cluster # 6142

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 6142 cluster # 6142 Sequences # 4 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_6142#0 length = 789 sequences # 4

consensusID : consensus_6142#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 789
fasta sequence

                              [TTAAAGTTTAACTTTAGAGGTTCTAGTTACGAAGTTTATAAAACCTGATAGAACCTCCAGAGAAAAAAAACACTAAAGCACTTATTTTCTTTTCTTATGATGTACCACTTGAACGCTTGTTATTTCTATTATTAAAAGGGTGTATATTCAAAGTTTTTTAGAGTAAAGTGGTTAAATTGGAAAACAATACGGTGAGGTGAGGTAGGTAGTGCAAAGGAATACAGGAATACAATATCGATTTTATCCGGTCAGATATATTTAATTTGATGGGACAAGTTCCAAGTGAAGTGGTTCATTTGACTCAACTAATAATCTCCACTCCTAAGAAAAACTAACAATGATACAGATCTTATTTTAAGATAGAAAAATAATTATACTTTTACGAACTGAAAATTAATAAAGTATGTTTTTGAGCAACTAATTAGACCATCTATTTCGGTAAACTAGTTCAACTGATCAATTCTCAATAGAAATTTATAATAATACTATCTAACTAATACAATATGTTGCCGACCTCGGTTTTATCAGAATGAGAAGTGAGCAAACGATTATCACAGATGGTAAGTTAAATGATTTAGGAATTTATTATGATACTCATTTGTCAAATAAGTGAGTATTTGTTCTTCAATAAATTAAAACCATTTGAAATGGGACATTATCAAATGGTACTTAGTTAACTTAGTTATGATCTCAAAAACAGGAAAGAAAATATGTTCATAATAATTGCACAAATAAGAATTTTATCTCACTTTACATGAAGGAAACAACTAAGATTTATTGAAAAAGGAG]

[+] EMBL CD140367             [TTAAAGTTTAACTTTAGAGGTTCTAGTTACGAAGTTTATAAAACCTGATAGAACCTCCAGAGAAAAAAAACACTAAAGCACTTATTTTCTTTTCTTATGATGTACCACTTGAACGCTTGTTATTTCTATTATTAAAAGGGTGTATATTCAAAGTTTTTTAGAGTAAAGTGGTTAAATTGGAAAACAATACGGTGAGGTGAGGTAGGTAGTGCAAAGGAATACAGGAATACAATATCGATTTTATCCGGTCAGATATATTTAATTTGATGGGACAAGTTCCAAGTGAAGTGGTTCATTTGACTCAACTAATAATCTCCACTCCTAAGAAAAACTAACAATGATACAGATCTTATTTTAAGATAGAAAAATAATTATACTTTTACGAACTGAAAATTAATAAAGTATGTTTTTGAGCAACTAATTAGACCATCTATTTCGGTAAACTAGTTCAACTGATCAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CD140454             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TATTTTAAGATAGAAAAATAATTATACTTTTACGAACTGAAAATTAATAAAGTATGTTTTTGAGCAACTAATTAGACCATCTATTTCGGTAAACTAGTTCAACTGATCAATTCTCAATAGAAATTTATAATAATACTATCTAACTAATACAATATGTTGCCGACCTCGGCTTTATCAGAATGAGAAGTGAGCAAACGATTATCACAGATGGTAAGTTAAATGATTTAGGAATTTATTATGATACTCATTTGTCAAATAAGTGAGTATTTGTTCTTCAATAAATTAAAACCATTTGAAATGGGACATTATCAAATGGTACTTAGTTAACTTAGTTATGATCTCAAAAACAGGAAAGAAAATATGTTCATAATAATTGCACAAATAAGAATTTTATCTCACTTTACGTGAAGGAAACAACTAAGATTTATTGAAAAAGGAG]
[-] EMBL CD140370             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ATTTTAAGATAGAAAAATAATTATACTTTTACGAACTGAAAATTAATAAAGTATGTTTTTGAGCAACTAATTAGACCATCTATTTCGGTAAACTAGTTCAACTGATCAATTCTCAATAGAAATTTATAATAATACTATCTAACTGATACAATATGTTGCCGACCTCGGTTTTATCAGAATGAGAAGTGAGCAAACGATTATCACAGATGGTAAGTTAAATGATTTAGGAATTTATTATGATACTCATTTGTCAAATAAGTGAGTATTTGTTCTTCAATAAATTAAAACCATTTGAAATGGGACATTATCAAATGGTACTTAGTTAACTTAGTTATGATCTCAAAAACAGGAAAGAAAATATGTTCATAATAATTGCACAAATAAGAATTTTATCTCACTTTACATGAAGGAAACAACTAAGATTTATTGAAAAAGGAG]
[-] EMBL CD140341             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 CAACTGATCAATTCTCAATAGAAATTTATAATAATACTATCTAACTAATACAATATGTCGCCGACCTCGGTTTAATCAGAATGAGAAGTGAGCAAACGATTATCACAGATGGTAAGTTAAATGATTTAGGAATTTATTATGATACTCATTTGTCAAATAAGTGAGTATTTGTTCTTCAATAAATTAAAACCATTTGAAATGGGACATTATCAAATGGTACTTAGTTAACTTAGTTATGATCTCAAAAACAGGAAAGAAAATATGTTCATAATAATTGCACAAATAAGAATTTTATCTCACTTTACATGAAGGAAACAACTAAGATTTATTGAAAAAGGAG]




>consensus_6142#0
TTAAAGTTTAACTTTAGAGGTTCTAGTTACGAAGTTTATAAAACCTGATAGAACCTCCAG
AGAAAAAAAACACTAAAGCACTTATTTTCTTTTCTTATGATGTACCACTTGAACGCTTGT
TATTTCTATTATTAAAAGGGTGTATATTCAAAGTTTTTTAGAGTAAAGTGGTTAAATTGG
AAAACAATACGGTGAGGTGAGGTAGGTAGTGCAAAGGAATACAGGAATACAATATCGATT
TTATCCGGTCAGATATATTTAATTTGATGGGACAAGTTCCAAGTGAAGTGGTTCATTTGA
CTCAACTAATAATCTCCACTCCTAAGAAAAACTAACAATGATACAGATCTTATTTTAAGA
TAGAAAAATAATTATACTTTTACGAACTGAAAATTAATAAAGTATGTTTTTGAGCAACTA
ATTAGACCATCTATTTCGGTAAACTAGTTCAACTGATCAATTCTCAATAGAAATTTATAA
TAATACTATCTAACTAATACAATATGTTGCCGACCTCGGTTTTATCAGAATGAGAAGTGA
GCAAACGATTATCACAGATGGTAAGTTAAATGATTTAGGAATTTATTATGATACTCATTT
GTCAAATAAGTGAGTATTTGTTCTTCAATAAATTAAAACCATTTGAAATGGGACATTATC
AAATGGTACTTAGTTAACTTAGTTATGATCTCAAAAACAGGAAAGAAAATATGTTCATAA
TAATTGCACAAATAAGAATTTTATCTCACTTTACATGAAGGAAACAACTAAGATTTATTG
AAAAAGGAG

clustalw multiple alignements is not computed in this case