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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6141#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 1065 fasta sequence
[TTGTAAGGCACATAATTTTACTGCCATCCATCAACTCTACGCTTCTACATGCTTGGGTGTGTATGAGTCAGTTAAATAAACAAAGAGTAAACGTACTCTTTGTAACGGTAATAATTTCGCTTCGGTGCTGTTGTTGTAAGTGCGATGACTTACTGTGCTACAGTGACATTTGTTGTTTTTCCAGTAGACATAAGCTTATTTTTTGATCATCTCAGTAGACTTTATTTCTCATTTTGTAGATATCTGAGTGCATGGAAGCCCTCAGACAGGCGGAAACAAAGCTTTGTAGATTTGTTCCAACAAATCAGTTAACAGTAAAAGGTGTGGGTAACTTCCACGGCCGAGTTTTATATGCAGCAGTTGAGTCCAATGAAAATTTGAATTTGTTTGTCGATCAGCTAAATCAGATTCTACATGTGGCCGGATTCCATACCGATGATCCGAAAAAGTTTAAACCTCATATCTCTCTGATGAAGATGAATCGTTCAGTATCAAAAAAAGTTGGTACGAAAAAAGTCGACCCCAATCTGTGTGGTGAATTTCTAGATACGGAGTTTGGAGTATTCACTCTAGATTCAATTTACCTGTGTGCAATGGGAAGACACCATGATGATGATGGTGGTTTCTATCGTACTATCGGAAATTTACATCTTGTAAATCCGATTTCTAAATAAGGTGATTTTTGTAAACTTACTGTATATTTCCCGTGATATTTTAATAACTTTTTCCTCGAGTCAACCAAATATTAGTGTTGTCCATTATTTTATTTCTCAAAATCTTGATTTCAGTAGCTATACAATGTATACTGTTAAATATTTTTCTGGTCGCAGTTTACTCACACGGTTACATTATCAGTTTTAATAATCACTGTTTTAGGGGTGGACAGTTTCGTCTACGAACAGTAGCAAAATATTGCCTACTTGCACGTCCCAAGAAGCTTTAAAACTCATATTGCTTGTCAGCAGCCCTCTTCATCTTTTGAGTTCCTCTTACATTTGTTGTTTTCATGTCGATATTGTGAATATGACTGCTATTACAACCATTTAATTTATAACTAACTAAAAA]
[+] EMBL CD140338 [TTGTAAGGCACATAATTTTACTGCCATCCATCAACTCTACGCTTCTACATGCTTGGGTGTGTATGAGTCAGTTAAATAAACAAAGAGTAAACGTACTCTTTGTAACGGTAATAATTTCGCTTCGGTGCTGTTGTTGTAAGTGCGATGACTTACTGTGCTACAGTGACATTTGTTGTTTTTCCAGTAGACATAAGCTTATTTTTTGATCATCTCAGTAGACTTTATTTCTCATTTTGTAGATATCTGAGTGCATGGAAGCCCTCAGACAGGCGGAAACAAAGCTTTGTAGATTTGTTCCAACAAATCAGTTAACAGTAAAAGGTGTGGGTAACTTCCACGGCCGAGTTTTATATGCAGCAGTTGAGTCCAATGAAAATTTGAATTTGTTTGTCGATCAGCTAAATCAGATTCTACATGTGGCCGGATTCCATACCGATGATCCG ]
[-] EMBL CD187337 [ GCTTTGTAGATTGGTTCCAACAAATCAGTTAACAGTAAAAGGTGTGGGTAACTTCCACGGCCGAGTTTTATATGCAGCAGTTGAGTCCAATGAAAATTTGAATTTGTTTGTCGATCAGCTAAATCAGATTCTACATGTGGCCGGATTCCATACAGATGATCAGAAAAAGTTTAAACCTCATATCTCTCTGATGAAGATGAATCGTTCAGTATCAAAAAAAGTTGGTACGAAAAAAGTCGACCCCAATCTGTGTGGTGAATTTCTAGATACGGAGTTTGGAGTATTCACTCTAGATTCAATTTACCTGTGTGCAATGGGAAGACACCATGATGATGATGGTGGTTTCTATCGTACTATCGGAAATTTACATCTTGTAAATCCGATTTCTAAATAAGGTGATTTTTGTAAACTTACTG ]
[-] EMBL CD140390 [ GGAGTATTCACTCTAGATTCAATTGACCTGTGTGCAATGGGAAGACACCATGATGATGATGGTGGTTTCTATCGTACTATCGGAAATTTACATCTTGTAAATCCGATTTCTAAATAAGGTGATTTTTGTAAACTTACTGTATATTTCCCGTGATATTTTAATAACTTTTTCCTCGAGTCAACCAAATATTAGTGTTGTCCATTATTTTATTTCTCAAAATCTTGATTTCAGTAGCTATACAATGTATACTGTTAAATATTTTTCTGGTCGCAGTTTACTCACACGGTTACATTATCAGTTTTAATAATCACTGTTTTAGGGGTGGACAGTTTCGTCTACGAACAGTAGCAAAATATTGCCTACTTGCACGTCCCAAGAAGCTTTAAAACTCATATTGCTTGTCAGCAGCCCTCTTCATCT ]
[-] EMBL CD183159 [ nATCAGTTTTAATAATCACTGTTTTAGGGGTGGACAGTTTCGTCTACGAACAGTAGCAAAGTATTGCCTACTTGCACGTCCCAAGAAGCTTTAAAACTCATATTGCTTGTCAGCAGCCCTCTTCATCTTTTGAGTTCCTCTTACATTTGTTGTTTTCATGTCGATATTGTGAATATGACTGCTATTACAACCATTTAATTTATAACTAACTAAAAA]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||