Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 6650 cluster # 6650       Sequences # 4       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6650#0 length = 1171 sequences # 4  
consensusID : consensus_6650#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1171
fasta sequence 
                              [CATATGTATATTTAATTTTATCATTTAAAATGATGTTTCACTCATTCTCCTTTTTATTTTATTAAATTAATGATGAATTATTCAGTTCGGTTTGTTAATTGTTTCTAATTTTCTAAATTTATTTAAAAATAAAAAAAATCAAATGGAGATATGTTGAAATAAAACAAGAGAGAGTGAGAGAGAGGGGGGAGGGGGAGGAAAACGAGTACTAAATAAATACAAACATACAATAATAATAATAAAAAAGAGAAAACAGTGTGAGTGAGAGTAAAAGAATAAAACATCTTTGTCCATTCATTTGCAAAATAAAAGCGAAACTAAAACAGAAAAAAAATATGATCTTTACAAGAAAAAAAAATTGTTTTCTGAATATTTTCTCATTTATTATTTGTAAAGCATTCAGTTATATGATGTTGGAAAGGGAATTATGGTCAGTAATACAGAAATCTATG----TATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAAAGAAAACTAAATAAATAGAACCGGATGACACGATTATGAATAAGACTTAACAAAGAATGATTGTTTCAGTAAGTTATATAATACAGAAAAAATATACGTGATATCAACATATATGACCATACGGTGTATTTTTGTTACTGAGTTCGCTTCGGAGGATATTCAATCACCAAGATAATTATCACAATTAAAATAGCCACGATTAAAACGGCTACGAATATGCAACAACATCTTCGAGATCTTTGTCGTCGATTAGCAGCTTTTGCTAGCTCTGAATGACCAGACTGTTCATTAGCTAATGCTACTTCGATGTTGTCTTCAATTGAATCAATAGCACTGCGTTGTTCATATACTAATTCAGAAAGTTGATGAAAAATTGCATTTACATTCACAATATCTTCCTCTATAGAACGCATTTGATCCTCTTGATTCAACGCTAGTCCCAATTCCTGAACTTCATAGTCTTGGGAGGCACAGATTTGTGCTTGAATAAACTGGCCTGTATCAGTATCGTTTGAATCCAAATTAATCAAATCTCCAACAAGTGAGGAAGTTGGACGACTTTCGGTAAGCAGTCGCCTTTTGATTTCAGCTTGAGTTCTTTGGAGCCGGTGAAGTACACGCTGAAAGTCAACTTTGAGCTTCTCAACATGAATTTTGGTTATCTGATC]

[+] EMBL CD073440             [CATATGTATATTTAATTTTATCATTTAAAATGATGTTTCACTCATTCTCCTTTTTATTTTATTAAATTAATGATGAATTATTCAGTTCGGTTTGTTAATTGTTTCTAATTTTCTAAATTTATTTAAAAATAAAAAAAATCAAATGGAGATATGTTGAAATAAAACAAGAGAGAGTGAGAGAGAGGGGGGAGGGGGAGGAAAACGAGTACTAAATAAATACAAACATACAATAATAATAATAAAAAAGAGAAAACAGTGTGAGTGAGAGTAAAAGAATAAAACATCTTTGTCCATTCATTTGCAAAATAAAAGCGAAACTAAAACAGAAAAAAAATATGATCTTTACAAGAAAAAAAAATTGTTTTCTGAATATTTTCTCATTTATTATTTGTAAAGCATTCAGTTATATGATGTTGGAAAGGGAATTATGGTCAGTAATACAGAAATCTATG    TATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAAAGAAAACTAAATAAATAAAACCGGATGACACGATTATGAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD075016             [ ATATGTATACTTAATTTTATCGTAAAAAATGATGTTTCACTCATTCTCCTTTTCATTTTATTAAATTAATGATGAATTATTCAGTTCGGTTTGTTAATTGTTTCTAATTTTCTAAATTTATTTAAAAATAAAAAAAATCAAATGGAGATATGTTGAAATAAAACAAGAGAGAGTGAGAGAGAGGGGGGAGGGGGAGGAAAACGAGTACTAAATAAATACAAACATACAATAATAATAATAAAAAAGAGAAAACAGTGTGAGTGAGAGTAAAAGAATAAAACATCTTTGTCCATTCATTTGCAAAATAAAAGCGAAACTAAAACAGAAAAAAAATATGATCTTTACAAGAAAAAAAAATTGTTTTCTGAATATTTTCTCATTTATTATTTGTAAAGCATTCAGTTATATGATGTTGGAAAGGGAATTATGGTCAGTAATACAGAAATCTATGTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAAAGAAAACTAAATAAATAGAACCGGATGACACGATTATGAATAAGACTTAACAAAGAATGATTGTTTCAGTAAGTTATATAATACAGAAAAAATATACGTGATATCAACATATATGACCATACGGTGTATTTTTGTTACTGAGTTCGCTTCGGAGGATATTCAATCACCAAGATAATTATCACAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD078989             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GCATTCAGTTATATGATG TGGAAAGGGAATTATGGTCAGTAATACAGAAATCTATG    TATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAAAGANAACTAAATAAATAGANCCGGATGACACGATTATGAATAAGACTTAACAAAGAATGATTGTTTCAGTAAGTTATATAATACAGAAAAAATATACGTGATATCAACATATATGACCATACGGTGTATTTTTGTTACTGAGTTCGCTTCGGAGGATATTCAATCACCAAGATAATTATCACAATTAAAATAGCCACGATTAAAACGGCTACGAATATGCAACAACATCTTCGAGATCTTTGTCGTCGATTAGCAGCTTTTGCTAGCTCTGAATGACCAGACTGTTCATTAGCTAATGCTACTTCGATGTTGTCTTCAATTGAATCAATAGCACTGCGTTGTTCATATACTAATTCAGAAAGTTGATGAAAAATTGCATTTACATTCACAATATCTTCCTCTATAGAACGCATTTGATCCTCTTGATTCAACGCTAGTCCCAATTCCTGAACTTCATAGTCTTGGGAGGCACAGATTTGTGCTTGAATAAACTGGCCTGTATCAGTATCGTTTGAATCCAAATTAAT                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD144558             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ccCCAAGATAATTATCACAATTAAAATAGCCACGATTAAAACGGCTACGAATATGCAACAACATCTTCGAGATCTTTGTCGTCGATTAGCAGCTTTTGCTAGCTCTGAATGACCAGACTGTTCATTAGCTAATGCTACTTCGATGTTGTCTTCAATTGAATCAATAGCACTGCGTTGTTCATATACTAATTCAGAAAGTTGATGAAAAATTGCATTTACATTCACAATATCTTCCTCTATAGAGCGCATTTGATCCTCTTGATTCAACGCTAGTCCCAATTCCTGAACTTCATAGTCTTGGGAGGCACAGATTTGTGCTTGAATAAACTGGCCTGTATCAGTATCGTTTGAATCCAAATTAATCAAATCTCCAACAAGTGAGGAAGTTGGACGACTTTCGGTAAGCAGTCGCCTTTTGATTTCAGCTTGAGTTCTTTGGAGCCGGTGAAGTACACGCTGAAAGTCAACTTTGAGCTTCTCAACATGAATTTTGGTTATCTGATC]




>consensus_6650#0
CATATGTATATTTAATTTTATCATTTAAAATGATGTTTCACTCATTCTCCTTTTTATTTT
ATTAAATTAATGATGAATTATTCAGTTCGGTTTGTTAATTGTTTCTAATTTTCTAAATTT
ATTTAAAAATAAAAAAAATCAAATGGAGATATGTTGAAATAAAACAAGAGAGAGTGAGAG
AGAGGGGGGAGGGGGAGGAAAACGAGTACTAAATAAATACAAACATACAATAATAATAAT
AAAAAAGAGAAAACAGTGTGAGTGAGAGTAAAAGAATAAAACATCTTTGTCCATTCATTT
GCAAAATAAAAGCGAAACTAAAACAGAAAAAAAATATGATCTTTACAAGAAAAAAAAATT
GTTTTCTGAATATTTTCTCATTTATTATTTGTAAAGCATTCAGTTATATGATGTTGGAAA
GGGAATTATGGTCAGTAATACAGAAATCTATGTATATATATATATATATATATATATATA
TATATATATATATATATATATAAAGAAAACTAAATAAATAGAACCGGATGACACGATTAT
GAATAAGACTTAACAAAGAATGATTGTTTCAGTAAGTTATATAATACAGAAAAAATATAC
GTGATATCAACATATATGACCATACGGTGTATTTTTGTTACTGAGTTCGCTTCGGAGGAT
ATTCAATCACCAAGATAATTATCACAATTAAAATAGCCACGATTAAAACGGCTACGAATA
TGCAACAACATCTTCGAGATCTTTGTCGTCGATTAGCAGCTTTTGCTAGCTCTGAATGAC
CAGACTGTTCATTAGCTAATGCTACTTCGATGTTGTCTTCAATTGAATCAATAGCACTGC
GTTGTTCATATACTAATTCAGAAAGTTGATGAAAAATTGCATTTACATTCACAATATCTT
CCTCTATAGAACGCATTTGATCCTCTTGATTCAACGCTAGTCCCAATTCCTGAACTTCAT
AGTCTTGGGAGGCACAGATTTGTGCTTGAATAAACTGGCCTGTATCAGTATCGTTTGAAT
CCAAATTAATCAAATCTCCAACAAGTGAGGAAGTTGGACGACTTTCGGTAAGCAGTCGCC
TTTTGATTTCAGCTTGAGTTCTTTGGAGCCGGTGAAGTACACGCTGAAAGTCAACTTTGA
GCTTCTCAACATGAATTTTGGTTATCTGATC

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)