cluster # 7349

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 7349 cluster # 7349 Sequences # 5 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7349#0 length = 750 sequences # 5
consensusID : consensus_7349#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 750
fasta sequence
                              [AGTCAGTTGTCGGTCGCTGATGAAGATGAGGATGAAGAAGCTATTAAAGAATCACTTATGAACAGTCTTCCCGATATATTTATGAATAAAAACTTCTTTATTCATAACAAATCAATTCCTGATGATGAAGAATCTTTAATTAAACGATTAATTGTTGCGTTTGGTGGAACACTGCATCAGTACATGAGTAATGAAGTCCAATACGTTATAACAAGGTCCGCTTGGGATGTCGAGTTTGATAATGCACTGTCATCTAATACTGATTTGATATTTATTCGACCAGAATGGATATTTGCTTGTGATCGATCTGGTCAATTGGAAGCATACGAACAATATCAAGTGACAATGAACAGTTAATTGATAGTTAATTCGATAAGAAGTTAACAATTCATGAAGGCGCAAATATTAAAATAGAAATGGAGAGGACAAGAATATATATATATGTATGTATCGTCGTCCACTAACTATTTCTTTCCTCTTATTGATGATAACTATAAAGAGAGAATAAATGGTTCTGTTTAACCATTCTCTTTATTTCCTTTGAGATTCATTCTTCTGTTTGATACTTCCTTGTTGTATTTCATTACATCGTTCACTGTTCAATATGTATGTATATTATTAACATCTTGTTATTTTTCATTTGGTTGTTCTTTTCTTTATTGAACGAATTCATTTTATGCTTAATGGTACTANGA-TACTTCTGTCATTGNCATTATNATCATCATTATTGGTATCATTAGAAATAAACGT]

[+] EMBL CD192000             [  TCAGTTGTCGGTCGCTGATGAAGATGAGGATGAAGAAGCTATTAAAGAATCACTTATGAACAGTCTTCCCGATATATTTATGAATAAAAACTTCTTTATTCATAACAAATCAATTCCTGATGATGAAGAATCTTTAATTAAACGATTAATTGTTGCGTTTGGTGGAACACTGCATCAGTACATGAGTAATGAAGTCCAATACGTTATAACAAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD192011             [  TCAGTTGTCGGTCGCTGATGAAGATGAGGATGAAGAAGCTATTAAAGAATCACTTATGAACAGTCTTCCCGATATATTTATGAATAAAAACTTCTTTATTCATAACAAATCAATTCCTGATGATGAAGAATCTTTAATTAAACGATTAATTGTTGCGTTTGGTGGAACACTGCATCAGTACATGAGTAATGAAGTCCAATACGTTATAACAAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD082136             [aggacGTTGTCGGTCGCTGATGAAGATGAGGATGAATAAGCTATTAAAGAATCACTTATGAACAGTCTTCCCGATATATTTATGAATAAAAACTTCTTTATTCATAACAAATCAATTCCTGATGATGAAGAATCTTTAATTAAACGATTAATTGTTGCGTTTGGTGGAACACTGCATCAGTACATGAGTAATGAAGTCCAATACGTTATAACAAGGTCCGCTTGGGATGTCGAGTTTGATAATGCACTGTCATCTAATACTGATTTGATATTTATTCGACCAGAATGGATATTTGCTTGTGATCGATCTGGTCAATTGGAAGCATACGAACAATATCAAGTGACAATGAACAGTTAATTGATAGTTAATTCGATAAGAAGTTAACAATTCATGAAGGCGCAAATATTAAAATAGAAATGGAGAGGACAAGAATATATATATATGTATGTATCGTCGTCCACTAACTATTTCTTTCCTCTTATTGATGATAACTATAAAGAGAGAATAAATGGTTCTGTTTAACCATTCTCTTTATTTCCTTTGAGATTCATTCTTCTGTTTGATACTTCCTTGTTGTATTTCATTACATCGTTCACTGTTCAATATGTATGTATATTATTAACATCTTGTTATTTTTCATTTGGTTGTTCTTTTCTTTATTGAACGAATTCATTTTATGCTTAATGGTACTANGA TACTTCTGTCATTGNCATTATNATCATCATTATTGGTATCATTAGAAATAAACGT]
[-] EMBL CD074199             [                                 GAAGAAGCTATTAAAGAATCACTTATGAACAGTCTTCCCGATATATTTATGAATAAAAACTTCTTTATTCATAACAAATCAATTCCTGATGATGAAGAATCTTTAATTAAACGATTAATTGTTGCGTTT    GAACACTGCATCAGTACATGAGTAATGAAGTCCAATACGTTATAACAAGGTCCGCTTGGGATGTCGAGTTTGATAATGCACTGTCATCTAATACTGATTTGATATTTATTCGACCAGAATGGATATTTGCTTGTGATCGATCTGGTCAATTGGAAGCATACGAACAATATCAAGTGACAATGAACAGTTAATTGATAGTTAATTCGATAAGAAGTTAACAATTCATGAAGGCGCAAATATTAAAATAGAAATGGAGAGGACAAGAATATATATATATGTATGTATCGTCGTCCACTAACTATTTCTTTCCTCTTATTGATGATAACTATAAAGAGAGAATAAATGGTTCTGTTTAACCATTCTCTTTATTTCCTTTGAGATTCATTCTTCTGTTTGATACTTCCTTGTTGTATTTCATTACATCGTTCACTGGGCAATATGTATGTATATAAATAACATCTTGTTAT                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD075751             [                                                                                                                                                                                                                                                            TCTAATACTGATTTGATATTTATTCGACCAGAATGGATATTTGCTTGTGATCGATCTGGTCAATTGGAAGCATACGACCAATATCAAGTGCCAATGACCAGTTAATTGATAGTTAATTCGATAAGAAGTTAACAATTCATGAAGGCGCAAATATTAAAATAGAAATGGAGAGGCCAAGAATATATATATATGTATGGATCGTCGTCCCCTAACTATTTCTTTCCTCTTATTGATGATAACTATAAAGAGAGAATAAATGGTTCTGTTTAACCATTCTCTTTATTTCCTTTGAGATTCATTCTTCTGTTTGATACTTCCTTGTTGTATTTCATTACATCGTTCACTGTTCAATATGTATGTATATTATTAACATCTTGTTATTTTTCATTTGTTTGTTCTTTTCTTTATTGAACGAATTCATTTTATGCTTAATGGTACTA GATTACTTCTGTCATTGTCATTATAATCATCATTATTGTTATCATTAGAATAAAACGT]




>consensus_7349#0
AGTCAGTTGTCGGTCGCTGATGAAGATGAGGATGAAGAAGCTATTAAAGAATCACTTATG
AACAGTCTTCCCGATATATTTATGAATAAAAACTTCTTTATTCATAACAAATCAATTCCT
GATGATGAAGAATCTTTAATTAAACGATTAATTGTTGCGTTTGGTGGAACACTGCATCAG
TACATGAGTAATGAAGTCCAATACGTTATAACAAGGTCCGCTTGGGATGTCGAGTTTGAT
AATGCACTGTCATCTAATACTGATTTGATATTTATTCGACCAGAATGGATATTTGCTTGT
GATCGATCTGGTCAATTGGAAGCATACGAACAATATCAAGTGACAATGAACAGTTAATTG
ATAGTTAATTCGATAAGAAGTTAACAATTCATGAAGGCGCAAATATTAAAATAGAAATGG
AGAGGACAAGAATATATATATATGTATGTATCGTCGTCCACTAACTATTTCTTTCCTCTT
ATTGATGATAACTATAAAGAGAGAATAAATGGTTCTGTTTAACCATTCTCTTTATTTCCT
TTGAGATTCATTCTTCTGTTTGATACTTCCTTGTTGTATTTCATTACATCGTTCACTGTT
CAATATGTATGTATATTATTAACATCTTGTTATTTTTCATTTGGTTGTTCTTTTCTTTAT
TGAACGAATTCATTTTATGCTTAATGGTACTANGATACTTCTGTCATTGNCATTATNATC
ATCATTATTGGTATCATTAGAAATAAACGT
clustalw multiple alignements is not computed in this case