These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6716#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 1832 fasta sequence [ATTCGGCACGAGCNAGTGCGCTACAATTAGNTTTGAACTGTGACAGTCATTCTCTCTACATACTGTGCATCATATGGAAATGTATTTGTATTTGTTTTATTGGGTTTATCACAAACCTCGCGATCAGGCCTAGCAAACGATAGCCTTGGTCAATAAAAAGTGATNCAGTTTTCTCAAATGGAAAGACCTGTGCCATTTTCACGTTCCAAACTGCCTAAATCTAAGCATCGTTTTGTCTCATGGTCTGTGAAGCAAAAACAGAAAAGTAGTTATCTGTACTCTCATTCTTGTTTTCTATAGAATTCAATCAGGCCTTATCAGCGAACAGTTCAAATATCCCTCTTAATTGTCCTTTAATTGGATGTTCTGGGATTGGTCATATTAATGGCCGAGATACTGCACACGTGACCCTATCTGGATGCCCTTTGTATCACAATATGGGCTTTGTGAAATGGGCGGAGATGCGTGCTCGGGAAGAAGGTCTTGTTGTTCCAGAATCCATTAGACGGATATCTCAAAACTCACCATCGCCTTCTAAAGTTAAACATAGGGTCGACCGTTCACATCA-GTTTAAGACTACACAAAGGGAACCTATGCTTGATGATTTAGCTAGTCAAGTGGAGTTGTATCAGTTTCGTCGTGCTCAACAAAGATTGGTTTCAACTTACGAGACGGATGCCCGGGAACATTTGCTTCTGTGTGCACGAGTAGCTTCGAATTCAGGAAATGTACCCAATAATGCATTTTCCGAAAATATCGAGTTCGCTACAGAACAGCGCATACGTTCTGTTATTTTTGGGACATGGGATTNTAC-ACCGTGGTACCACAGTAATTATCCTGCCGATTTGAGTTGTCTACCTACCATATACATTTGTGAATTCTGTCTATCTGGAATGCGCCATACAGTTGCATATAATCGTCATAAAATTAATTGTGATCGAACGTTTCCTCCAGGTAATGAGATATATCGTAAAGAGAATTTATCGTTCTTTGAAATTGATGGACAAAAACATCAGGAATACTGTCGAAATTTATGTTTATTAGCTAAATTATTTCTGAAACAAAAAACAGTTCATGAATTAGATCAAGTTCCTGCATTTTTATTCTATGTATTAACTGAAACAGATCAAGATGGTTCACATATTATTGGTTATTTCTCAAAACAAAAAGCTGATGATCAACGTGACAACTCCGTCAATGCTGTGTACAATAATCTTTCGTGTATTCTCATTTTACCACCGTATCAATGTCGTGGTTTTGGTCGTATGCTTATTGAGATGAGTTATATTTTAAGTCGACTAGAACAACGTATTGGTACACCAGAACGTCCATTATCAGATTTGGGCATCATCATTTACAGAAGATATTGGCGTTTTGAAATTTTAAAATACCTATCGTCATTCACAGCTAAGTCAATTAATATTCGAAGTATGAGTCAAGAATTAGGAATAGCAGTTCCTGATATTGTAAGCACTTTATTAGATATGAAGATGCTTGTTTGCTATCGGACACAATATTACATAATCAATAATAAACCTGATGTAGACGCTCTTTTGAGTACAATTAAACCGCCTGCTACTGATCGTTGTATTGATTCTACATGCCTTCATTGGACTCCTAATGTTAGTAATGTCAGTCAGTTGAGTAAATCGCCTAGTAGTAGTACTCTTAGTATTAGTAGTACTATTAATCAAAAGCTTCATAAATCTAGTCTTATGTCACCAAATGATTCAATTGGAGCAAATATTTGAAGATTTTTCTAGTTTAATTATTGTACATTGAAATATTGTAAGGAGTTTTGTTGTGTACAATCTAATAATATGACTATTATT] [+] EMBL CD081182 [ATTCGGCACGAGCNAGTGCGCTACAATTAGNTTTGAACTGTGACAGTCATTCTCTCTACATACTGTGCATCATATGGAAATGTATTTGTATTTGTTTTATTGGGTTTATCACAAACCTCGCGATCAGGCCTAGCAAACGATAGCCTTGGTCAATAAAAAGTGATNCAGTTTTCTCAAATGGAAAGACCTGTGCCATTTTCACGTTCCAAACTGCCTAAATCTAAGCATCGTTTTGTCTCATGGTCTGTGAAGCAAAAACAGAAAAGTAGTTATCTGTACTCTCATTCTTGTTTTCTATAGAATTCAATCAGGCCTTATCAGCGAACAGTTCAAATATCCCTCTTAATTGTCCTTTAATTGGATGTTCTGGGATTGGTCATATTAATGGCCGAGATACTGCACACGTGACCCTATCTGGATGCCCTTTGTATCACAATATGGGCTTTGTGAAATGGGCGGAGATGCGTGCTCGGGAAGAAGGTCTTGTTGTTCCAGAATCCATTAGACGGATATCTCAAAACTCACCATCGCCTTCTAAAGTTAAACATAGGGTCGACCGTTCACATCA GTTTAAGACTACACAAAGGGAACCTATGCTTGATGATTTAGCTAGTCAAGTGGAGTTGTATCAGTTTCGTCGTGCTCAACAAAGATTGGTTTCAACTTACGAGACGGATGCCCGGGAACATTTGCTTCTGTGTGCACGAGTAGCTTCGAATTCAGGAAATGTACCCAATAATGCATTTTCCGAAAATATCGAGTTCGCTACAGAACAGCGCATACGTTCTGTTATTTTTGGGACATGGGATTNTAC ACCGTGGTAC ] [+] EMBL CD080525 [ CCGTTCACATCACGTTTAAGACTACACAAAGGGAACCTATGCTTGATGATTTAGCTAGTCAAGTGGAGTTGTATCAGTTTCGTCGTGCTCAACAAAGATTGGTTTCAACTTACGAGACGGATGCCCGGGAACATTTGCTTCTGTGTGCACGAGTAGCTTCGAATTCAGGAAATGTACCCAATAATGCATTTTCCGAAAATATCGAGTTCGCTACAGAACAGCGCATACGTTCTGTTATTTTTGGGACATGGGATT TACAACCGTGGTACCACAGTAATTATCCTGCCGATTTGAGTTGTCTACCTACCATATACATTTGTGAATTCTGTCTATCTGGAATGCGCCATACAGTTGCATATAATCGTCATAAAATTAATTGTGATCGAACGTTTCCTCCAGGTAATGAGATATATCGTAAAGAGAATTTATCGTTCTTTGAAATTGATGGACAAAAACATCAGGAATACTGTCGAAATTTATGTTTATTAGCTAAATTATTTCTGAAACAAAAAACAGTTCATGAATTAGATCAAGTTCCTGCATTTTTATTCTATGTATTAACTGAAACAGAT ] [-] EMBL CD075008 [ TGTTTATTAGCTAAATTATTTCTGAAACAAAAAACAGTTCATGAATTAGATCAAGTTCCTGCATTTTTATTCTATGTATTAACTGAAACAGATCAAGATGGTTCACATATTATTGGTTATTTCTCAAAACAAAAAGCTGATGATCAACGTGACAACTCCGTCAATGCTGTGTACAATAATCTTTCGTGTATTCTCATTTTACCACCGTATCAATGTCGTGGTTTTGGTCGTATGCTTATTGAGATGAGTTATATTTTAAGTCGACTAGAACAACGTATTGGTACACCAGAACGTCCATTATCAGATTTGGGCATCATCATTTACAGAAGATATTGGCGTTTTGAAATTTTAAAATACCTATCGTCATTCACAGCTAAGTCAATTAATATTCGAAGTATGAGTCAAGAATTAGGAATAGCAGTTCCTGATATTGTAAGCACTTTATTAGATATGAAGATGCTTGTTTGCTATCGGACACAATATTACATAATCAATAATAAACCTGATGTAGACGCTCTTTTGAGTACAATTAAACCGCCTGCTACTGATCGTTGTATTGATTCTACATGCCTTCATTGGACTCCTAATGTTAGTAATGTCAGTCAGTTGAGTAAATCGCCTAGTAGTAGTACTCTTAGTATTAGTAGTACTATTAATCAAAAGCTTCATAAATCTAGTCTTATGTCACCAAATGATTCAATTGGAGCAAATATTTGAAGATTTTTCTAGTTTAATTATTGTACATTGAAATATTGTAAGGAGTTTTGTTGTGTACAATCTAATAATATGACTATTATT] [-] EMBL CD074436 [ CATTTTACCACCGTATCAATGTCGTGGTTTTGGTCGTATGCTTATTGAGATGAGTTATATTTTAAGTCGACTAGAACAACGTATTGGTACACCAGAACGTCCATTATCAGATTTGGGCATCATCATTTACAGAAGATATTGGCGTTTTGAAATTTTAAAATACCTATCGTCATTCACAGCTAAGTCAATTAATATTCGAAGTATGAGTCAAGAATTAGGAATAGCAGTTCCTGATATTGTAAGCACTTTATTAGATATGAAGATGCTTGTTTGCTATCGGACACAATATTACATAATCAATAATAAACCTGATGTAGACGCTCTTTTGAGTACAATTAAACCGCCTGCTACTGATCGTTGTATTGATTCTACATGCCTTCATTGGACTCCTAATGTTAGTAATGTCAGTCAGTTGAGTAAATCGCCTAGTAGTAGTACTCTTAGTATTAGTAGTACTATTAATCAAAAGCTTCATAAATCTAGTCTTATGTCACCAAATGATTCAATTGGAGCAAATATTTGAAGATTTTTCTAGTTTAATTATTGTACATTGAAATATTGTAAGGAGTTTTGTTGTGTACAATCTAATAATAATACTATTA ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||