cluster # 6820

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Schistosoma mansoni
cluster # 6820 cluster # 6820 Sequences # 4 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_6820#0 length = 486 sequences # 4

consensusID : consensus_6820#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 486
fasta sequence

                              [AAGTATAAAAAAATAAAAAAAAAAACGAGAAAAAATTTGCTTATTGGCTGATATGATAAACAAGTCACAAACAGGCTATATGATAAAGGACATGTATCGTTTAATTTATTTTATTGGAGCCACTATGTTGACGAGATCTTAGTCCTCGAAACAATCGTGGACTAGGTACTGAATTAAACACGTTTGCTTTATACATATCAGGAGTTTCGTTATGGTGATGAAGTGTTGTAGAATTAGTTTTTAATGAAGGTTGAGAAGTTACAGAAATAGGTTTAGTGTTTAAATTATCGACGTGATGTCGCGAAAACATGCTTTTAGCACGAGTCACTGATGATGTTCTTGAATGTGCACTTGTTGCACGATGTGAAGACACGGAAACGGTTTGTTGTCTCTGCCGCACACTAGGTGTTTGTGTAACATCATCAGTGTGTTTAAGAGTATTATTATTATTATTAGTTACATCATTAGGAGCGAGATCAGACGTTG]

[-] EMBL CD194429             [AAGTATAAAAAAATAAAAAAAAAAACGAGAAAAAATTTGCTTATTGGCTGATATGATAAACAAGTCACAAACAGGCTATATGATAAAGGACATGTATCGTTTAATTTATTTTATTGGAGCCACTATGTTGACGAGATCTTAGTCCTCGAAACAATCGTGGACTAGGTACTGAATTAAACACGTTTGCTTTATACATATCAGGAGTTTCGTTATGGTGATGAAGTGTTGTAGAATTAGTTTTTAATGAAGGTTGAGAAGTTACAGAAATAGGTTTAGTGTTTAAATTATCGACGTGATGTCGCGAAAACATGCTTTT                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD082874             [                                     TGCTTATTGGCTGATATGATAAACAAGTCACAAACAGGCTATATGATAAAGGACATGTATCGTTTAATTTATTTTATTGGAGCCACTATGTTGACGAGATCTTAGCCCTCGAAACAATCGTGGACTAGGTACTGAATTAAACACGTTTGCTTTATACATATCAGGAGTTTCGTTATGGTGATGAAGTGTTGTAGAATTAGTTTTTAATGAAGGTTGAGAAGTTACAGAAATAGGTTTAGTGTTTAAATTATCGACGTGATGTCGCGAAAACATGCTTTTAGCACG                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD076461             [                                                 GATATGATAAACAAGTCACAAACAGGCTATATGATAAAGGACATGTATCGTTAAATTTATTTTATTGGACCCACTATGTTGACAAAATCTTACCCCTCAAAACAATCGGGGACTAGGTACTGAATTAAACACGTTg                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD154591             [                                                                                                      AATTTATTTTATTGGAGCCACTATGTTGACGAGATCTTAGTCCTCGAAACAATCGTGGACTAGGTACTGAATTAAACACGTTTGCTTTATACATATCAGGAGTTTCGTTATGGTGATGAAGTGTTGTAAAATTAGTTTTTAATGAAGGTTGAGAAGTTACAGAAATAGGTTTAGTGTTTAAATTATCGACGTGATGTCGCGAAAACATGCTTTTAGCACGAGTCACTGATGATGTTCTTGAATGTGCACTTGTTGCACGATGTGAAGACACGGAAACGGTTTGTTGTCTCTGCCGCACACTAGGTGTTTGTGTAACATCATCAGTGTGTTTAAGAGTATTATTATTATTATTAGTTACATCATTAGGAGCGAGATCAGACGTTG]




>consensus_6820#0
AAGTATAAAAAAATAAAAAAAAAAACGAGAAAAAATTTGCTTATTGGCTGATATGATAAA
CAAGTCACAAACAGGCTATATGATAAAGGACATGTATCGTTTAATTTATTTTATTGGAGC
CACTATGTTGACGAGATCTTAGTCCTCGAAACAATCGTGGACTAGGTACTGAATTAAACA
CGTTTGCTTTATACATATCAGGAGTTTCGTTATGGTGATGAAGTGTTGTAGAATTAGTTT
TTAATGAAGGTTGAGAAGTTACAGAAATAGGTTTAGTGTTTAAATTATCGACGTGATGTC
GCGAAAACATGCTTTTAGCACGAGTCACTGATGATGTTCTTGAATGTGCACTTGTTGCAC
GATGTGAAGACACGGAAACGGTTTGTTGTCTCTGCCGCACACTAGGTGTTTGTGTAACAT
CATCAGTGTGTTTAAGAGTATTATTATTATTATTAGTTACATCATTAGGAGCGAGATCAG
ACGTTG

clustalw multiple alignements is not computed in this case