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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7308#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 856 fasta sequence
[TTAAACCATGCAAAAGTCGAAAATAACTAATCGATTATGTAGACTACCTGGTCGTTTAGATGGGAAATTAGTGATTGTAACTGGAGCAAATATTGGTTGTGGACTTGAATTAAGCGGTGAATTAGCACGTCGTGGATGTATTGTAATTATGGCTTGTCGAGATTTAGAAAAAGGATTTTTAGGAAAAGAAATACTACTTGATCGATTTGGTGATCGTAGTCAAGAGAAATGGAGAAAATCACCAGCTGGTTCTGGAGTTGAACCATTTCTTGAAGTTGTTAAAACATCACAGTTAATTGTTGAACATTTGGATTTAGCTTGTTTAGAGTCAATTCGTCATTTTGCTAAAAAGATTCAACATCAATATACACGATTAGATATATTAATACATAATGCTGGTATGATGGCTACTAGTTATATGGAAACACATGATGGATT-TGAATTACAAATGGGCGTCAATCATTTAGGTCCTGTATTATTAACTGAATTATTATTACCATTATTATATAATGGTGCACCATCACGTGTGATTGTTATTGCATCGAATCTTTATCAACAAGGTGATATTGATGTGAATAATTTAAATTTACGCGGTGAACAATATGGACCATTTAAAGCATATAATCAATCAAAATTAGCTAATGTATTATATGTACGTGAATTAGCTAAACATTTAGATGGTTTAAAAGTGATACCAATGGCTGTACATCCTGGTGCAGTACGAACAGAAATATCAAATACAGGAGATCATCGATATCAGTTATTTCTACGTGCTGTTGGTATAAGTCCATGGGAAGGTGCACGAACTGCATTATATTGCACATTAATTAATGATCCAGTACCTGGTGGTTATTAT]
[+] EMBL CD078419 [TTAAACCATGCAAAAGTCGAAAATAACTAATCGATTATGTAGACTACCTGGTCGTTTAGATGGGAAATTAGTGATTGTAACTGGAGCAAATATTGGTTGTGGACTTGAATTAAGCGGTGAATTAGCACGTCGTGGATGTATTGTAATTATGGCTTGTCGAGATTTAGAAAAAGGATTTTTAGGAAAAGAAATACTACTTGATCGATTTGGTGATCGTAGTCAAGAGAAATGGAGAAAATCACCAGCTGGTTCTGGAGTTGAACCATTTCTTGAAGTTGTTAAAACATCACAGTTAATTGTTGAACATTTGGATTTAGCTTGTTTAGAGTCAATTCGTCATTTTGCTAAAAAGATTCAACATCAATATACACGATTAGATATATTAATACATAATGCTGGTATGATGGCTACTAGTTATATGGAAACACATGATGGATT TGAATTACAAATGGGCGTCAATCATTTAGGTCCTGTATTATTAACTGAATTATTATTACCATTATTATATAATGGTGCACCATCACGTGTGATTGTTATTGCATCGAATCTTTATCAACAAGGTGATATTGATGTGAATAATTTA ]
[-] EMBL BG931963 [ TCGTAGTCAAGAGAAATGGAGAAAATCACCAGCTGGTTCTGGAGTTGAACCATTTCTTGAAGTTGTTAAAACATCACAGTTAATTGTTGAACATTTGGATTTAGCTTGTTTAGAGTCAATTCGTCATTTTGCTAAAAAGATTCAACATCAATATACACGATTAGATATATTAATACATAATGCTGGTATGATGGCTACTAGTTATATGGAAACACATGATGGATT TGAATTACAAATGGGCGTCAATCATTTAGGTCCTGTATTATTAACTGAATTATTATTACCATTATTATATAATGGTGCACCATCACGTGTGATTGTTATTGCATCGAATCTTTATCAACAAGGTGATATTGATGTGAATAATTTAAATTTACGCGGTGAACAATATGGACCATTTAgac ]
[+] EMBL CD069069 [ TATGGAAACACATGATGGATT TGAATTACAAATGGGCGTCAATCATTTAGGTCCTGTATTATTAACTGAATTATTATTACCATTATTATATAATGGTGCACCATCACGTGTGATTGTTATTGCATCGAATCTTTATCAACAAGGTGATATTGATGTGAATAATTTAAATTTACGCGGTGAACAATATGGACCATTTAAAGCATATAATCAATCAAAATTAGCTAATGTATTATATGTACGTGAATTAGCTAAACATTTAGATGGTTTAAAAGTGATACCAATGGCTGTACATCCTGGTGCAGTACGAACAGAAATATCAAATACAGGAGATCATCGATATCAGTTATTTCTACGTGCTGT ]
[+] EMBL CD069104 [ GATGGATTCCGAATTACACATGGGCGTCAATCATTTAGGTCCTGTATTATTAACTGAATTATTATTACCATTATTATATAATGGTGCACCATCACGTGTGATTGTTATTGCATCGAATCTTTATCAACAAGGTGATATTGATGTGAATAATTTAAATTTACGCGGTGAACAATATGGACCATTTAAAGCATATAATCAATCAAAATTAGCTAATGTATTATATGTACGTGAATTAGCTAAACATTTAGATGGTTTAAAAGTGATACCAATGGCTGTACATCCTGGTGCAGTACGAACAGAAATATCAAATACAGGAGATCATCGATATCAGTTATTTCTACGTGCTGTTGGTATAAGTCCATGGGAAGGTGCACGAACTGCATTATATTGCACATTAATTAATGATCCAGTACCTGGTGGTTATTAT]
[+] EMBL CD061255 [ GTGATTGTTATTGCATCGAATCTTTATCAACAAGGTGATATTGATGTGAATAATTTAAATTTACGCGGTGAACAATATGGACCATTTAAAGCATATAATCAATCAAAATTAGCTAATGTATTATATGTACGTGAATTAGCTAAACATTTAGATGGTTTAAAAGTGATACCAATGGCTGTACATCCTGGTGCAGTACGAACAGAAATATCAAATACAGGAGATCATCGATATCAGTTATTTCTACGTGCTGTTGGTATAAGTCCATGGGAAGGTGCACAAAC ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||