cluster # 6703

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Schistosoma mansoni
cluster # 6703 cluster # 6703 Sequences # 4 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_6703#0 length = 671 sequences # 4

consensusID : consensus_6703#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 671
fasta sequence

                              [TATGCTCAAAAACTTGGAAAACTACGTCTAAATTCGTCCTATGTTATATGGAGGTTTAATACTGACGAGACTCAACCAGCAAAGAGTCTAGTTGAAAAACCTTTACTTCGCGGCCTTTTAAAACATGGAGATTTCGGAACTATTGCACTGGCTGATAACAGAGTTATTGGCTGTGACAAAAGCGTAATCAGTTTGTCTAAAAGTCTCACATCAGCCCTCGCTTCAAGTACAATCGTAGCATGCATCCAGCAACAGCTGCGTATAGACTTTACCTTGACAGAGGACATAAAACGACTGAGTTCAATGTACCCACTTGATTGGGATCTCTCTGCACGCAATTTTCATCTGCTAGCAGGTCAAGGGGTTATGGCAACAGCCACTATACATGTAGCTCCGAACGGTCCAATCAGTCTTGTGAAAATCAGAAAACCGTCTGATCCAGATCATCCCGAACCACATTTGGCAGAACCATGTAATTTTGTTCCACCGATTTCGTGGTCTTTAGACGAATGGTTGATGGAAATTAATGACTTTTGTAATTCGGTCATTCCAACAAGCTAACTGATTAATTTTAATGTACTTAACAAATTCCATCTCAATCAGTAACTGTCTTACACATATTTTTTTTCAACTGTGAGATGGTTTGTTATTTTTATACTTTCAATAAATGT]

[+] EMBL CD080332             [TATGCTCAAAAACTTGGAAAACTACGTCTAAATTCGTCCTATGTTATATGGAGGTTTAATACTGACGAGACTCAACCAGCAAAGAGTCTAGTTGAAAAACCTTTACTTCGCGGCCTTTTAAAACATGGAGATTTCGGAACTATTGCACTGGCTGATAACAGAGTTATTGGCTGTGACAAAAGCGTAATCAGTTTGTCTAAAAGTCTCACATCAGCCCTCGCTTCAAGTACAATCGTAGCATGCATCCAGCAACAGCTGCGTATAGACTTTACCTTGACAGAGGACATAAAACGACTGAGTTCAATGTACCCACTTGATTGGGATCTCTCTGCACGCAATTTTCATCTGCTAGCAGGTCAAGGGGTTATGGCAACAGCCACTATACATGTAGCTCCGAACGGTCCAATCAGTCTTGTGAAAATCAGAAAACCGTCTGATCCAGATCATCCCGAACCACATTTGGCAGAACCATGTAATTTTGTTCCACCGATTTCGTGGTCTTTAGACGAATGGTTGATGGAAATTAATGACTNTTGTAATTCGGTCATTCCAAACAGCTAACTGATTAATTNTAATGTACTTAACANATTCCATCTCAATCAGTAACTGTCTTACACATATTNTTTTTCAACTGTGAGATGGTTTGNTATTTTTATACTTTC ATAANTG ]
[+] EMBL CD095553             [                                 TCGTCCTATGTTATATGGAGGTTTAATACTGACGAGACTCAACCAGCAAAGAGTCTAGTTGAAAAACCTTTACTTCGCGGCCTTTTAAAACATGGAGATTTCGGAACTATTGCACTGGCTGATAACAGAGTTATTGGCTGTGACAAAAGCGTAATCAGTTTGTCTAAAAGTCTCACATCAGCCCTCGCTTCAAGTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD074252             [                                                                                                                                                                             TGACAAAAGCGTAATCAGTTTGTTTAAAAGTTTCACATCAGCCCTCGCTTCAAGTACAATTGTAGCATGCATCCAGCAACAGCTGGGTATAGACTTTACCTTGACAGAGGACATAAAACGACTGAGTTCAATGTACCCACTTGATTGGGATCTCTTTGCACGCAATTTTCATTTGCTAGCAGGTCAAGGGGTTATGGCAACAGCCCCTATACATGTAGCTCCGAACGGTCCAATCAGTTTTGTGAAAATCAGAAAACCGTTTGATCCAGATCATCCCGAACCACATTTGGCAGAACCATGTAATTTTGTTCCCCCGATTTCGTGGTTTTTAAACGAATGGTTGATGGAAATTAATGACTTTTGTAATTCGGTCATTCCAACAAGGTAACTGATTAATTTTAATGTACTTAACAAATTCCATTTCAATCAGTAACTGTTTTACACATATTTTTTTTCAACTGTGAGATGGGTTGTTATTTTTAAACTTACAATAAATGT]
[+] EMBL CD145727             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CAACAGCCACTATACATGTAGCTCCGAACGGTCCAATCAGTCTTGTGAAAATCAGAAAACCGTCTGATCCAGATCATCCCGAACCACATTTGGCAGAACCATGTAATTTTGTTCCACCGATTTCGTGGTCTTTAGACGAATGGTTGATGGAAATTAATGACTTTTGTAATTCGGTCATTCCAACAAGCTAACTGATTAATTTTAATGTACTTAACAAATTCCATCTCAATCAGTAACTGTCTTACACATATTTTTTTTCAACTGTGAGATGGTTTGTTATTTTTATACTTTCAATAAATG ]




>consensus_6703#0
TATGCTCAAAAACTTGGAAAACTACGTCTAAATTCGTCCTATGTTATATGGAGGTTTAAT
ACTGACGAGACTCAACCAGCAAAGAGTCTAGTTGAAAAACCTTTACTTCGCGGCCTTTTA
AAACATGGAGATTTCGGAACTATTGCACTGGCTGATAACAGAGTTATTGGCTGTGACAAA
AGCGTAATCAGTTTGTCTAAAAGTCTCACATCAGCCCTCGCTTCAAGTACAATCGTAGCA
TGCATCCAGCAACAGCTGCGTATAGACTTTACCTTGACAGAGGACATAAAACGACTGAGT
TCAATGTACCCACTTGATTGGGATCTCTCTGCACGCAATTTTCATCTGCTAGCAGGTCAA
GGGGTTATGGCAACAGCCACTATACATGTAGCTCCGAACGGTCCAATCAGTCTTGTGAAA
ATCAGAAAACCGTCTGATCCAGATCATCCCGAACCACATTTGGCAGAACCATGTAATTTT
GTTCCACCGATTTCGTGGTCTTTAGACGAATGGTTGATGGAAATTAATGACTTTTGTAAT
TCGGTCATTCCAACAAGCTAACTGATTAATTTTAATGTACTTAACAAATTCCATCTCAAT
CAGTAACTGTCTTACACATATTTTTTTTCAACTGTGAGATGGTTTGTTATTTTTATACTT
TCAATAAATGT

clustalw multiple alignements is not computed in this case