cluster # 6167

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Schistosoma mansoni
cluster # 6167 cluster # 6167 Sequences # 4 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_6167#0 length = 695 sequences # 4

consensusID : consensus_6167#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 695
fasta sequence

                              [TTTGAACATGAAACGATTGATCGTAAGTTTTTCAGTTTGTCTTTTTTTAGCTATTCGAGATATGCGTAGTTAAGACAGTTACACTATTTTGGGTTATTACTGTAATGCATGCAATCATCAAAGCAAAGCTTTTATTACCATTAAATGTTGTAATTTTCCAAACAAATACGTACAAAGAGGACAAAGTTAGGGATTGACAAAAGTAACGAAGATGTACCGTGTCCCTCCTGTCGTTGGTAGTCCTTCGTGTAGATGAGTCACTCTTCCTGGACTAACCAATGCCCACCCAACACGCGTATCTACTATTGAGCAGTTGTATCGATTGTAGCGTATTCCACCCCCCTGTAAATGAAAGGAATACGTTTAATTCTCTGCTCTAATAAGTGTTTTACTCTTGTCAAGAATTACTCACTTTGTAGTCTTTTCCAGGCTGGTTTAGTCCAATATTAATTGTGTAAGAGGATGCATCGTGGTGAGGTCTCAAGGAAGGTTGTTCGTCTGGTTTGTATCTGACGACAAAATTCATGCGAGCCCATGGCTACAATAATGTACAGATGAAATCACAGTTATTATGAAATATTAAATGGGTGCATCATTTCATATTGGAGAGTACATACCTTATCATCATACCCTTGAAAGAGTTTCTTTTGGATCTTATGGACGTATTTTTCTAGAACATGCAGCCAGTGCTCCTC]

[+] EMBL CD079364             [TTTGAACATGAAACGATTGATCGTAAGTTTTTCAGTTTGTCTTTTTTTAGCTATTCGAGATATGCGTAGTTAAGACAGTTACACTATTTTGGGTTATTACTGTAATGCATGCAATCATCAAAGCAAAGCTTTTATTACCATTAAATGTTGTAATTTTCCAAACAAATACGTACAAAGAGGACAAAGTTAGGGATTGACAAAAGTAACGAAGATGTACCGTGTCCCTCCTGTCGTTGGTAGTCCTTCGTGTAGATGAGTCACTCTTCCTGGACTAACCAATGCCCACCCAACACGCGTATCTACTATTGAGCAGTTGTATCGATTGTAGCGTATTCCACCCCCCTGTAAATGAAAGGAATACGTTTAATTCTCTGCTCTAATAAGTGTTTTACTCTTGTCAAGAATTACTCACTTTGTAGTCTTTTCCAGGCTGGTTTAGTCCAATATTAATTGTGTAAGAGGATGCATCGTGGTGAGGTCTCAAGGAAGGTTGTTCGTCTGGTTTGTATCTGACGACAAAATTCATGCGAGCCCATGGCTACAATAATGTACAGATGAAATCACAGTTATTATGANATATTAAATGGGTGCATCATTTCATATTGGAGAGTACATACCTTATCATCATACCCTTGAAAGAGTTTCTTTTGGATCTTATGGACGTATTTTTCTAGAACATGCAGCCAGTGCTCCTC]
[+] EMBL CD094745             [                                                                           CAGTTACACTATTTTGGGTTATTACTGTAATGCATGCAATCATCAAAGCAAAGCTTTTATTACCATTAAATGTTGTAATTTTCCAAACAAATACGTACAAAGAGGACAAAGTTAGGGATTGACAAAAGTAACGAAGATGTACCGTGTCCCTCCTGTCGTTGGTAGTCCTTCGTGTAGATGAGTCACTCTTCCTGGACTAACCAATGCCCACCCAACACGCGTATCTACTATTGAGCAGTTGTATCGATTGTAGCGTATTCCACCCCCCTGTAAATGAAAGGAATACGTTTAATTCTCTGCTCTAATAAGTGTTTTACTCTTGTCAAGAATTACTCACTTTGTAGTCTTTTCCAGGCTGGTTTAGTCCAATATTAATTGTGTAAGAGGATGCATCGTGGTGAGGTCTCAAGGAAGGTTGTTCGTCTGGTTTGTATCTGACGACAAAATTCATGCGAGCCCATGGCTACAATAATGTACAGATGAAATCACAGTTATTATGAAATATTAAATGGGTGCATCATTTCATATTGGAGAGTACATACCTTATCATCATACCCTTGAAAGAGTTTCTTTTGGATCT                                        ]
[+] EMBL CD095892             [                                                                                                                                                                                              GGATTGACAAAAGTAACGAAGATGTACCGTGTCCCTCCTGTCGTTGGTAGTCCTTCGTGTAGATGAGTCACTCTTCCTGGACTAACCAATGCCCACCCAACACGCGTATCTACTATTGAGCAGTTGTATCGATTGTAGCGTATTCCACCTCCCTGTAAATGAAAGGAATACGTTTAATTCTCTGCTCTATTAAGTGTTTTACTCTTGTCAAGAATTACTCACCTTGTAGTCTTTTCCAGGCTGGTTTAGTCCAATATTAATTGTGTAAGAGGATGCGTCGTGGTGAGGTCTCAAGGAAGGTTGTTCGTCTGGTTTGTATCTGACGACAAAATTCATGCGAGCCCATGGCTACAATAATGTACAGATGAAATCACAGCTATTATGAAATATTAAATGGGTGCATCATTTCATATTGGAGAGTACATACCTTATCATCATACCCTTGAAAGAGTTTCTTTTGGATCTTATGGACGTATTTTTCTAGAACATG               ]
[-] EMBL CD095614             [                                                                                                                                                                                               GATTGACAAAAGTAACGAAGATGTACCGTGTCCCTCCTGTCGTTGGTAGTCCTTCGTGTAGATGAGTCACTCTTCCTGGACTAACCAATGCCCACCCAACACGCGTATCTACTATTGAGCAGTTGTATCGATTGTAGCGTATTCCACCTCCCTGTAAATGAAAGGAATACGTTTAATTCTCTGCTCTAATAAGTGTTTTACTCTTGTCAAGAATTACTCACTTTGTAGTCTTTTCCAGGCTGGTTTAGTCCAATATTAATTGTGTAAGAGGATGCATCGTGGTGAGGTCTCAAGGAAGGTTGTTCGTCTGGTTTGTATCTGACGACAAAATTCATGCGAGCCCATGGCTACAATAATGTACAGATGAAATCACAGTTATTATGAAATATTAAATGGGTGCATCATTTCATATTGGAGAGTACATACCTTATCATCATACCCTTGAAAGAGTTTCTTTTGGATCTTATGGACGTATTTTTCTAGAACATGC              ]




>consensus_6167#0
TTTGAACATGAAACGATTGATCGTAAGTTTTTCAGTTTGTCTTTTTTTAGCTATTCGAGA
TATGCGTAGTTAAGACAGTTACACTATTTTGGGTTATTACTGTAATGCATGCAATCATCA
AAGCAAAGCTTTTATTACCATTAAATGTTGTAATTTTCCAAACAAATACGTACAAAGAGG
ACAAAGTTAGGGATTGACAAAAGTAACGAAGATGTACCGTGTCCCTCCTGTCGTTGGTAG
TCCTTCGTGTAGATGAGTCACTCTTCCTGGACTAACCAATGCCCACCCAACACGCGTATC
TACTATTGAGCAGTTGTATCGATTGTAGCGTATTCCACCCCCCTGTAAATGAAAGGAATA
CGTTTAATTCTCTGCTCTAATAAGTGTTTTACTCTTGTCAAGAATTACTCACTTTGTAGT
CTTTTCCAGGCTGGTTTAGTCCAATATTAATTGTGTAAGAGGATGCATCGTGGTGAGGTC
TCAAGGAAGGTTGTTCGTCTGGTTTGTATCTGACGACAAAATTCATGCGAGCCCATGGCT
ACAATAATGTACAGATGAAATCACAGTTATTATGAAATATTAAATGGGTGCATCATTTCA
TATTGGAGAGTACATACCTTATCATCATACCCTTGAAAGAGTTTCTTTTGGATCTTATGG
ACGTATTTTTCTAGAACATGCAGCCAGTGCTCCTC

clustalw multiple alignements is not computed in this case