cluster # 6266

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Schistosoma mansoni
cluster # 6266 cluster # 6266 Sequences # 4 consensus # 3

see consensus multiple alignment with clustalw

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consensus_6266#0 length = 605 sequences # 2

consensus_6266#1 length = 560 sequences # 1
consensus_6266#2 length = 449 sequences # 1

consensusID : consensus_6266#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 605
fasta sequence

                              [CTGAGTGTTGGTCGATGTGGATTTAGTGGTGGACTGATTGTAGCGTGTTGGGACTGCAGTGACAACTGGAACTGGTTGTAATGTTGATGATGGTTTGAGGTATTGTGTTGTCCTGAGTGATGTATTGACTTGTTGTTGGTGTATTTGGCGAAGTGGTGTTGTGCGCTATAGTTAAGGATGTAAATGAAGAATGAGTGAACCGTCGATATGTAGAGTTGCAATCGATGGAATGGTTTTGGTGATTTGTTGACGAGTTAGAATCGATGTAAATGAATCGTTGTTATGTGGAGTTGCAGTATATTGTATGTGTGTATTGATGGGTATGGTGGACAGGAGATAGTGAACCTATATTTTGTGCTATTCGTCAGTCGTCGTCAGCAGGGCGTACTTGTGATGTCGAGAGAAGTGGAGCTGGTTGGTGGACTCGATATAACTGGATAAGCAGTAAAAGGACTAGACAAACATGAGATTGGTGACTATTCGTGAGTGAGTGAGTGGTGGGTCACTAGTATGGAGATCGTTTGTTTGTCGCGAGGGAATTGACGTATACAAGACCGTTTGTTCTTTGATAAGCGCGAAGATGCTGAATCTGATTTCGTTAGTGT]

[+] EMBL CD096861             [CTGAGTGTTGGTCGATGTGGATTTAGTGGTGGACTGATTGTAGCGTGTTGGGACTGCAGTGACAACTGGAACTGGTTGTAATGTTGATGATGGTTTGAGGTATTGTGTTGTCCTGAGTGATGTATTGACTTGTTGTTGGTGTATTTGGCGAAGTGGTGTTGTGCGCTATAGTTAAGGATGTAAATGAAGAATGAGTGAACCGTCGATATGTAGAGTTGCAATCGATGGAATGGTTTTGGTGATTTGTTGACGAGTTAGAATCGATGTAAATGAATCGTTGTTATGTGGAGTTGCAGTATATTGTATGTGTGTATTGATGGGTATGGTGGACAGGAGATAGTGAACCTATATTTTGTGCTATTCGTCAGTCGTCGTCAGCAGGGCGTACTTGTGATGTCGAGAGAAGTGGAGCTGGTTGGTGGACTCGATATAAC                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD069511             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ATAGTGAACCTATATTTTGTGCTATTCGTCAGTCGTCGTCAGCAGGGCGTACTTGTGATGTCGAGAGAAGTGGAGCTTGTTGGTGGACTCGATATAACTGGATAAGCAGTAAAAGGACTAGACAAACATGAGATTGGTGACTATTCGTGAGTGAGTGAGTGGTGGGTCACTAGTATGGAGATCGTTTGTTTGTCGCGAGGGAATTGACGTATACAAGACCGTTTGTTCTTTGATAAGCGCGAAGATGCTGAATCTGATTTCGTTAGTGT]




>consensus_6266#0
CTGAGTGTTGGTCGATGTGGATTTAGTGGTGGACTGATTGTAGCGTGTTGGGACTGCAGT
GACAACTGGAACTGGTTGTAATGTTGATGATGGTTTGAGGTATTGTGTTGTCCTGAGTGA
TGTATTGACTTGTTGTTGGTGTATTTGGCGAAGTGGTGTTGTGCGCTATAGTTAAGGATG
TAAATGAAGAATGAGTGAACCGTCGATATGTAGAGTTGCAATCGATGGAATGGTTTTGGT
GATTTGTTGACGAGTTAGAATCGATGTAAATGAATCGTTGTTATGTGGAGTTGCAGTATA
TTGTATGTGTGTATTGATGGGTATGGTGGACAGGAGATAGTGAACCTATATTTTGTGCTA
TTCGTCAGTCGTCGTCAGCAGGGCGTACTTGTGATGTCGAGAGAAGTGGAGCTGGTTGGT
GGACTCGATATAACTGGATAAGCAGTAAAAGGACTAGACAAACATGAGATTGGTGACTAT
TCGTGAGTGAGTGAGTGGTGGGTCACTAGTATGGAGATCGTTTGTTTGTCGCGAGGGAAT
TGACGTATACAAGACCGTTTGTTCTTTGATAAGCGCGAAGATGCTGAATCTGATTTCGTT
AGTGT

consensusID : consensus_6266#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 560
fasta sequence

                              [ATGGTTTGAGGTATTGTGTTGTCCTGAGTGGTGTTTGAGTGTTGGTCGATGTGGATTTAGTGGTGGACTGATTGTAGCGTGTTGGGACTGCAGTGACAACTGGAACTGATTGTAGCGTGTTGGGACTGCAGCGACAACTGGAACTGGTTGTAATGTTGATGATGGTTTGAGGTATTGTGTTGTCCTGAGTGGTGTTTGAGTGTTGGTCGATGTGGATTTAGTGGTGGACTGATTGTAGCGTGTTGGGACTGCAGTGACAACTGGAACTGGTTGTAATGTTGATGATGGTTTGAGGTATTGTGTTGTCCTGAGTGGTGTTTGAGTGTTGGTCGATGTGGATTTAGTGGTGGACTGATTGTAGCGTGTTGGGACTGCAGTGACAACTGGAACTGGTTGTAATGTTGATGATGGTTTGATGTATTGTGTTGTCCTGAGTGGTGTTTGAGTGTTGGTCGATGTGGATTTAGTGGTGGACTGATTGTAGCGTGTTGGGACTGCAGTGACAACTGGAACTGGTTGTAATGTTGATGATGGTTTGAGGTATTGTGTTGTCCTGAGTG]

[-] EMBL CD094524             [ATGGTTTGAGGTATTGTGTTGTCCTGAGTGGTGTTTGAGTGTTGGTCGATGTGGATTTAGTGGTGGACTGATTGTAGCGTGTTGGGACTGCAGTGACAACTGGAACTGATTGTAGCGTGTTGGGACTGCAGCGACAACTGGAACTGGTTGTAATGTTGATGATGGTTTGAGGTATTGTGTTGTCCTGAGTGGTGTTTGAGTGTTGGTCGATGTGGATTTAGTGGTGGACTGATTGTAGCGTGTTGGGACTGCAGTGACAACTGGAACTGGTTGTAATGTTGATGATGGTTTGAGGTATTGTGTTGTCCTGAGTGGTGTTTGAGTGTTGGTCGATGTGGATTTAGTGGTGGACTGATTGTAGCGTGTTGGGACTGCAGTGACAACTGGAACTGGTTGTAATGTTGATGATGGTTTGATGTATTGTGTTGTCCTGAGTGGTGTTTGAGTGTTGGTCGATGTGGATTTAGTGGTGGACTGATTGTAGCGTGTTGGGACTGCAGTGACAACTGGAACTGGTTGTAATGTTGATGATGGTTTGAGGTATTGTGTTGTCCTGAGTG]




>consensus_6266#1
ATGGTTTGAGGTATTGTGTTGTCCTGAGTGGTGTTTGAGTGTTGGTCGATGTGGATTTAG
TGGTGGACTGATTGTAGCGTGTTGGGACTGCAGTGACAACTGGAACTGATTGTAGCGTGT
TGGGACTGCAGCGACAACTGGAACTGGTTGTAATGTTGATGATGGTTTGAGGTATTGTGT
TGTCCTGAGTGGTGTTTGAGTGTTGGTCGATGTGGATTTAGTGGTGGACTGATTGTAGCG
TGTTGGGACTGCAGTGACAACTGGAACTGGTTGTAATGTTGATGATGGTTTGAGGTATTG
TGTTGTCCTGAGTGGTGTTTGAGTGTTGGTCGATGTGGATTTAGTGGTGGACTGATTGTA
GCGTGTTGGGACTGCAGTGACAACTGGAACTGGTTGTAATGTTGATGATGGTTTGATGTA
TTGTGTTGTCCTGAGTGGTGTTTGAGTGTTGGTCGATGTGGATTTAGTGGTGGACTGATT
GTAGCGTGTTGGGACTGCAGTGACAACTGGAACTGGTTGTAATGTTGATGATGGTTTGAG
GTATTGTGTTGTCCTGAGTG

consensusID : consensus_6266#2
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 449
fasta sequence

                              [GGAACTGGTTGTAATGTTGATGATGGTTTGAGGTATTGCGTTGTCCTGAGTGGTGTTTGAGTGTTGGTGGATGTGGATTTAGTGGTGGACTGATTGTAGCGTGTTGGGACTGCAGTGACAACTGGAACTGGTTGTAATGTTGATGATGGTTTGAGGTATTGTGTTGTCCTGAGTGGTGTTTGAGTGTTGGTCGATGTGGATTTAGTGGTGGACTGATTGTAGCGTGTTGGGACTGCAGTGACAACTGGAACTGATTGTAGCGTGTTGGGACTGCAGCGACAACTGGAACTGGTTGTAATGTTGATGATGGTTTGAGGTATTGTGTTGTCCTGAGTGGTGTTTGAGTGTTGGTGGATGTGGATTTAGTGGTGGACTGATTGTAGCGTGTTGGGACTGCAGTGACAACTGGAACTGGTTGTAATGTTGATGATGGTTTGAGGTATTGTGTT]

[+] EMBL CD094640             [GGAACTGGTTGTAATGTTGATGATGGTTTGAGGTATTGCGTTGTCCTGAGTGGTGTTTGAGTGTTGGTGGATGTGGATTTAGTGGTGGACTGATTGTAGCGTGTTGGGACTGCAGTGACAACTGGAACTGGTTGTAATGTTGATGATGGTTTGAGGTATTGTGTTGTCCTGAGTGGTGTTTGAGTGTTGGTCGATGTGGATTTAGTGGTGGACTGATTGTAGCGTGTTGGGACTGCAGTGACAACTGGAACTGATTGTAGCGTGTTGGGACTGCAGCGACAACTGGAACTGGTTGTAATGTTGATGATGGTTTGAGGTATTGTGTTGTCCTGAGTGGTGTTTGAGTGTTGGTGGATGTGGATTTAGTGGTGGACTGATTGTAGCGTGTTGGGACTGCAGTGACAACTGGAACTGGTTGTAATGTTGATGATGGTTTGAGGTATTGTGTT]




>consensus_6266#2
GGAACTGGTTGTAATGTTGATGATGGTTTGAGGTATTGCGTTGTCCTGAGTGGTGTTTGA
GTGTTGGTGGATGTGGATTTAGTGGTGGACTGATTGTAGCGTGTTGGGACTGCAGTGACA
ACTGGAACTGGTTGTAATGTTGATGATGGTTTGAGGTATTGTGTTGTCCTGAGTGGTGTT
TGAGTGTTGGTCGATGTGGATTTAGTGGTGGACTGATTGTAGCGTGTTGGGACTGCAGTG
ACAACTGGAACTGATTGTAGCGTGTTGGGACTGCAGCGACAACTGGAACTGGTTGTAATG
TTGATGATGGTTTGAGGTATTGTGTTGTCCTGAGTGGTGTTTGAGTGTTGGTGGATGTGG
ATTTAGTGGTGGACTGATTGTAGCGTGTTGGGACTGCAGTGACAACTGGAACTGGTTGTA
ATGTTGATGATGGTTTGAGGTATTGTGTT

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_6266#1      ATGGTTTGAGGTATTGTGTTGTCCTGAGTGGTGTTTGAGTGTTGGTCGATGTGGATTTAG 60
consensus_6266#2      ------------------------------------------------------------
consensus_6266#0      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6266#1      TGGTGGACTGATTGTAGCGTGTTGGGACTGCAGTGACAACTGGAACTGATTGTAGCGTGT 120
consensus_6266#2      ------------------------------------------------------------
consensus_6266#0      -------CTGAGTGTTGGTCGATGTGGATTTAGTGGT-----GGACTGATTGTAGCGTGT 48
                                                                                  

consensus_6266#1      TGGGACTGCAGCGACAACTGGAACTGGTTGTAATGTTGATGATGGTTTGAGGTATTGTGT 180
consensus_6266#2      -------------------GGAACTGGTTGTAATGTTGATGATGGTTTGAGGTATTGCGT 41
consensus_6266#0      TGGGACTGCAGTGACAACTGGAACTGGTTGTAATGTTGATGATGGTTTGAGGTATTGTGT 108
                                         ************************************** **

consensus_6266#1      TGTCCTGAGTGGTGT-TTGAGTGTTGGTCGATGTGGATTTAGTGGTGGACTGAT-TGTAG 238
consensus_6266#2      TGTCCTGAGTGGTGT-TTGAGTGTTGGTGGATGTGGATTTAGTGGTGGACTGAT-TGTAG 99
consensus_6266#0      TGTCCTGAGTGATGTATTGACTTGTTGTTGGTGT--ATTTGGCGAAGTGGTGTTGTGCGC 166
                      *********** *** **** *  * ** * ***  **** * *  *   ** * **   

consensus_6266#1      CGT-GTTGGGACTGCAG-TGACAACTGGA--ACTGGTTGTAATGTTGATGATGGTTTGAG 294
consensus_6266#2      CGT-GTTGGGACTGCAG-TGACAACTGGA--ACTGGTTGTAATGTTGATGATGGTTTGAG 155
consensus_6266#0      TATAGTTAAGGATGTAAATGAAGAATGAGTGAACCGTCGATATGTAGAGTTGCAATCGAT 226
                        * ***  *  ** *  ***  * **    *   ** *  **** **       * ** 

consensus_6266#1      GTATTGTGTTGTCCTGAGTGGTGTTTGAGTGTTGGTCGATGTGGATTTAGTGGTGGACTG 354
consensus_6266#2      GTATTGTGTTGTCCTGAGTGGTGTTTGAGTGTTGGTCGATGTGGATTTAGTGGTGGACTG 215
consensus_6266#0      GGAATG-GTTTTGGTGATTTGTTGACGAGTTAGAATCGATGTAAATGAATCGTTGTTATG 285
                      * * ** *** *  *** * **    ****     *******  **  *  * **   **

consensus_6266#1      ----ATTGTAGCGTGTTGG--GACTGCAGTGAC--------------------------- 381
consensus_6266#2      ----ATTGTAGCGTGTTGG--GACTGCAGTGACAACTGGAACTGATTGTAGCGTGTTGGG 269
consensus_6266#0      TGGAGTTGCAGTATATTGTATGTGTGTATTGATGGGT-------ATGGTGGACAGGAGAT 338
                           *** **  * ***   *  ** * ***                            

consensus_6266#1      -----------AACTGGAACTGGTTGTAATGTTGATGATGGTTTGATGTA-TTGTGTTGT 429
consensus_6266#2      ACTGCAGCGACAACTGGAACTGGTTGTAATGTTGATGATGGTTTGAGGTA-TTGTGTTGT 328
consensus_6266#0      AGTGAACCTATATTTTGTGCTATTCGTCA-GTCGTCGTCAGCAGGGCGTACTTGTGATGT 397
                                 *  * *  **  * ** * ** *  *   *   *  *** ***** ***

consensus_6266#1      CCTGAGTGGTGT--TTGAGTGTTGG--TCGATGTGGAT---TTAGTGGTGGACTGATTGT 482
consensus_6266#2      CCTGAGTGGTGT--TTGAGTGTTGG--TGGATGTGGAT---TTAGTGGTGGACTGATTGT 381
consensus_6266#0      CGAGAGAAGTGGAGCTGGTTGGTGGACTCGATATAACTGGATAAGCAGTAAAAGGACTAG 457
                      *  ***  ***    **  ** ***  * *** *   *   * **  **  *  ** *  

consensus_6266#1      AGCGTGTTGGGACTGCAGTGACAACTGG-AACTGGTTGTAATGTTGATGA-TGGTTTGAG 540
consensus_6266#2      AGCGTGTTGGGACTGCAGTGACAACTGG-AACTGGTTGTAATGTTGATGA-TGGTTTGAG 439
consensus_6266#0      ACAAACATGAGATTG--GTGACTATTCGTGAGTGAGTGAGTGGTGGGTCACTAGTATGGA 515
                      *      ** ** **  ***** * * *  * **  **    ** * * * * ** **  

consensus_6266#1      G--TATTGTGTTGTCCTGAGTG-------------------------------------- 560
consensus_6266#2      G--TATTGTGTT------------------------------------------------ 449
consensus_6266#0      GATCGTTTGTTTGTCGCGAGGGAATTGACGTATACAAGACCGTTTGTTCTTTGATAAGCG 575
                      *    **   **                                                

consensus_6266#1      ------------------------------
consensus_6266#2      ------------------------------
consensus_6266#0      CGAAGATGCTGAATCTGATTTCGTTAGTGT 605