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Schistosoma mansoni
cluster # 6817 cluster # 6817       Sequences # 4       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6817#0 length = 1119 sequences # 4  
consensusID : consensus_6817#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1119
fasta sequence 
                              [CAGTTTTAAATCACTCAGATGCAACAGTGTATTATATCAATTTTTCACCAAATAATTCAGGACGTAAATGTTTTGCAGACCCAACATCTGTTCAATTACCGATTTCCGATTCCTCTCTGGTGCCTCGTGTTCCAGCCTCACTACCTATTCTTTCAGGTCCTTTTCTGGACAGACCACCGACTCCACCAAGGCTGACGACATCTACGAATAATATTACTTCCGATGGTAATTCATCTATTCCCAAAACACCACAATTACATTACGCTCACCTTACACTATCTGACAAAGTAAATAGTTCAATGACAAATATGTGTCAACATAAAACATCAGATGATTTAACGAATGATGATGGTAATATTTGTCTTCACTCAACTCAATCTTTACAGTGTGCATTATCTTCTAATCCAAATTGTTCTGAAACTGAGTTCCTGGATCGTAGCTGTAACCTAGTTGGCAATAATTCTCATGACTGTTTCTCACAAGGAGTAAATTATGTAACTATAGATATGAGACAGACTAAAGCACTTTCTGAATTAGAACAAGAATTGCGCATCAGTACTGGATTAGTACGTAATGCTGGTTATCATATACCAAGGTCAGAATGTATCCTTCACAATCAGAATTGTGATAATGTGAAAACTGGTAATAAATTCACAGTGTTACGCAGGCATTTTACAATTTCATGCAACCTCCCCGCTTATTTTGCCAGAAAAAAAGGTGATACGGTTCATGCATTAACAAGCTCTCCAACAAATTCACAAGGAAAGAAACAAAATCATGAAAATATCACTTCCATGACCAATCGAGTTATAAAGCGTTTAATCCATTCATTTCACCTCCCACATCACCAAAATTAGCATTGTAGTAAAACTGTCTAAAGCCAAATCAGTTGTTTCTATTTTTTTTTGTATTTATCCCTACCCAATTTATTATTTAATTAAAGAATAGTACTAAATAACATCTGCTTTACACAAAGATTCATTTAATATGAATAACAAACTGTTTAATTTGACCAATGCGTGCACCATTATATTAGTGTTGCAGAAATATGTTATTTTTGTATTATTATCATACATATATGTATATTTCTTTATCAATCTTTTTTTTATAATAAAGTTA]

[+] EMBL AI976725             [CAGTTTTAAATCACTCAGATGCAACAGTGTATTATATCAATTTTTCACCAAATAATTCAGGACGTAAATGTTTTGCAGACCCAACATCTGTTCAATTACCGATTTCCGATTCCTCTCTGGTGCCTCGTGTTCCAGCCTCACTACCTATTCTTTCAGGTCCTTTTCTGGACAGACCACCGACTCCACCAAGGCTGACGACATCTACGAATAATATTACTTCCGATGGTAATTCATCTATTCCCAAAACACCACAATTACATTACGCTCACCTTACACTATCTGACAAAGTAAATAGTTCAATGACAAATATGTGTCAACATAAAACATCAGATGATTTAACGAATGATGATGGTAATATTTGTCTTCACTCAACTCAATCTTTACAGTGTGCATTATCTTCTAATCCAAATTGTTCTGAAACTGAGTTCCTGGATCGTAGCTGTAACCTAGTTGGCAATAATTCTCATGACTGTTTCTCACAAGGAGTAAATTATGTAACTATAGATATGAGACAGACTAAAGCACTTTCTGAATTAGAACAAGAATTGCGCATCAGTACTGGATTAGTACGTAATGCTGGTTATCATATACCAAGGTCAGAATGTATCCTTCACAATCAGAATTGTGATAATGTGAAAACTGGTAATAAATTCACAGTGTTACGCAGGCATTTTACAATTTCATGCAACCTCCCCGCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD082836             [ AGTTTT AATCACTCAGATGCAACAGTGTATTATATCAATTTTTCACCAAATAATTCAGGACGTAAATGTTTTGCAGACCCAACATCTGTTCAATTACCGATTTCCGATTCCTCTCTGGTGCCTCGTGTTCCAGCCTCACTACCTATTCTTTCAGGTCCTTTTCTGGACAGACCACCGACTCCACCAAGGCTGACGACATCTACGAATAATATTACTTCCGATGGTAATTCATCTATTCCCAAAACACCACAATTACATTACGCTCACCTTACACTATCTGACAAAGTAAATAGTTCAATGACAAATATGTGTCAACATAAAACATCAGATGATTTAACGAATGATGATGGTAATATTTGTCTTCACTCAACTCAATCTTTACAGTGTGCATTATCTTCTAATCCAAATTGTTCTGAAACTGAGTTCCTGGATCGTAGCTGTAACCTAGTTGGCAATAATTCTCATGACTGTTTCTCACAAGGAGTAAATTATGTAACTATAGATATGAGACAGACTAAAGCACTTTCTGAATTAGAACAAGAATTGCGCATCAGTACTGGATTAGTACGTAATGCTGGTTATCATAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD113942             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TGATGGTAATATTTGTCTTCACTCAACTCAATCTTTACAGTGTGCATTATCTTCTAATCCAAATTGTTCTGAAACTGAGTTCCTGGATCGTAGCTGTAACCTAGTTGGCAATAATTCTCATGACTGTTTCTCACAAGGAGTAAATTATGTAACTATAGATATGAGACAGACTAAAGCACTTTCTGAATTAGAACAAGAATTGCGCATCAGTACTGGATTAGTACGTAATGCTGGTTATCATATACCAAGGTCAGAATGTATCCTTCACAATCAGAATTGTGATAATGTGAAAACTGGTAATAAATTCACAGTGTTACGCAGGCATTTAACAATTTCATGCAACCTCCCCGCTTATTTTGCCAGAAAAAAAGGTGATACGGTTCATGCATTAACAAGCTCTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD076423             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TTCTGAATTAGAACAAGAATTGCGCATCAGTACTGGATTAGTACGTAATGCTGGTTATCATATACCAAGGTCAGAATGTATCCTTCACAATCAGAATTGTGATAATGTGAAAACTGGTAATAAATTCACAGTGTTACGCAGGCATTTTACAATTTCATGCAACCTCCCCGCTTATTTTGCCAGAAAAAAAGGTGATACGGTTCATGCATTAACAAGCTCTCCAACAAATTCACAAGGAAAGAAACAAAATCATGAAAATATCACTTCCATGACCAATCGAGTTATAAAGCGTTTAATCCATTCATTTCACCTCCCACATCACCAAAATTAGCATTGTAGTAAAACTGTCTAAAGCCAAATCAGTTGTTTCTATTTTTTTTTGTATTTATCCCTACCCAATTTATTATTTAATTAAAGAATAGTACTAAATAACATCTGCTTTACACAAAGATTCATTTAATATGAATAACAAACTGTTTAATTTGACCAATGCGTGCACCATTATATTAGTGTTGCAGAAATATGTTATTTTTGTATTATTATCATACATATATGTATATTTCTTTATCAATCTTTTTTTTATAATAAAGTTA]




>consensus_6817#0
CAGTTTTAAATCACTCAGATGCAACAGTGTATTATATCAATTTTTCACCAAATAATTCAG
GACGTAAATGTTTTGCAGACCCAACATCTGTTCAATTACCGATTTCCGATTCCTCTCTGG
TGCCTCGTGTTCCAGCCTCACTACCTATTCTTTCAGGTCCTTTTCTGGACAGACCACCGA
CTCCACCAAGGCTGACGACATCTACGAATAATATTACTTCCGATGGTAATTCATCTATTC
CCAAAACACCACAATTACATTACGCTCACCTTACACTATCTGACAAAGTAAATAGTTCAA
TGACAAATATGTGTCAACATAAAACATCAGATGATTTAACGAATGATGATGGTAATATTT
GTCTTCACTCAACTCAATCTTTACAGTGTGCATTATCTTCTAATCCAAATTGTTCTGAAA
CTGAGTTCCTGGATCGTAGCTGTAACCTAGTTGGCAATAATTCTCATGACTGTTTCTCAC
AAGGAGTAAATTATGTAACTATAGATATGAGACAGACTAAAGCACTTTCTGAATTAGAAC
AAGAATTGCGCATCAGTACTGGATTAGTACGTAATGCTGGTTATCATATACCAAGGTCAG
AATGTATCCTTCACAATCAGAATTGTGATAATGTGAAAACTGGTAATAAATTCACAGTGT
TACGCAGGCATTTTACAATTTCATGCAACCTCCCCGCTTATTTTGCCAGAAAAAAAGGTG
ATACGGTTCATGCATTAACAAGCTCTCCAACAAATTCACAAGGAAAGAAACAAAATCATG
AAAATATCACTTCCATGACCAATCGAGTTATAAAGCGTTTAATCCATTCATTTCACCTCC
CACATCACCAAAATTAGCATTGTAGTAAAACTGTCTAAAGCCAAATCAGTTGTTTCTATT
TTTTTTTGTATTTATCCCTACCCAATTTATTATTTAATTAAAGAATAGTACTAAATAACA
TCTGCTTTACACAAAGATTCATTTAATATGAATAACAAACTGTTTAATTTGACCAATGCG
TGCACCATTATATTAGTGTTGCAGAAATATGTTATTTTTGTATTATTATCATACATATAT
GTATATTTCTTTATCAATCTTTTTTTTATAATAAAGTTA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)