|
These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6199#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 841 fasta sequence
[GGAGGACACTGAGGCTAGTCAATCAGAGTGGAGCTTATGTAAATGAAATGGATATCACGAAAAGATGTTGAAGTTATAGAGAATGTAAAGTTTTAGAATGCTAACATCCGAACTGTATTATCCTAGACGTAATACTCTTAAAACAATCTCATTTCTCGACCTCATACATTCATTGCATATCGTTTCCTGACCACAACGACTTGAGATGCTCTTTTTCAATAATTGTTATCCGTTATTCTGGGATGTTTGTAAGAATATAAGCAAAGATGGATAGTGACTAGCAATGGAATTCAGGACGCGCGTTTCATCCTATTTGGGGCTCGTCAGCTGGATGTACTTGCATCTCAGAGTTAATGTTCACTCAGTGACTCGAACCTAGTACCCCTCGCTTTAGACGCCATCACGTTATCTGCTTAGATACTGAGTCCTGATAGTCAATTGCTTGTGCAATATGATATGCTCATACGCCAATAAGAGACTGACCAATTGCAGTCTGTTATGCCCCGATAAGGATA-ATGAATGGTAACTTTGGGATCCATTTGTAGACCAATAATATGCATATATATTTTTTATCGTATAATCGCTAAATAACTAAACTATTCATATTTGTGTCCCCCTTATTATAAGCTTTATTTTGACCCATATACTATTATTATACGATTTACCATTCATGAATTACGCCGTTTCCTAATTACTGTTTCCCCCTATTCATAGCTACATTTGGCTAAATCTTGTTATTTTCTATTTTATGGTACTATGTGGCCAGTTTGATAGGTATATAAACTCAGTATTTTTGAAATATAATGATTTACACCTCAGAG-ACTGAGATTGGTGTTCTGGA]
[+] EMBL CD113296 [GGAGGACACTGAGGCTAGTCAATCAGAGTGGAGCTTATGTAAATGAAATGGATATCACGAAAAGATGTTGAAGTTATAGAGAATGTAAAGTTTTAGAATGCTAACATCCGAACTGTATTATCCTAGACGTAATACTCTTAAAACAATCTCATTTCTCGACCTCATACATTCATTGCATATCGTTTCCTGACCACAACGACTTGAGATGCTCTTTTTCAATAATTGTTATCCGTTATTCTGGGATGTTTGTAAGAATATAAGCAAAGATGGATAGTGACTAGCAATGGAATTCAGGACGCGCGTTTCATCCTATTTGGGGCTCGTCAGCTGGATGTACTTGCATCTCAGAGTTAATGTTCACTCAGTGACTCGAACCTAGTACCCCTCGCTTTAGACGCCATCACGTTATCTGCTTAGATACTGAGTCCTGATAGTCAATTGCTTGTGCAATATGATATGCTCATACGCCAATAAGAGACTGACCAATTGCAGTCTGCTATGCCCCGATAAGGATA ATGAATGGTAACTTTGGGATCCATTTGTAGACCAATAATATGCATATATATTTTTTATCGTATAATCGCTAAATAACTAAACTATTCATATTTGTGTCCCCCTTATTATAAGCTTTATTTTGACCCATATACTATTATTATACGATT ]
[-] EMBL CD113343 [ TGTTATCCGTTATTCTGGGATGTTTGTAAGAGTATAAGCAAAGATGGATAGTGACTAGCAATGGAATTCAGGACGCGCGTTTCATCCTATTTGGGGCTCGTCAGCTGGATGTACTTGCATCTCAGAGTTAATGTTCACTCAGTGACTCGAACCTAGTACCCCTCGCTTTAGACGCCATCACGTTATCTGCTTAGATACTGAGTCCTGATAGTCAATTGCTTGTGCAATATGATATGCTCATACGCCAATAAGAGACTGACCAATTGCAGTCTGTTATGCCCCGATAAGGATA ATGAATGGTAACTTTGGGATCCATTTGTAGACCAATAATATGCATATATATTTTTTATCGTATAATCGCTAAATAACTAAACTATTCATATTTGTGTCCCCCTTATTATAAGCTTTATTTTGACCCATATACTATTATTATACGATTTACCATTCATGAATTACGCCGTTTCCTAATTACTGTTTCCCCCTATTCATAGCTACATTTGGCTAAATATTGTTATTTTCTATTTTATGGTACTATGTGGTCAGTTTGATAGGTATATAAACTCAGTATTTTTGAAATATAATGATTTACACCTCAGAG ACTGAGATTGGTGTTCTGGA]
[-] EMBL CD113399 [ ACGTTATCTGCTTAGATACTGAGTCCTGATAGTCAATTGCTTGTGCAATATGATATGCTCATACGCCAATAAGAGACTGACCAATTGCAGTCTGTTATGCCCCGATAAGGATACATGAATGGTAACTCTGGGATCCATTTGTAGACCAATAATATGCATATATATTTTTTATCGTATAATCGCTAAATAACTAAACTATTCATATTTGTGTCCCCCTTATTATAAGCTTTATTTTGACCCATATACTATTATTATACGATTTACCATTCATGAATTACGCCGTTTCCTAATTACTGTTTCCCCCTATTCATAGCTACATTTGGATAAATCTTGTTATTTTCTATTTTATGGTACTATGTGGCCAGTTTGATAGGTATATAAACTCAGTATTTTTGAAATATAATGATTTACACCTCAGAG ACTGAGATTGGTGTTATGGA]
[-] EMBL CD113433 [ TCCCCCTATTCATAGCTACATTTGGCTAAATCTTGTTATTTTCAAATANAAGGTACTATGTGGCCAGTTTGATAGGTATATAAACTCAGTATTTTTGAAATATAATGATTTACACCTCAGAGAACTGAc ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||