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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7194#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 632 fasta sequence
[TCCTCTACCACTAGACCTATCAGCAGACGTACATTAGGATCAAGTATGCTGTTCAATTCCGTCACTTCTCAGAGTCCTTTGTTAACAAATCGAACTTCTAATTTAATGAATTCACAACCTGCACTATTACCTACACCACAACAATCTACGCCGTCTGTCGGAACAGTTGCAACGATACAGCTGGAGGTCCCACGACCCCCTGCAATAATTCGGTGTGATAACGAACCCAATCGTGTCACTGTCGGGTTGTTAGATTTACAACCACGTTATGAATACGTAACTGTGCCAAAGCGTTCTTTGTATGCTTATTTGAAAGCGACAGCCGTGAACAATACGGAATTTTCTATCTTGGCTGGTCCAACTAACATATATGCC-GATAATACTTTCATTGGCAAATCTGAAATACGTGCTGTCGCTCCAGGAGAAGAGTTTAATTGTCATTTAGGCGCTGAGAATGGTATAAAAATACTGTATCGCCCATTATTCAAATATCGTGAAGGTACCGGTTCGAGTGGGAAAAATGCTACAATGACATTTAAACAATTAATTGAAGTACGTAATACATTTGATCGTCGTGTACGTCTAATG-GTTG-TGATCAAGTTCCGGTCAGTGCAGAGGATAAAATTAAAGTT]
[+] EMBL CD193075 [TCCTCTACCACTAGACCTATCAGCAGACGTACATTAGGATCAAGTATGCTGTTCAATTCCGTCACTTCTCAGAGTCCTTTGTTAACAAATCGAACTTCTAATTTAATGAATTCACAACCTGCACTATTACCTACACCACAACAATCTACGCCGTCTGTCGGAACAGTTGCAACGATACAGCTGGAGGTCCCACGACCCCCTGCAATAATTCGGTGTGATAACGAACCCAATCGTGTCACTGTCGGGTTGTTAGATTTACAACCACGTTATGAATACGTAACTGTGCCAAAGCGTTCTTTGTATGCTTATTTGAAAGCGACAGCCGTGAACAATACGGAATTTTCTATCTTGGCTGGTCCAACTAACATATATGCC GATAATACTTTCATTGGCAAATCTGAAATACGTGCTGTCGCTCCAGGAGAAGAGTTTAATTGTCATTTATGCGCTGAGAATGGTATAAAAATACTGTATCGCCCATTATTCAAATATCGTGAAGGTACCGGTTCGAGTGGGAAAAATGCTACAATGACATGTAAACAATTAATTGAAGTACGTAATACATTTGATCGTCGTGTACGTCTAATGNGTTG TGATCA ]
[+] EMBL CD158655 [ TTGTTAGATTTACAACCACGTTATGAATACGTAACTGTGCCAAAGCGTTCTTTGTATGCTTATTTGAAAGCGACAGCCGTGAACAATACGGAATTTTCTATCTTGGCTGGTCCAACTAACATATATGCC GATAATACTTTCATTGGCAAATCTGAAATACGTGCTGTCGCTCCAGGAGAAGAGTTTAATTGTCATTTAGGCGCTGAGAATGGTATAAAAATACTGTATCGCCCATTATTCAAATATCGTGAAGGTACCGGTTCGAGTGGGAAAAATGCTACAATGACATTTAAACAATTAATTGAAGTACGTAATACATTTGATCGTCGTGTACGTCTAATG GTTGCTGATCAAGTTCCGGTCAGTGCAGAGGATAAAATTAAAGTT]
[+] EMBL CD086601 [ CAATACAGAATTTTCTATCTTGGCTGGTCCAACTAACATATATGCC GATAATACTTTCATTGGCAAATCTGAAATACGTGCTGTCGCTCCAGGAGAAGAGTTTAATTGTCATTTAGGCGCTGAGAATGGTATAAAAATACTGTATCGCCCATTATGCAAATATCGTGAAGGTACCGGTTCGAGTGGGAAAAATGCTACAATGACATTTAAACAATTAATTGAAGTACGTAATACATTTGATCGTCGTGTACGTCTAATG GCTG Ttga ]
[-] EMBL CD086592 [ ATACGGAATTTTCTATCTTGGCTGGTCCAACTAACATATA GCCGGATAATACTTTCATTGGCAAATCTGAAATACGTGCTGTCGCTCCAGGAGAAGAGTTTAATTGTCATTTAGGCGCTGAGAATGGTATAAAAATACTGTATCGCCCATTATTCAAATATCGTGAAGGTACCGGTTCGAGTGGGAAAAATGCTACAATGACATTTAAACAATTAATTGAAGTACGTAATACATTTGATCGTCGTGTACGTCTAATG GTTGTTGAT ]
[+] EMBL CD197420 [ GGCAAATCTGAAATACGTGCTGTCGCTCCAGGAGAAGAGTTTAATTGTCATTTAGGCGCTGAGAATGGTATAAAAATACTGTATCGCCCATTATTCAAATATCGTGAAGGTACCGGTTCGAGTGGGAAAAATGCTACAATGACATTTAAACAATTAATTGAAGTACGTAATACATTTGATCGTCGTGTACGTCTAATG GTTGTTGATCAAGTTCCAGTCAGTGCAGAGGA ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||