cluster # 6204

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Schistosoma mansoni
cluster # 6204 cluster # 6204 Sequences # 4 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_6204#0 length = 538 sequences # 4

consensusID : consensus_6204#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 538
fasta sequence

                              [ATACCAGCCAGCAAGCGTGAGTACTCGTCTATTAGCTCAAGCTGTTCTCCGGAAACCCGGTACCCCCACTCCTCCAATTGACGCCTGACGAGCCCTAAGGTTTCGTGTTTCACGTGGAACACAACCCCAAACGCAACGGCAACCTTAGCTTGCGACAAAAGTTTGCGCCCACAATCTCATGACGCACCTCGTTCTTTCCTTGCTGGTGAGGGCGTGTTTCACGTGAAACGTTTACCGCTTTGGTGCGACGGTCACCCTACGGTTTGCTCCGCTACCTTCGCTGAACGTGGTAACCCGCGGGTTATCTTTAAGGTAGACGTGGACGATGCGCCGCTCTGCGGGGCTCATTGGGGGGAGCTTGATTGAGCGCCGCTCCCGTATTGCTCTACGGGCACTCCGGTGGGCGATACCCTGTATCGCCTCTATCCTGCGCTGGCGGTAACCTTCGGAGTCCAGAACTATACGCTTTACGAATGGTCTGGTGCGGTAGACGGCGGAGTTGATCAGGTACTGGAGAGCGTCAATCGTCTCTCCCTTT]

[+] EMBL CD086075             [ATACCAGCCAGCAAGCGTGAGTACTCGTCTATTAGCTCAAGCTGTTCTCCGGAAACCCGGTACCCCCACTCCTCCAATTGACGCCTGACGAGCCCTAAGGTTTCGTGTTTCACGTGGAACACAACCCCAAACGCAACGGCAACCTTAGCTTGCGACAAAAGTTTGCGCCCACAATCTCATGACGCACCTCGTTCTTTCCTTGCTGGTGAGGGCGTGTTTCACGTGAAACGTTTACCGCTTTGGTGCGACGGTCACCCTACGGTTTGCTCCGCTACCTTCGCTGAACGTGGTAACCCGCGGGTTATCTTTAAGGTAGACGTGGACGATGCGCCGCTCTGCGGGGCTCATTGGGGGGAGCTTGATTGAGCGCCGCTCCCGTATTGCTCTACGGGCACTCCGGTGGGCGATACCCTGTATCGCCTCTATCCTGCGCTGGCGGTAACCTTCGGAGTCCAGAACTATACGCTNTACGAATGGTCTGGTGCGGTAGACGGCGGAGTTGATCAGGTACTGGAGAGCGTCAATCGTCTCTCCCTT ]
[+] EMBL CD086090             [ATACCAGCCAGCAAGCGTGAGTACTCGTCTATTAGCTCAAGCTGTTCTCCGGAAACCCGGTACCCCCACTCCTCCAATTGACGCCTGACGAGCCCTAAGGTTTCGTGTTCCACGTGGAACACAACCCCAAACGCAACGGCAACCTTAGCTTGCGACAAAAGTTTGCGCCCACAATCTCATGACGCACCTCGTTCTTTCCTTGCTGGTGAGGGCGTGTTTCACGTGAAACGTTTACCGCTTTGGTGCGACGGTCACCCTACGGTTTGCTCCGCTACCTTCGCTGAACGTGGTAACCCGCGGGTTATCTTTAAGGTAGACGTGGACGATGCGCCGCTCTGCGGGGCTCATTGGGGGGAGCTTGATTGAGCGCCGCTCCCGTATTGCTCTACGGGCACTCCGGTGGGCGATACCCTGTATCGCCTCTATCCTGCGCTGGCGGTAACCTTCGGAGTCCAGAACTATACGCTTTACGAATGGTCTGGTGCGGTAGACGGCGGAGTTGATCAGGTACTGGAGAGCGTCAATCGTCTCTCCCTT ]
[-] EMBL CD086290             [                  GAGTACTCGTCTATTAGCTCAAGCTGTTCTCCGGAAACCCGGTACCCCCACTCCTCCAATTGACGCCTGACGAGCCATAAGGTTTCGTGTTTCACGTGGAACACAACCCCAAACGCAACGGCAACCTTAGCTTGCGACAAAAGTTTGCGCCCACAATCTCATGACGCACCTCGTTCTTTCCTTGCTGGTGAGGGCGTGTTTCACGTGAAACGTTTACCGCTTTGGTGCGACGGTCACCCTACGGTTTGCTCCGCTACCTTCGCTGAACGTGGTAACCCGCGGGTTATCTTTAAGGTAGACGTGGACGATGCGCCGCTCTGCGGGGCTCATTGGGGGGAGCTTGATTGAGCGCCGCTCCCGTATTGCTCTACGGGCACTCCGGTGGGCGATACCCTGTATCGCCTCTATCCTGCGCTGGCGGTAACCTTCGGAGTCCAGAACTATACGCTTTACGAATGGTCTGGTGCGGTAGACGGCGGAGTTGATCAGGTACTGGAGAGCGTCAATCGTCTCTCCCTTT]
[-] EMBL CD085989             [                                                                                                                                                                  TTGCGCCCACAATCTCATGACGCACCTCGTTCTTTCCANGCTGGTGAGGGCGTGAATCACGTGAAACGTTTACCGCTTAGGTGCGACGGTCACCCTACGGTNNGCTCCGCTACCTTCGCTGAACGTGGTAACCCGCGGGTTATCTTTAAGGTAGACGTGGACGATGCGCCGCTCTGCGGGGCTCATTGGGGGGAGCTTGATTGAGCGCCGCTCCCGTATTGCTCTACGGGCACTCCGGTGGGCGATACCCTGTATCGCCTCTATCCTGCGCTGGCGGTAGCCTTCGGAGTCCAGAACTATACGCTTTACGAATGGTCTGGTGCGGTAGACGGCGGAGTTGATCAGGTACTGGAGAGCGTCAATCGTCTCTCCCTTT]




>consensus_6204#0
ATACCAGCCAGCAAGCGTGAGTACTCGTCTATTAGCTCAAGCTGTTCTCCGGAAACCCGG
TACCCCCACTCCTCCAATTGACGCCTGACGAGCCCTAAGGTTTCGTGTTTCACGTGGAAC
ACAACCCCAAACGCAACGGCAACCTTAGCTTGCGACAAAAGTTTGCGCCCACAATCTCAT
GACGCACCTCGTTCTTTCCTTGCTGGTGAGGGCGTGTTTCACGTGAAACGTTTACCGCTT
TGGTGCGACGGTCACCCTACGGTTTGCTCCGCTACCTTCGCTGAACGTGGTAACCCGCGG
GTTATCTTTAAGGTAGACGTGGACGATGCGCCGCTCTGCGGGGCTCATTGGGGGGAGCTT
GATTGAGCGCCGCTCCCGTATTGCTCTACGGGCACTCCGGTGGGCGATACCCTGTATCGC
CTCTATCCTGCGCTGGCGGTAACCTTCGGAGTCCAGAACTATACGCTTTACGAATGGTCT
GGTGCGGTAGACGGCGGAGTTGATCAGGTACTGGAGAGCGTCAATCGTCTCTCCCTTT

clustalw multiple alignements is not computed in this case