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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6611#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 850 fasta sequence
[ATTTATTCGGGATATTTTGTGGTAAGCTAACATTGTGTCATAACACGGCATAGGTTATTCAAGACAGACAAAGAACGATGAATGCGATTGATAAGCGGCGTAGGACAAAATGCGATGCCTTTGTATTGACTCAAGGTTTGGAGACTTTTCGAAATTTGACTTAACATGTTTATAAGCGATTGTAATGGCCAGGAATGTATCAATACTGCACTTCTAACGAACTGATTTGGATCGCAAATAAGCTCATCATCAGTGCTCAATCTTCTCAAGTAGTGAACTAAGTAAGATAAACAGGTAGTTTCAGGAGATACCAGCCAGTCAACGAACAAATAAGACGAAAAGCCGACAGATTTCGCTAAATAAGCAAACAACCAATGGGCATTGGGAACAGCATGGGGAGTCATTTGCTGATATAACTCTGTGGATTTGATATGGTCCTCAATCTGTATCCATAGGTCCAATACTCGGAAAAGTTGTGCATCATCCTCAGAAAATAAGATAATTATTGAATTTTCATAACTATGTACCGTGTTTGATTTATCCAATTCAATATCCAGTAATAATTCATGAATAGAGCTTATTATTGACCAAAGTTGTAGATCATTAGGATCTAATTTTAAAGCATTTTCGAGACCACATGTAATAATAATGCGCAGAGATAAACAAATATCTGGTTCGAGCAAAGATACTTCGTCGCATTTAATCTTTTGAGTTTTTATAGTGCGCGCTATATGAGTAGTTAAACAACCACAGAAAGCGTTGGAATCAGATATTTCTATTATAGACCTTTGTGAACGGGAGTGTGAGCACAGTAATTCGTATATAAGTTTGTTAACGATAGGATGTAAAT]
[+] EMBL CD077320 [ATTTATTCGGGATATTTTGTGGTAAGCTAACATTGTGTCATAACACGGCATAGGTTATTCAAGACAGACAAAGAACGATGAATGCGATTGATAAGCGGCGTAGGACAAAATGCGATGCCTTTGTATTGACTCAAGGTTTGGAGACTTTTCGAAATTTGACTTAACATGTTTATAAGCGATTGTAATGGCCAGGAATGTATCAATACTGCACTTCTAACGAACTGATTTGGATCGCAAATAAGCTCATCATCAGTGCTCAATCTTCTCAAGTAGTGAACTAAGTAAGATAAACAGGTAGTTTCAGGAGATACCAGCCAGTCAACGAACAAATAAGACGAAAAGCCGACAGATTTCGCTAAATAAGCAAACAACCAATGGGCATTGGGAACAGCATGGGGAGTCATTTGCTGATATAACTCTGTGGATTTGATATGGTCCTCAATCTGTATCCATAGGTCCAATACTCGGAAAAGTTGTGCATCATCCTCAGAAAATAAGATAATTATTGAATTTTCATAACTATGTACCGTGTTTGATTTATCCAATTCAATATCCAGTAATAATTCATGAATAGAGCTTATTATTGACCAAAGTTGTAGATCATTAGGA ]
[-] EMBL CD185901 [ AGCATGGGGAGTCATTTGCTGATATAACTCTGTGGATTTGATATGGTCCTCAATCTGTATCCATAGGTCCAATACTCGGAAAAGTTGTGCATCATCCTCAGAAAATAAGATAATTATTGAATTTTCATAACTATGTACCGTGTTTGATTTATCCAATTCAATATCCAGTAATAATTCATGAATAGAGCTTATTATTGACCAAAGTTGTAGATCATTAGGATCTAATTTTAAAGCATTTTCGAGACCA ]
[-] EMBL CD071545 [ GGAGTCATTTGATGATATAACTCTGTGGATTTGATATGGTCGTCAATCTGTATCCATAGGTCCAATACTCGGAATAGTTGTGCATCATCCTCAGAAAATAAGATAATTATTGAATTTTCATAACTATGTACCGTGTTTGATTTATCCAATTCAATATCCAGTAATAATTCATGAATAGAGCTTATTATTGACCAAAGTTGTAGATCATTAGGATCTAATTTTAAAGCATTTTCGAGACCACATGTAATAATAATGCGCAGAGATAAACAAATATCTGGTTCGAGCAAAGATACTTCGTCGCATTTAATCTTTTGAGTTTTTATAGTGCGCGCTATATGAGTAGTTAAACAACCACAGAAAGCGTTGGAATCAGATATTTCTATTATAGACCTTTGTGAACGGGAGTGTGAGCACAGTAATTCGTATATAAGTTTGTTAACGATAGGATGTAAAT]
[-] EMBL CD147507 [ aatctgtaGAGACCACATATAATAATAATGCGCAGAGATAAACAAATATCTGGTTCAAGCAAAGATACTTCGTCGCATTTAATCTTTTGAGTTTTTATAGTGCGCGCTATATGAGTAGTTAAACAACCACAAAAAGCGTTGGAATCAGATATTTCTATTGTAGACCTTTGTGAACGGGAGTGTGAGCACAGTAATTCGTATATAAGTTTGTTAACGATAGGAT ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||