cluster # 6760

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Schistosoma mansoni
cluster # 6760 cluster # 6760 Sequences # 4 consensus # 2

see consensus multiple alignment with clustalw

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consensus_6760#0 length = 944 sequences # 3

consensus_6760#1 length = 665 sequences # 1

consensusID : consensus_6760#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 944
fasta sequence

                              [CGGAGCCATTAATTCGGCACGAGGTGAAAATACAGCTGTATTATGTGATTTAATTTTACGTTTTCCTGATGTTTATCATTCACATTATGATGAAATGAATGATATAACTGCATTATTAAAATGGTCATTTAATTTATTACGTGAATCGAAATTAATGAATAATATAGATGAAAATATTTTATATTTAACTGAACAAGAATTAAATTTTATAAAAAGAGATTCAAATTATGTTAATGAATTTAGTTCAAATCAGAAAATGATCAAAGAGAAGTTGAGAGCAGAATCAGAGCGTAAAGCGAAAAAATCAACTGTTAAACGTGTCAAGAAACCTAAACTTACACCAATTCGAAGTGAACTTTAATAATTTATTTAAATGTCCCCTATACATTTATGTACAATACATGCATATGTATATATGATTATGTATTTATTCTAACTTTCCGTTTTCTTTCATAATTTACTAATGTTGATGATAACATGAATGATGTTCTTATCGAGAGAATTTACTTTGTATTATTATTGTCTATAAATACCTCTGTGTGTGTGTGTTTGGCTAGTTTAATGTAGTACTATTACAAGGAACTTCAGTGTTCATATCGAAACATATCTACCACCAATTAGTAATGAAGTTTATGGACATTGGTTACAAACAGCTATGTTTGCGTGTATGCTTGGGAAACTGAGATTCCCAGTTGTTTTTACTAATTCAGTGTTATGATAATTGGATAACATAAACATACAAACTTACATTCAAATATTGTCTGTTTGCTTCTGGGTTTTGTTATTACTTGTAAAATTTGATAACTTCATTTAACTCTTCTCATTCTTCAGTGTGCTGTATAGTGTATAACTTGTTGGATTAA-TACAAAACTCTGTTGGNTAATTGTTTCTGGCTTGTTTG-TTTTTATTATTTTCTT-AATATCTA-TTATTTTGT-AAATAAAGTT]

[+] EMBL CD081590             [CGGAGCCATTAATTCGGCACGAGGTGAAAATACAGCTGTATTATGTGATTTAATTTTACGTTTTCCTGATGTTTATCATTCACATTATGATGAAATGAATGATATAACTGCATTATTAAAATGGTCATTTAATTTATTACGTGAATCGAAATTAATGAATAATATAGATGAAAATATTTTATATTTAACTGAACAAGAATTAAATTTTATAAAAAGAGATTCAAATTATGTTAATGAATTTAGTTCAAATCAGAAAATGATCAAAGAGAAGTTGAGAGCAGAATCAGAGCGTAAAGCGAAAAAATCAACTGTTAAACGTGTCAAGAAACCTAAACTTACACCAATTCGAAGTGAACTTTAATAATTTATTTAAATGTCCCCTATACATTTATGTACAATACATGCATATGTATATATGATTATGTATTTATTCTAACTTTCCGTTTTCTTTCATAATTTACTAATGTTGATGATAACATGAATGATGTTCTTATCGAGAGAATTTACTTTGTATTATTATTGTCTATAAATACCTCTGTGTGTGTGTGTTTGGCTAGTTTAATGTAGTACTATTACAAGGAACTTCAGTGTTCATATCGAAACATATCTACCACCAATTAGTAATGAAGTTTATGGACATTGGTTACAAACAGCTATGTTTGCGTGTATGCTTGGGAAACTGAGATTCCCAGTTGTTTTTACTAATTCAGTGTTATGATAATTGGATAACATAAACATACAAACTTACATTCAAATATTGTCTGTTTGCTTCTGGGTTTTGTTATTACTTGTAAAATTTGATAACTTCATTTAACTCTTCTCATTCTTCAGTGTGCTGTATAGTGTATAACTTGTTGGATTAA TACAAAACTCTGTTGGNTAATTGTTTCTGGCTTGTTTG TTTTTATTATTTTCTT AATATCTA TTATTTTGT AAATAAAG  ]
[-] EMBL CD195146             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AGCGAAAAAATCACTTGTTAAACGTGTCAAGAAACCTANACTTACACCAATTCGAAGTGAACTTTAATAATTTATTTAAATGTCCCCTATACATTTATGTACAATACATGCATATGTATATATGATTATGTATTTATTCTAACTTTCCGTTTTCTTTCATAATTTACTAATGTTGATGATAACATGAATGATGTTCTTATCGAGAGAATTTACTTTGTATTATTATTGTCTATAAATACCTCTGTGTGTGTGTGTTTGGCTAGTTTAATGTAGTACTATTACAAGGAACTTCAGTGTTCATATCGAAACATATCTACCACCAATTAGTAATGAAGTTTATGGACATTGGTTACAAACAGCTATGTTTGCGTGTATGCTTGGGAAACTGAGATTCCCAGTTGTTTTTACTAATTCAGTGTTATGATAATTGGATAACATAAACATACAAACTTACATTCAAATATTGTCTGTTTGCTTCTGGGTTTTGTCATTACTTGTAAAATTTGATAACTTCGTTTAACTCTTCTCATTCTTCAGTGTGCTGTATA                                                                                                           ]
[-] EMBL CD075414             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ACTTTAATAATTATTTTAAATGTCCCCTATACATTTATGTACAATACATGCATATGTATATATGATTATGTATTTATTCTAACTTTCCGTTTTCTTTCATAATTTACTAATGTTGATGATAACATGAATGATGTTCTTATCGAGAGAATTTACTTTGTATTATTATTGTCTATAAATACCTCTGTGTGTGTGTGTTTGGCTAGTTTAATGTAGTACTATTACAAGGAACTTCAGTGTTCATATCGAAACATATCTACCACCAATTAGTAATGAAGTTTATGGACATTGGTTACAAACAGCTATGTTTGCGTGTATGCTTGGGAAACTGAGATTCCCAGTTGTTTTTACTAATTCAGTGTTATGATAATTGGATAACATAAACATACAAACTTACATTCAAATATTGTCTGTTTGCTTCTGGGTTTTGTTATTACTTGTAAAATTTGATAACTTCATTTAACTCTTCTCATTCTTCAGTGTGCTGTATAGTGTATAACTTGTTGGATTAATTACAAAACTCTGTTTGTTAATTGTTTCTGTCTTGTTTGTTTTTTATTATTTTCTTAAATATCTATTTATTTTGTAAAATAAAGTT]




>consensus_6760#0
CGGAGCCATTAATTCGGCACGAGGTGAAAATACAGCTGTATTATGTGATTTAATTTTACG
TTTTCCTGATGTTTATCATTCACATTATGATGAAATGAATGATATAACTGCATTATTAAA
ATGGTCATTTAATTTATTACGTGAATCGAAATTAATGAATAATATAGATGAAAATATTTT
ATATTTAACTGAACAAGAATTAAATTTTATAAAAAGAGATTCAAATTATGTTAATGAATT
TAGTTCAAATCAGAAAATGATCAAAGAGAAGTTGAGAGCAGAATCAGAGCGTAAAGCGAA
AAAATCAACTGTTAAACGTGTCAAGAAACCTAAACTTACACCAATTCGAAGTGAACTTTA
ATAATTTATTTAAATGTCCCCTATACATTTATGTACAATACATGCATATGTATATATGAT
TATGTATTTATTCTAACTTTCCGTTTTCTTTCATAATTTACTAATGTTGATGATAACATG
AATGATGTTCTTATCGAGAGAATTTACTTTGTATTATTATTGTCTATAAATACCTCTGTG
TGTGTGTGTTTGGCTAGTTTAATGTAGTACTATTACAAGGAACTTCAGTGTTCATATCGA
AACATATCTACCACCAATTAGTAATGAAGTTTATGGACATTGGTTACAAACAGCTATGTT
TGCGTGTATGCTTGGGAAACTGAGATTCCCAGTTGTTTTTACTAATTCAGTGTTATGATA
ATTGGATAACATAAACATACAAACTTACATTCAAATATTGTCTGTTTGCTTCTGGGTTTT
GTTATTACTTGTAAAATTTGATAACTTCATTTAACTCTTCTCATTCTTCAGTGTGCTGTA
TAGTGTATAACTTGTTGGATTAATACAAAACTCTGTTGGNTAATTGTTTCTGGCTTGTTT
GTTTTTATTATTTTCTTAATATCTATTATTTTGTAAATAAAGTT

consensusID : consensus_6760#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 665
fasta sequence

                              [GCGAATACTGGGCCGAAGTACCATCAGGACGACATGATGATGTTGCTCTAAAAATTCTTCAAAACATCATCAATATTCTTCAGGAATCACGTAAAATACTAAACAATACTGATATTAATTCAGAGACTAAAAACGATACAATAGGACAAGCTTTTGCATTAACTTTTGAAAATACAGCTGTATTATGTGATTTAATTTTACGTTTTCCTGATGTTTATCATTCACATTATGATGAAATGAATGATATAACTGCATTATTAAAATGGTCATTTAATTTATTACGTGAATCGAAATTAATGAATAATATAGATGAAAATATTTTATATTTAACTGAACAAGAATTAAATTTTATAAAAAGAGATTCAAATTATGTTAATGAATTTAGTTCAAATCAGAAAATGATCAAAGAGAAGTTGAGAGCAGAATCAGAGCGTAAAGCGAAAAAATCAACTGTTAAACGTGTCAAGAAACCTAAACTTACACCAATTCGAAGTGAACTTTAATAATTTATTTAAATGTCCCCTATACATTTATGTACAATACATGCATATGTATATATGATTATGTATTTATTCTAACTTTCCGTTTTCTTTCATAATTTACTAATGTTGATGATAACATGAATGATGTTCTTATCGAGAGAATNTACTTTGTATTATTATTGG]

[+] EMBL CD081386             [GCGAATACTGGGCCGAAGTACCATCAGGACGACATGATGATGTTGCTCTAAAAATTCTTCAAAACATCATCAATATTCTTCAGGAATCACGTAAAATACTAAACAATACTGATATTAATTCAGAGACTAAAAACGATACAATAGGACAAGCTTTTGCATTAACTTTTGAAAATACAGCTGTATTATGTGATTTAATTTTACGTTTTCCTGATGTTTATCATTCACATTATGATGAAATGAATGATATAACTGCATTATTAAAATGGTCATTTAATTTATTACGTGAATCGAAATTAATGAATAATATAGATGAAAATATTTTATATTTAACTGAACAAGAATTAAATTTTATAAAAAGAGATTCAAATTATGTTAATGAATTTAGTTCAAATCAGAAAATGATCAAAGAGAAGTTGAGAGCAGAATCAGAGCGTAAAGCGAAAAAATCAACTGTTAAACGTGTCAAGAAACCTAAACTTACACCAATTCGAAGTGAACTTTAATAATTTATTTAAATGTCCCCTATACATTTATGTACAATACATGCATATGTATATATGATTATGTATTTATTCTAACTTTCCGTTTTCTTTCATAATTTACTAATGTTGATGATAACATGAATGATGTTCTTATCGAGAGAATNTACTTTGTATTATTATTGG]




>consensus_6760#1
GCGAATACTGGGCCGAAGTACCATCAGGACGACATGATGATGTTGCTCTAAAAATTCTTC
AAAACATCATCAATATTCTTCAGGAATCACGTAAAATACTAAACAATACTGATATTAATT
CAGAGACTAAAAACGATACAATAGGACAAGCTTTTGCATTAACTTTTGAAAATACAGCTG
TATTATGTGATTTAATTTTACGTTTTCCTGATGTTTATCATTCACATTATGATGAAATGA
ATGATATAACTGCATTATTAAAATGGTCATTTAATTTATTACGTGAATCGAAATTAATGA
ATAATATAGATGAAAATATTTTATATTTAACTGAACAAGAATTAAATTTTATAAAAAGAG
ATTCAAATTATGTTAATGAATTTAGTTCAAATCAGAAAATGATCAAAGAGAAGTTGAGAG
CAGAATCAGAGCGTAAAGCGAAAAAATCAACTGTTAAACGTGTCAAGAAACCTAAACTTA
CACCAATTCGAAGTGAACTTTAATAATTTATTTAAATGTCCCCTATACATTTATGTACAA
TACATGCATATGTATATATGATTATGTATTTATTCTAACTTTCCGTTTTCTTTCATAATT
TACTAATGTTGATGATAACATGAATGATGTTCTTATCGAGAGAATNTACTTTGTATTATT
ATTGG

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_6760#0      ------------------------------------------------------------
consensus_6760#1      GCGAATACTGGGCCGAAGTACCATCAGGACGACATGATGATGTTGCTCTAAAAATTCTTC 60
                                                                                  

consensus_6760#0      ------------------------------------------------------------
consensus_6760#1      AAAACATCATCAATATTCTTCAGGAATCACGTAAAATACTAAACAATACTGATATTAATT 120
                                                                                  

consensus_6760#0      ----------------------CGGAGCCATTAATTCGGCACGAGGTGAAAATACAGCTG 38
consensus_6760#1      CAGAGACTAAAAACGATACAATAGGACAAGCTTTTGCATTAACTTTTGAAAATACAGCTG 180
                                             ***     *  * *   *     **************

consensus_6760#0      TATTATGTGATTTAATTTTACGTTTTCCTGATGTTTATCATTCACATTATGATGAAATGA 98
consensus_6760#1      TATTATGTGATTTAATTTTACGTTTTCCTGATGTTTATCATTCACATTATGATGAAATGA 240
                      ************************************************************

consensus_6760#0      ATGATATAACTGCATTATTAAAATGGTCATTTAATTTATTACGTGAATCGAAATTAATGA 158
consensus_6760#1      ATGATATAACTGCATTATTAAAATGGTCATTTAATTTATTACGTGAATCGAAATTAATGA 300
                      ************************************************************

consensus_6760#0      ATAATATAGATGAAAATATTTTATATTTAACTGAACAAGAATTAAATTTTATAAAAAGAG 218
consensus_6760#1      ATAATATAGATGAAAATATTTTATATTTAACTGAACAAGAATTAAATTTTATAAAAAGAG 360
                      ************************************************************

consensus_6760#0      ATTCAAATTATGTTAATGAATTTAGTTCAAATCAGAAAATGATCAAAGAGAAGTTGAGAG 278
consensus_6760#1      ATTCAAATTATGTTAATGAATTTAGTTCAAATCAGAAAATGATCAAAGAGAAGTTGAGAG 420
                      ************************************************************

consensus_6760#0      CAGAATCAGAGCGTAAAGCGAAAAAATCAACTGTTAAACGTGTCAAGAAACCTAAACTTA 338
consensus_6760#1      CAGAATCAGAGCGTAAAGCGAAAAAATCAACTGTTAAACGTGTCAAGAAACCTAAACTTA 480
                      ************************************************************

consensus_6760#0      CACCAATTCGAAGTGAACTTTAATAATTTATTTAAATGTCCCCTATACATTTATGTACAA 398
consensus_6760#1      CACCAATTCGAAGTGAACTTTAATAATTTATTTAAATGTCCCCTATACATTTATGTACAA 540
                      ************************************************************

consensus_6760#0      TACATGCATATGTATATATGATTATGTATTTATTCTAACTTTCCGTTTTCTTTCATAATT 458
consensus_6760#1      TACATGCATATGTATATATGATTATGTATTTATTCTAACTTTCCGTTTTCTTTCATAATT 600
                      ************************************************************

consensus_6760#0      TACTAATGTTGATGATAACATGAATGATGTTCTTATCGAGAGAATTTACTTTGTATTATT 518
consensus_6760#1      TACTAATGTTGATGATAACATGAATGATGTTCTTATCGAGAGAATNTACTTTGTATTATT 660
                      ********************************************* **************

consensus_6760#0      ATTGTCTATAAATACCTCTGTGTGTGTGTGTTTGGCTAGTTTAATGTAGTACTATTACAA 578
consensus_6760#1      ATTGG------------------------------------------------------- 665
                      ****                                                        

consensus_6760#0      GGAACTTCAGTGTTCATATCGAAACATATCTACCACCAATTAGTAATGAAGTTTATGGAC 638
consensus_6760#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6760#0      ATTGGTTACAAACAGCTATGTTTGCGTGTATGCTTGGGAAACTGAGATTCCCAGTTGTTT 698
consensus_6760#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6760#0      TTACTAATTCAGTGTTATGATAATTGGATAACATAAACATACAAACTTACATTCAAATAT 758
consensus_6760#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6760#0      TGTCTGTTTGCTTCTGGGTTTTGTTATTACTTGTAAAATTTGATAACTTCATTTAACTCT 818
consensus_6760#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6760#0      TCTCATTCTTCAGTGTGCTGTATAGTGTATAACTTGTTGGATTAATACAAAACTCTGTTG 878
consensus_6760#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6760#0      GNTAATTGTTTCTGGCTTGTTTGTTTTTATTATTTTCTTAATATCTATTATTTTGTAAAT 938
consensus_6760#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6760#0      AAAGTT 944
consensus_6760#1      ------