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Schistosoma mansoni
cluster # 6178 cluster # 6178       Sequences # 4       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6178#0 length = 826 sequences # 4  
consensusID : consensus_6178#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 826
fasta sequence 
                              [ATACCAGCCATGATTTCCCTTTTTTGGTATACTGTTACTATTTTGAATAAAATACCACCTTGTTCAGTGTTCTCATTTCTTATAATCTATCAATTTTCTTCGATCACCTAAAATTCACAGGACTAACGAACGTGACCTTCAATAAAATGTATCCAAGAAGAAATGTATAAAAAAATGTTAAACTGATAATTAGTATTCATTAAAGAGTACTTAAAGAGTACAACAATCAACTAGCTTTGATAGAAAATTCACGTAGGTCCAGTAAGAAGCTATGACCATGTCAAGTATGGCGTAGTTACTAACCGAAGACCATGAAAGATGGTCGCTCAATATCGTGAACTGATTGAAGTTAGACATTAACATATTCGGATGCAAGCTCAGTGTACTCAAGCGAGTCTGAATGCTCTAGGTTCGATTCCCCTTTTGGTCAGAGATCGTTGATCCCCACTACCGAAAAGTCCCTTACTAAGATAATATGGCTATCCATTGCTTCCATATTTTCACTGATAGCCTAACTTCGGTTCAAAAATTCAACAGAATACAACAATCTCCATAACCATATATATACAAAATATTATTTTTCATAGTCACTATTAATATTTTCTATCAAAACTATTGTTCCAATTTTCACTTTATAACCTTGATTTTGTTAGGTTGCGGTATACACTTATCATACTACAATAGTACTGTACTGCCTGTATTATTT-CCAATACAGAACGTATATATATGTATATATAC-ATATGCC-TTTGTGTGACCTGCTTCTGTACTATGATGCAAATTATTTTATTGATCAGTT-TATAGTTGTATCCCTTTCATTCACAATTAC]

[+] EMBL CD085964             [ATACCAGCCATGATTTCCCTTTTTTGGTATACTGTTACTATTTTGAATAAAATACCACCTTGTTCAGTGTTCTCATTTCTTATAATCTATCAATTTTCTTCGATCACCTAAAATTCACAGGACTAACGAACGTGACCTTCAATAAAATGTATCCAAGAAGAAATGTATAAAAAAATGTTAAACTGATAATTAGTATTCATTAAAGAGTACTTAAAGAGTACAACAATCAACTAGCTTTGATAGAAAATTCACGTAGGTCCAGTAAGAAGCTATGACCATGTCAAGTATGGCGTAGTTACTAACCGAAGACCATGAAAGATGGTCGCTCAATATCGTGAACTGATTGAAGCTAGACATTAACATATTCGGATGCAAGCTCAGTGTACTCAAGCGAGTCTGAATGCTCTAGGTTCGATTCCCCTTTTGGTCAGAGATCGTTGATCCCCACTACCGAAAAGTCCCTTACTAAGATAATATGGCTATCCATTGCTTCCATATTTTCACTGATAGCCTAACTTCGGTTCAAAAATTCAACAGAATACAACAATCTCCATAACCATATATATACAAAATATTATTTTTCATAGTCACTATTAATATTTTCTATCAAAACTATTGTTCCAAATTTCACTTTATAACCTTGATTTTGTTAGGTTGCGGTATACACTTATCATACTACAATAGTACTGTACTGCCTGTATTATTT CCAATACAGAACGTATATATATGTATATATACAATATGCC TTTGTGTGACCTGCTTCTGTACTATGATGCAAATNATTTTATTGATCAGTT TATAGTTGTATCCCTTTCATTCACAATTA ]
[+] EMBL CD085917             [cTACCAGCCATGATTTCCCTTTTTTGGTATACTGTTACTATTTTGAATAAAATACCACCTTGTTCAGTGTTCTCATTTCTTATAATCTATCAATTTTCTTCGATCACCTAAAATTCACAGGACTAACGAACGTGACCTTCAATAAAATGTATCCAAGAAGAAATGTATAAAAAAATGTTAAACTGATAATTAGTATTCATTAAAGAGTACTTAAAGAGTACAACAATCAACTAGCTTTGATAGAAAATTCACGTAGGTCCAGTAAGAAGCTATGACCATGTCAAGTATGGCGTAGTTACTAACCGAAGACCATGAAAGATGGTCGCTCAATATCGTGAACTGATTGAAGTTAGACATTAACATATTCGGATGCAAGCTCAGTGTACCCAAGCGAGTCTGAATGCTCTAGGTTCGATTCCCCTTTTGGTCAGAGATCGTTGATCCCCACTACCGAAAAGTCCCTTACTAAGATAATATGGCTATCCATTGCTTCCATATTTTCACTGATAGCCTAACTTCGGTTCANAAATTCAACAGAATACAACAATCTCCATAACCATATATATACAAAATATTATTTTTCATAGTCACTATTAATATTTTCTATCAAAACTATTGTTCCAATTTTCACTTTATAACCTTGATTTTGTTAGGTTGCGGTATACACTTATCATACTACAATAGTACTGTACTGCCTGTATTATNT CCCATACAGAACGTATATATATGTATATATAC ATATGCCTTTTGTGTGACCTGCTTCTGTACTATGATGCAAATTATNNTATTGATCAGTTNNATAG TGTATCCC TTCAATCACnaa   ]
[+] EMBL CD086300             [                                                                                                                                                                                                          agcAGTACTTTAAGAGTACAACAATCAACTAGCTTTGATAGAAAATTCACGTAGGTCCAGTAAGAAGCTATGACCATGTCAAGTATGGCGTAGTTACTAACCGAAGACCATGAGAGATGGTCGCTCAATATCGCGAAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD085935             [                                                                                                                                                                                                                                                TAGAAANTTCACGTAGGTCCAGTAAGAAGCTATGACCATGTCAAGTATGGCGTAGTTACTAACCGAAGACCATGAAAGATGGTCGCTCAATATCGTGAACTGATTGAAGTTAGACATTAACATATTCGGATGCAAGCTCAGTGTACTCAAGCGAGTCTGAATGCTCTAGGTTCGATTCCCCTTTTGGTCAGAGATCGTTGATCCCCACTACCGAAAAGTCCCTTACTAAGATAATATGGCTATCCATTGCTTCCATATTTTCACTGATAGCCTAACTTCGGTTCAAAAATTCAACAGAATACAACAATCTCCATAACCATATATATACAAAATATTATTTTTCATAGTCACTATTAATATTTTCTATCAAAACTATTGTTCCAATTTTCACTTTATAACCTTGATTTTGTTAGGTTGCGGTATACACTTATCATACTACAATAGTACTGTACTGCCTGTATTATTTCCCAATACAGAACGTATATATATGTATATATAC ATATGCT TTTGTGTGACCTGCTTCTGTACTATGATGCAAATTATTTTATTGATCAGTT TATAGTTGTATCCCTTCAATTCACAATTAC]




>consensus_6178#0
ATACCAGCCATGATTTCCCTTTTTTGGTATACTGTTACTATTTTGAATAAAATACCACCT
TGTTCAGTGTTCTCATTTCTTATAATCTATCAATTTTCTTCGATCACCTAAAATTCACAG
GACTAACGAACGTGACCTTCAATAAAATGTATCCAAGAAGAAATGTATAAAAAAATGTTA
AACTGATAATTAGTATTCATTAAAGAGTACTTAAAGAGTACAACAATCAACTAGCTTTGA
TAGAAAATTCACGTAGGTCCAGTAAGAAGCTATGACCATGTCAAGTATGGCGTAGTTACT
AACCGAAGACCATGAAAGATGGTCGCTCAATATCGTGAACTGATTGAAGTTAGACATTAA
CATATTCGGATGCAAGCTCAGTGTACTCAAGCGAGTCTGAATGCTCTAGGTTCGATTCCC
CTTTTGGTCAGAGATCGTTGATCCCCACTACCGAAAAGTCCCTTACTAAGATAATATGGC
TATCCATTGCTTCCATATTTTCACTGATAGCCTAACTTCGGTTCAAAAATTCAACAGAAT
ACAACAATCTCCATAACCATATATATACAAAATATTATTTTTCATAGTCACTATTAATAT
TTTCTATCAAAACTATTGTTCCAATTTTCACTTTATAACCTTGATTTTGTTAGGTTGCGG
TATACACTTATCATACTACAATAGTACTGTACTGCCTGTATTATTTCCAATACAGAACGT
ATATATATGTATATATACATATGCCTTTGTGTGACCTGCTTCTGTACTATGATGCAAATT
ATTTTATTGATCAGTTTATAGTTGTATCCCTTTCATTCACAATTAC

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)