Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 6628 cluster # 6628       Sequences # 4       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6628#0 length = 698 sequences # 4  
consensusID : consensus_6628#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 698
fasta sequence 
                              [CAAAGAAAGAACTTATAGTTTGAAATCCTGAAGTTGTTGACTATGTGGTACGTTTATCTGAATTTAAATATAATAGGTATCCTATATCCATGTATATCACTTGAGCCTGATGGCGATATACCAATGACAGTTGAATTCGTGATAATAAAAGGCTAACACACGGTATTTGTACTCGCATACGAGATAGCACCATTTGAAGCAAACACACAAGCAGGGTAACAATAGTCGGAACGAAGTAGAAAAAAATTCTTTTGTTTCTAATATATACAAACAAATAAAATGTACACTTATATTAAAACTTTAAAAATGTTATCAGAAATATACAAAACGAAGCTGCTACAAGTTTTTCGCAACCAAGATATTTGTTTTTCAAACTTCACTATATACTGTATAAATATTGTATTCTTTTTTTCTAATAATTTCAGGAGAATGATTTCATCTATTCACATATTTGCATAATAAACTGATAGATCAATAACCAAAATGATTCTTTAAAGAGTATTAAATTAAGATTGTAGAATTGAAACTGGTAATATAATACTTGGATAAAGGTATTTACATTTTTCGCTACTGTGATATGTTTATCGTCAAAATGTTCTAAGTTTTTGCTGAAGTTAAAATATAGCTACATATTTTCAAATGTGCGTTGTTGTGTGTCTATTATTCCTAATATACAACAATAATACTATAGGTAACAG]

[+] EMBL CD078269             [CAAAGAAAGAACTTATAGTTTGAAATCCTGAAGTTGTTGACTATGTGGTACGTTTATCTGAATTTAAATATAATAGGTATCCTATATCCATGTATATCACTTGAGCCTGATGGCGATATACCAATGACAGTTGAATTCGTGATAATAAAAGGCTAACACACGGTATTTGTACTCGCATACGAGATAGCACCATTTGAAGCAAACACACAAGCAGGGTAACAATAGTCGGAACGAAGTAGAAAAAAATTCTTTTGTTTCTAATATATACAAACAAATAAAATGTACACTTATATTAAAACTTTAAAAATGTTATCAGAAATATACAAAACGAAGCTGCTACAAGTTTTTCGCAACCAAGATATTTGTTTTTCAAACTTCACTATATACTGTATAAATATTGTATTCTTTTTTTCTAATAATTTCAGGAGAATGATTTCATCTATTCACATATTTGCATAATAAACTGATAGATCAATAACCAAAATGATTCTTTAAAGAGTATTAAATTAAGATTGTAGAATTGAAACTGGTAATATAATACTTGGATAAAGGTATTTACATTTTTCGCTACTGTGATATGTTTATCGTCAAAATGTTCTAAGTTTTTGCTGAAGTTAAAATATAGCT                                                                       ]
[+] EMBL CD078351             [CAAAGAAAGAACTTATAGTTTGAAATCCTGAAGTTGTTGACTATGTGGTACGTTTATCTGAATTTAAATATAATAGGTATCCTATATCCATGTATATCACTTGAGCCTGATGGCGATATACCAATGACAGTTGAATTCGTGATAATAAAAGGCTAACACACGGTATTTGTACTCGCATACGAGATAGCACCATTTGAAGCAAACACACAAGCAGGGTAACAATAGTCGGAACGAAGTAGAAAAAAATTCTTTTGTTTCTAATATATACAAACAAATAAAATGTACACTTATATTAAAACTTTAAAAATGTTATCAGAAATATACAAAACGAAGCTGCTACAAGTTTTTCGCAACCAAGATATTTGTTTTTCAAACTTCACTATATACTGTATAAATATTGTATTCTTTTTTTCTAATAATTTCAGGAGAATGATTTCATCTATTCACATATTTGCATAATAAACTGATAGATCAATAACCAAAATGATTCTTTAAAGAGTATTAAATTAAGATTGTAGAATTGAAACTGGTAATATAATACTTGGATAAAGGTATTTACATTTTTCGCTACTGTGATATGTTAATCGTCAAAATGTTCTAAGTTTTTGCTGAAGTT AAATATAGCT                                                                       ]
[-] EMBL CD072911             [                                                                                                                        CCAATGACAGTTGAATTCGTGATAATAAAAGGCTAACACACGGTATTTGTACTCGCATACGAGATAGCACCATTTGAAGCAAACACACAAGCAGGGTAACAATAGTCGGAACGAAGTAGAAAAAAATTCTTTTGTTTCTAATATATACAAACAAATAAAATGTACACTTATATTAAAACTTTAAAAATGTTATCAGAAATATACAAAACGAAGCTGCTACAAGTTTTTCGCAACCAAGATATTTGTTTTTCAAACTTCACTATATACTGTATAAATATTGTATTCTTTTTTTCTAATAATTTCAGGAGAATGATTTCATCTATTCACATATTTGCATAATAAACTGATAGATCAATAACCAAAATGATTCTTTAAAGAGTATTAAATTAAGATTGTAGAATTGAAACTGGTAATATAATACTTGGATAAAGGTATTTACATTTTTCGCTACTGTGATATGTTTATCGTCAAAATGTTCTAAGTTTTTGCTGAAGTTAAAATATAGCTA                                                                      ]
[-] EMBL CD089966             [                                                                                                                                                                                                            attcgattAGGGTAACAATAGTCGGAACGAAGTAGAAAAAAATTCTTTTGTTTGTAATATATACAAACAAATAAAATGTACACTTATATTAAAACTTTAAAAATGTTATCAGAAATATACAAAACGAAGCTGCTACAAGTTTTTCGCAACCAAGATATTTGTTTTTCAAACTTCACTATATACTGTATAAATATTGTATTCTTTTTTTCTAATAATTTCAGGAGAATGATTTCATCTATTCACATATTTGCATAATAAACTGATAGATCAATAACCAAAATGATTCTTTAAAGAGTATTAAATTAAGATTGTAGAATTGAAACTGGTAATATAATACTTGGATAAAGGTATTTACATTTTTCGCTACTGTGATATGTTTATCGTCAAAATGTTCTAAGTTTTTGCTGAAGTTAAAATATAGCTACATATTTTCAAATGTGCGTTGTTGTGTGTCTATTATTCCTAATATACAACAATAATACTATAGGTAACAG]




>consensus_6628#0
CAAAGAAAGAACTTATAGTTTGAAATCCTGAAGTTGTTGACTATGTGGTACGTTTATCTG
AATTTAAATATAATAGGTATCCTATATCCATGTATATCACTTGAGCCTGATGGCGATATA
CCAATGACAGTTGAATTCGTGATAATAAAAGGCTAACACACGGTATTTGTACTCGCATAC
GAGATAGCACCATTTGAAGCAAACACACAAGCAGGGTAACAATAGTCGGAACGAAGTAGA
AAAAAATTCTTTTGTTTCTAATATATACAAACAAATAAAATGTACACTTATATTAAAACT
TTAAAAATGTTATCAGAAATATACAAAACGAAGCTGCTACAAGTTTTTCGCAACCAAGAT
ATTTGTTTTTCAAACTTCACTATATACTGTATAAATATTGTATTCTTTTTTTCTAATAAT
TTCAGGAGAATGATTTCATCTATTCACATATTTGCATAATAAACTGATAGATCAATAACC
AAAATGATTCTTTAAAGAGTATTAAATTAAGATTGTAGAATTGAAACTGGTAATATAATA
CTTGGATAAAGGTATTTACATTTTTCGCTACTGTGATATGTTTATCGTCAAAATGTTCTA
AGTTTTTGCTGAAGTTAAAATATAGCTACATATTTTCAAATGTGCGTTGTTGTGTGTCTA
TTATTCCTAATATACAACAATAATACTATAGGTAACAG

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)