             [TTTGTGACAGTTCATCCTAATCCATGTTATCGACCTGCTGTTGAATGGCTTGTTAAATTGGGTCAAGAATTACAGCTTATATGCAAAGTAGTTGAAATCGTTCCAGATAATCCTATCGTCATCATGCGTTGGGATGGATATCAACCGGAATTACCGGCAATCATGTTAAATTCACATATGGACGTAGTACCAGTAGTCGAAGAAAAATGGTCATATCCTCCATTCAGTGGTATGATTACACCCGATGGTAAAATATACGGTCGAGGTACTCAGGGTATGAAATCAATTGGTATTCAACAGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD063497             [ TTGTGACAGTTCATCCTAATCCATGTTATCGACCTGCTGTTGAATGGCTTGTTAAATTGGGTCAAGAATTACAGCTTATATGCAAGGTAGTTGAAATCGTTCCAGATAATCCTATCGTCATCATGCGTTGGGATGGATATCAACCGGAATTACCGGCAATCATGTTACATTCACATATGGACGTAGTACCAGTAGTCGAAGAAAAATGGTCATATCCTCCATTCAGTGGTATGATTACACCCGATGGTAAAATATACGGTCGAGGTACTCAGGATATGAAATCAATTGGTATTCAACAGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD169979             [                                                                                                                                                                                                                                CAGTGGTATGATTACACCCGATGGTAAAATATACGGTCGAGGTACTCAGGATATGAAATCAATTGGTATTCAACAGTTGGAGGCTATTCGAAGATTAAAATCATGTGGATGCCACCAGTTACGTCGTACAGTTTACTTGACTTTTGTACCTGACGAGGAGTTGGGTGGTGTGAAAGGAATGAAACCATTTGTATCAAACCATAATGGATGTAATAATCATCATTCCGAAGAAATTAGATTTCAAGATATGAATATTGGGTTTTGTTTAGATGAGGGTATACCAAGTTGTTCGGAAGATTA                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL AI976973             [                                                                                                                                                                                                                                                              ATACGGTCGAGGTACTCAGGATATGAAATCAATTGGTATTCAACAGTTGGAGGCTATTCGAAGATTAAAATCATGTGGATGCCACCAGTTACGTCGTACAGTTTACTTGACTTTTGTACCTGACGAGGAGTTGGGTGGTGTGAAAGGAATGAAACCATTTGTATCAAACCATAATGGATGTAATAATCATCATTCCGAAGAAATTAGATTTCAAGATATGAATATTGGGTTTTGTTTAGATGAGGGTATACCAAGTTGTTCGGAAGATTATTTAGCATTTTATGATGAACGTCGTCCAGTTTGGATAAATGTACACTTTCACGGTAATGCTGGTCATGGTCTTGCTTTGATTGAAAATACGGCCGCTGAAAAATTCCGGATATTTTTAAATCATATTTACAGTTTTCGTAATGAA]




>consensus_6105#0
TTTGTGACAGTTCATCCTAATCCATGTTATCGACCTGCTGTTGAATGGCTTGTTAAATTG
GGTCAAGAATTACAGCTTATATGCAAAGTAGTTGAAATCGTTCCAGATAATCCTATCGTC
ATCATGCGTTGGGATGGATATCAACCGGAATTACCGGCAATCATGTTAAATTCACATATG
GACGTAGTACCAGTAGTCGAAGAAAAATGGTCATATCCTCCATTCAGTGGTATGATTACA
CCCGATGGTAAAATATACGGTCGAGGTACTCAGGATATGAAATCAATTGGTATTCAACAG
TTGGAGGCTATTCGAAGATTAAAATCATGTGGATGCCACCAGTTACGTCGTACAGTTTAC
TTGACTTTTGTACCTGACGAGGAGTTGGGTGGTGTGAAAGGAATGAAACCATTTGTATCA
AACCATAATGGATGTAATAATCATCATTCCGAAGAAATTAGATTTCAAGATATGAATATT
GGGTTTTGTTTAGATGAGGGTATACCAAGTTGTTCGGAAGATTATTTAGCATTTTATGAT
GAACGTCGTCCAGTTTGGATAAATGTACACTTTCACGGTAATGCTGGTCATGGTCTTGCT
TTGATTGAAAATACGGCCGCTGAAAAATTCCGGATATTTTTAAATCATATTTACAGTTTT
CGTAATGAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case