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Schistosoma mansoni
cluster # 6800 cluster # 6800       Sequences # 4       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6800#0 length = 1126 sequences # 4  
consensusID : consensus_6800#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1126
fasta sequence 
                              [GAGGTGTCATCTCAGTCAGTATCATTATTTAGCTTCTGGTAGTCGAGATTGTACAGTGATGTTATGGATGTTTAGTGTACAACGTTCACGCATTGTCAATAGTCAAGGTTTACCAAAACCATTGTTTATTCTAAATGGTCATGAAACAAGTATCAATTGTATCAGTTTATCAGCTGAATTAGGATTAGTTATAAGTGGATCAATGAATGGAACTTGTTTATTACATTCAACTCGTGGTGAACTACTGCGTTGCTTACCTTCACCATGTACAACAATATTAAACCATCAACCTTCAACATCATCATCGACAGCAATAGTAGACAATGATGTTACAGCACCAATGCAGCCTAATCTACTCACTTATCATCGTGAAGGTTATCTACTTGGTCTGTTTAATCTATCACAATTATCACTGTATACTTTAAATGGAAAATTATTACGTACTACTGATTTAAGCATTCTTTCAAATAACACAAGTTGTCCATATCAAATTAATGCTGTGTTATTTAGTAATTGTGGTCGTTACATTCTTATAGCTGGTAATGATGGTGTTATATGGATTTTAAGAAGTTATAATTTATTACCAGTTCATGCATTTCCTAAATGTGATACATCTATAGGATCGTTGTGCTTAAGTCATGATCAACGATTTATTTTCGCTGGTCTGAAATCTGGTTGTCTGGTTGTATTCTACATTGACTTCAATCAGTGGCATCATGAATTTCAACAACGTTACTTTTAAATCATT-AAAGAGAACTGATCTACCAATACATATCAATTTATTAATACCGAAGCGTATTCATTTCAAACTGTTTTTAATATTTTGGAATTACTAAAATTTGATTTCAGTAGTTAAATATGTAGACACGTTTTATTTTCCATTGTCTTTTGTGTTGGGACCATTTATAAATTAAAACTTTTGATGTTGTTCCTGTAGTTCAGGTATATTTTTGACACGTTTTTTCCTCTCTATATTTGTCTACCCACATATTTCAGTGGTCATATCATATATGAATATGATAATCAAGAAACCGTTGTTATGTTTCCTCTCGAGCACTTTCTCATTGTAAAAATATTGTAAGTTTTTTTATGCAATCCATGATGCTTAAATAAATAAAAACACTAT]

[+] EMBL CD081986             [GAGGTGTCATCTCAGTCAGTATCATTATTTAGCTTCTGGTAGTCGAGATTGTACAGTGATGTTATGGATGTTTAGTGTACAACGTTCACGCATTGTCAATAGTCAAGGTTTACCAAAACCATTGTTTATTCTAAATGGTCATGAAACAAGTATCAATTGTATCAGTTTATCAGCTGAATTAGGATTAGTTATAAGTGGATCAATGAATGGAACTTGTTTATTACATTCAACTCGTGGTGAACTACTGCGTTGCTTACCTTCACCATGTACAACAATATTAAACCATCAACCTTCAACATCATCATCGACAGCAATAGTAGACAATGATGTTACAGCACCAATGCAGCCTAATCTACTCACTTATCATCGTGAAGGTTATCTACTTGGTCTGTTTAATCTATCACAATTATCACTGTATACTTTAAATGGAAAATTATTACGTACTACTGATTTAAGCATTCTTTCAAATAACACAAGTTGTCCATATCAAATTAATGCTGTGTTATTTAGTAATTGTGGTCGTTACATTCTTATAGCTGGTAATGATGGTGTTATATGGATTTTAAGAAGTTATAATTTATTACCAGTTCATGCATTTCCTAAATGTGATACATCTATAGGATCGTTGTGCTTAAGTCATGATCAACGATTTATTTTCGCTGGTCTGAAATCTGGTTGTCTGGTTGTATTCTACATTGACTTCAATCAGTGGCATCATG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD082443             [                                                                                  CGTTCACGCATTGTCAATAGTCAAGGTTTACCAAAACCATTGTTTATTCTAAATGGTCATGAAACAAGTATCAATTGTATCAGTTTATCAGCTGAATTAGGATTAGTTATAAGTGGATCAATGAATGGAACTTGTTTATTACATTCAACTCGTGGTGAACTACTGCGTTGCTTACCTTCACCATGTACAACAATATTAAACCATCAACCTTCAACATCATCATCGACAGCAATAGTAGACAATGATGTTACAGCACCAATGCAGCCTAATCTACTCACTTATCATCGTGAAGGTTATCTACTTGGTCTGTTTAATCTATCACAATTATCACTGTATACTTTAAATGGAAAATTATTACGTACTACTGATTTAAGCATTCTTTCAAATAACACAAGTTGTCCATATCAAATTAATGCTGTGTTATTTAGTAATTGTGGTCGTTACATTCTTATAGCTGGTAATGATGGTGTTATATGGATTTTAAGAAGTTATAATTTATTACCAGTTCATGCATTTCCTAAATGTGATACATCTATAGGATCGTTGTGCTTAAGTCATGATCAACGATTTATTTTCGCTGGTCTGAAATCTGGTTGTCTGGTTGTATTCTACATTGACTTCAATCAGTGGCATCATGAATTTCAAACACGTTACTTTTAAATCATT ANAGAGAACTGATCTAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD083502             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AGCACCAATGCAGCCTAATCTACTCACTTATCATCGTGAAGGTTATCTACTTGGTCTGTTTAATCTATCACAATTATCACTGTATACTTTAAATGGAAAATTATTACGTACTACTGATTTAAGCATTCTTTCAAATAACACAAGTTGTCCATATCAAATTAATGCTGTGTTATTTAGTAATTGTGGTCGTTACATTCTTATAGCTGGTAATGATGGTGTTATATGGATTTTAAGAAGTTATAATTTATTACCAGTTCATGCATTTCCTAAATGTGATACATCTATAGGATCGTTGTGCTTAAGTCATGATCAACGATTTATTTTCGCTGGTCTGAAATCTGGTTGTCTGGTTGTATTCTACATTGACTTCAATCAGTGGCATCATGAATTTCAACAACGTTACTTTTAAATCATTAAAAGAGAACTGATCTACCAATACATAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL CD076042             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 CTTATAGCTGGTAATGATGGTGTTATATGGATTTTAAGAAGTTATAATTTATTACCAGTTCATGCATTTCCTAAATGTGATACATCTATAGGATCGTTGTGCTTAAGTCATGATCAACGATTTATTTTCGCTGGTCTGAAATCTGGTTGTCTGGTTGTATTCTACATTGACTTCAATCAGTGGCATCATGAATTTCAACAACGTTACTTTTAAATCATTAAAAGAGAACTGATCTACCAATACATATCAATTTATTAATACCGAAGCGTATTCATTTCAAACTGTTTTTAATATTTTGGAATTACTAAAATTTGATTTCAGTAGTTAAATATGTAGACACGTTTTATTTTCCATTGTCTTTTGTGTTGGGACCATTTATAAATTAAAACTTTTGATGTTGTTCCTGTAGTTCAGGTATATTTTTGACACGTTTTTTCCTCTCTATATTTGTCTACCCACATATTTCAGTGGTCATATCATATATGAATATGATAATCAAGAAACCGTTGTTATGTTTCCTCTCGAGCACTTTCTCATTGTAAAAATATTGTAAGTTTTTTTATGCAATCCATGATGCTTAAATAAATAAAAACACTAT]




>consensus_6800#0
GAGGTGTCATCTCAGTCAGTATCATTATTTAGCTTCTGGTAGTCGAGATTGTACAGTGAT
GTTATGGATGTTTAGTGTACAACGTTCACGCATTGTCAATAGTCAAGGTTTACCAAAACC
ATTGTTTATTCTAAATGGTCATGAAACAAGTATCAATTGTATCAGTTTATCAGCTGAATT
AGGATTAGTTATAAGTGGATCAATGAATGGAACTTGTTTATTACATTCAACTCGTGGTGA
ACTACTGCGTTGCTTACCTTCACCATGTACAACAATATTAAACCATCAACCTTCAACATC
ATCATCGACAGCAATAGTAGACAATGATGTTACAGCACCAATGCAGCCTAATCTACTCAC
TTATCATCGTGAAGGTTATCTACTTGGTCTGTTTAATCTATCACAATTATCACTGTATAC
TTTAAATGGAAAATTATTACGTACTACTGATTTAAGCATTCTTTCAAATAACACAAGTTG
TCCATATCAAATTAATGCTGTGTTATTTAGTAATTGTGGTCGTTACATTCTTATAGCTGG
TAATGATGGTGTTATATGGATTTTAAGAAGTTATAATTTATTACCAGTTCATGCATTTCC
TAAATGTGATACATCTATAGGATCGTTGTGCTTAAGTCATGATCAACGATTTATTTTCGC
TGGTCTGAAATCTGGTTGTCTGGTTGTATTCTACATTGACTTCAATCAGTGGCATCATGA
ATTTCAACAACGTTACTTTTAAATCATTAAAGAGAACTGATCTACCAATACATATCAATT
TATTAATACCGAAGCGTATTCATTTCAAACTGTTTTTAATATTTTGGAATTACTAAAATT
TGATTTCAGTAGTTAAATATGTAGACACGTTTTATTTTCCATTGTCTTTTGTGTTGGGAC
CATTTATAAATTAAAACTTTTGATGTTGTTCCTGTAGTTCAGGTATATTTTTGACACGTT
TTTTCCTCTCTATATTTGTCTACCCACATATTTCAGTGGTCATATCATATATGAATATGA
TAATCAAGAAACCGTTGTTATGTTTCCTCTCGAGCACTTTCTCATTGTAAAAATATTGTA
AGTTTTTTTATGCAATCCATGATGCTTAAATAAATAAAAACACTAT

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)