cluster # 6784

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Schistosoma mansoni
cluster # 6784 cluster # 6784 Sequences # 4 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_6784#0 length = 653 sequences # 4

consensusID : consensus_6784#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 653
fasta sequence

                              [AGCAATATTCTCAATAATTTAAAACATTAATTTGCATATAATAGAAAACTTTCTAATGATTATGAGATACCATAAGGAATTTGCTAAAGTTTAAATAACTACGCTTGATTATATTTTTGGGCTAATTTTTCTAAAAAAATTGTACTCTGTTTAAAGTTCATTGTAAATTGGTAAATATTTATATTTAACGTATGAGTCATATGAAGAGCGTTTACTTCAAAATTCGAATAACAATTTATAGTGTTAACAAACGTTTTGAGTAATACATTAAAACTATAGCAAAAAACTGAATACAATACAAAAGGATTAATCTTAAAAGGAT-AAAAACTATATTGTTGTAATAAAACAAAATGGATTTACTTTACTGACAAAGGAGTACACCGATGTCACGTATGTGTGAATAAATAACAGAAGTAGTAGAAGGAAAATAAGTTATGAGACTATGTATACACACATACATATTCTTAATTATAAATTTAAGGATAGCAATTTACTAAATTGTTAACTCTTCAAATATTCTACAGGTTTATATTAGTGAACTAAACAYGCGAAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAGTACTACATTCTATGCATATCGTACTATTACGGAGTAATACAAACATTCATTATGAAGAATA]

[+] EMBL AI976013             [AGCAATATTCTCAATAATTTAAAACATTAATTTGCATATAATAGAAAACTTTCTAATGATTATGAGATACCATAAGGAATTTGCTAAAGTTTAAATAACTACGCTTGATTATATTTTTGTGCTAATTTTTCTAAAAAAATTGTACTCTGTTTAAAGTTCATTGTAAATTGGTAAATATTTATATTTAACGTATGAGTCATATGAAGAGCGTTTACTTCAAAATTCGAATAACAATTTATAGTGTTAACAAACGTTTTGAGTAATACATTAAAACTATAGCAAAAAACTGAATACAATACAAAAGGATTAATCTTAAAAGGAT AAAAACTATATTGTTGTAATAAAACAAAATGGATTTACTTTACTGACAAAGGAGTACACCGATGTCACGTATGTGTGAATAAATAACAGAAGTAGTAGAAGGAAAATAAGTTATGAGACTATGTATACACACATACATATTCTTAATTATAAATTTAAGGATAGCAATTTACTAAATTGTTAA                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD076783             [AGCAATATTCTCAATAATTTAAAACATTAATTTGCATATAATAGAAAACTTTCTAATGATTATGAGATACCATAAGGAATTTGCTAAAGTTTAAATAACTACGCTTGATTATATTTTTGGGCTAATTTTTCTAAAAAAATTGTACTCTGTTTAAAGTTCATTGTAAATTGGTAAATATTTATATTTAACGTATGAGTCATATGAAGAGCGTTTACTTCAAAATTCGAATAACAATTTATAGTGTTAACAAACGTTTTGAGTAATACATTAAAACTATAGCAAAAAACTGAATACAATACAAAAGGATTAATCTTAAAAGGAT AAAAACTATATTGTTGTAATAAAACAAAATGGATTTACTTTACTGACAAAGGAGTACACCGATGTCACGTATGTGTGAATAAATAACAGAAGTAGTAGAAGGAAAATAAGTTATGAGACTATGTATACACACATACATATTCTTAATTATAAATTTAAGGATAGCAATTTACTAAAT                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD075675             [                  TTAAAACATTAATTTGCATATAATAAAAAACTTTCTAATGATTATGAAATCCCATAAGGAATTTGCTAAAGTTTAAATAACTACCCTTGATTATATTTTTGGGCTAATTTTTCTAAAAAAATTGTACTCTGTTTAAAGTTCATTGTAAATTGGTAAATATTTATATTTAACGTATGAGTCATATGAAAAGCGTTTACTTCAAAATTCGAATAACAATTTATAGGGTTAACAAACGTTTTGAGTAATACATTAAAACTATAGCAAAAAACTGAATACAATACAAAAGGATTAATCTTAAAAGGAT AAAAACTATTTTGTTGTAATAAAACAAAATGGATTTACTTTACTGACAAAGGAGTACACCGATGTCACGTATGTGTGAATAAATAACAGAAGT GTA AAGGAAA                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL AW061627             [                                                                                                                                                    GTTT AAG TCA TGTAAA TGGTAAATA TTATATTTAACG ATGAGTCATATG AGAGCG TTACTTCAAAA TCGGATAACAA TTATA TGTTAACAAACG TTTGAGTAATACA TAAAACTATAGC GAAAACTGAATACAATACAAAAGGGTT ATCTTAAAAGGATAAAAAACTATATTGTTGTTATAAAACAAAATGGATTTACTTTACTGACAAAGGAGTACACCGATGTCACGTATGTGTGAATAAATAACAGAAGTAGTAGAAGGGAAATAAGTTATGAGACTATGTATACACACATACATATTCTTAATTATAAATTTAAGGATAGCAATTTACTAAATTGTTAACTCTTCAAATATTCTACAGGTTTATATTAGTGAACTAAACAYGCGAAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAGTACTACATTCTATGCATATCGTACTATTACGGAGTAATACAAACATTCATTATGAAGAATA]




>consensus_6784#0
AGCAATATTCTCAATAATTTAAAACATTAATTTGCATATAATAGAAAACTTTCTAATGAT
TATGAGATACCATAAGGAATTTGCTAAAGTTTAAATAACTACGCTTGATTATATTTTTGG
GCTAATTTTTCTAAAAAAATTGTACTCTGTTTAAAGTTCATTGTAAATTGGTAAATATTT
ATATTTAACGTATGAGTCATATGAAGAGCGTTTACTTCAAAATTCGAATAACAATTTATA
GTGTTAACAAACGTTTTGAGTAATACATTAAAACTATAGCAAAAAACTGAATACAATACA
AAAGGATTAATCTTAAAAGGATAAAAACTATATTGTTGTAATAAAACAAAATGGATTTAC
TTTACTGACAAAGGAGTACACCGATGTCACGTATGTGTGAATAAATAACAGAAGTAGTAG
AAGGAAAATAAGTTATGAGACTATGTATACACACATACATATTCTTAATTATAAATTTAA
GGATAGCAATTTACTAAATTGTTAACTCTTCAAATATTCTACAGGTTTATATTAGTGAAC
TAAACAYGCGAAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAGTACTACAT
TCTATGCATATCGTACTATTACGGAGTAATACAAACATTCATTATGAAGAATA

clustalw multiple alignements is not computed in this case