cluster # 6174

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Schistosoma mansoni
cluster # 6174 cluster # 6174 Sequences # 4 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_6174#0 length = 522 sequences # 4

consensusID : consensus_6174#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 522
fasta sequence

                              [TTTTCCATTTAATCGGATTCTGACGAAGCCAGCGACATGCAACTTGTTTATATGTTGACTGACGATCTATATTTGAGTCGAGTAAGGCTGAGTGCACCAATTCGCCCAATTCATCATGAGACATATACATTTTAGATGCAAGTTGAAAAATTTGTGGAGCTGCCGTTCGTAATTTAGCCCATGTCACTTTAACAGCTTGATAAGATTCAGTGTAACAATATTGATAACTATTTGTTGAGGTAGATTTTGTATCAGTACTGCACAAAGGGGGTGGAGGAATACTATAAGAATTATACCGTAAACATGTTGAATTTAATTCAAAATCCAAAATAGTTACTGACTTCCCAGAGAGTAAGCTATGATTATTGAGTAAATCTGAATTCTGTACACTCTCCGTTTGATAACCTGAGTAGTTTTGACTAACGGTGTCCACAGTTGAGCTACAATCATATTTAAGGGAAGTATAGTTAGGATTTCCTCTGAGATGTGATTTGTTGTAACAGGANNGNGTTAGAAGTTTCC]

[+] EMBL CD159921             [TTTTCCATTTAATCGGATTCTGACGAAGCCAGCGACATGCAACTTGTTTATATGTTGACTGACGATCTATATTTGAGTCGAGTAAGGCTGAGTGCACCAATTCGCCCAATTCATCATGAGACATATACATTTTAGATGCAAGTTGAAAAATTTGTGGAGCTGCCGTTCGTAATTTAGCCCATGTCACTTTAACAGCTTGATAAGATTCAGTGTAACAATATTGATAACTATTTGTTGAGGTAGATTTTGTATCAGTACTGCACAAAGGGGGTGGAGGAATACTATAAGAATTATACCGTAAACATGTTGAATTTAATTCAAAATCCAAAATAGTTACTGACTTCCCAGAGAGTAAGCTATGATTATTGAGTAAATCTGAATTCTGTACACTCTCCGTTTGATAACCTGAG                                                                                                                ]
[+] EMBL CD159947             [TTTTCCATTTAATCGGATTCTGACGAAGCCAGCGACATGCAACTTGTTTATATGTTGACTGACGATCTATATTTGAGTCGAGTAAGGCTGAGTGCACCAATTCGCCCAGTTCATCATGAGACATATACATTTTAGATGCAAGTTGAAAAATTTGTGGAGCTGCCGTTCGTAATTTAGCCCATGTCACTTTAACAGCTTGATAAGATCCAGTGTAACAATATTGATAACTATTTGTTGAGGTAGATTTTGTATCAGTACTGCACAAAGGGGGTGGAGGAATACTATAAGAATTATACCGTAAACATGTTGAATTTAATTCAAAATCCAAAATAGTTACTGACTTCCCAGAGAGTAAGCTATGATTATTGAGTAAATCTGAATTCTGTACACTCTCCGTT                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD147603             [                                        AACTTGTTTATATGTTGACTGACGATCTATATTTGAGTCGAGTAAGGCTGAGTGCACCAATTCGCCCAATTCATCATGAGACATATACATTTTAGATGCAAGTTGAAAAATTTGTGGAGCTGCCGTTCGTAATTTAGCCCATGTCACTTTAACAGCTTGATAAGATTCAGTGTAACAATATTGATAACTATTTGTTGAGGTAGATTTTGTATCAGTACTGCACAAAGGGGGTGGAGGAATACTATAAGGATTATACCGTAAACATGTTGAATTTAATTCAAAATCCAAAATAGTTACTGACTTCCCATAGAGTAAGCTATGATTATTGAGTAAATCTGAATTCTGTACACTCTCCGTTTGATAACCTGAGTAGTTTTGACTAACGGTGTCCACAGTTGAGCTACAATCATATTTAAGGGAAGTATAGTTAG                                                   ]
[-] EMBL CD201694             [                                                                                                                                                                                                                                                                 CTGCACAAAGGGGGTGGAGGAATACTATAAGAATTATACCGTAAACATGTTGAATTTAATTC  AATCCAAAATAGTTACTGACTTCCCAGAGAGTAAGCTATGATTATTGAGTAAATCTGAATTCTGTACACTCTCCGTTTGATAACCTGAGTAGTTTTGACTAACGGTGTCAACAGTTGAGCTACAATCATATTTAAGGGAAGTATAGTTAGGATTTCCTCTGAGATGTGATTTGTTGTAACAGGANNGNGTTAGAAGTTTCC]




>consensus_6174#0
TTTTCCATTTAATCGGATTCTGACGAAGCCAGCGACATGCAACTTGTTTATATGTTGACT
GACGATCTATATTTGAGTCGAGTAAGGCTGAGTGCACCAATTCGCCCAATTCATCATGAG
ACATATACATTTTAGATGCAAGTTGAAAAATTTGTGGAGCTGCCGTTCGTAATTTAGCCC
ATGTCACTTTAACAGCTTGATAAGATTCAGTGTAACAATATTGATAACTATTTGTTGAGG
TAGATTTTGTATCAGTACTGCACAAAGGGGGTGGAGGAATACTATAAGAATTATACCGTA
AACATGTTGAATTTAATTCAAAATCCAAAATAGTTACTGACTTCCCAGAGAGTAAGCTAT
GATTATTGAGTAAATCTGAATTCTGTACACTCTCCGTTTGATAACCTGAGTAGTTTTGAC
TAACGGTGTCCACAGTTGAGCTACAATCATATTTAAGGGAAGTATAGTTAGGATTTCCTC
TGAGATGTGATTTGTTGTAACAGGANNGNGTTAGAAGTTTCC

clustalw multiple alignements is not computed in this case