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Schistosoma mansoni
cluster # 7378 cluster # 7378       Sequences # 5       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7378#0 length = 1079 sequences # 5  
consensusID : consensus_7378#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 1079
fasta sequence 
                              [GGATGGAAAAATGATATAAATATGGGGTTTTTAGTTTTCTTTTACAACCCGGGTTCGTACTAAAAAACATGCCGCTTTAGTTGAATAATTATAAGTAAATAGGCGATTCTATCATCAGGGGAACTTAACTTATAAATATAAAATATTGGAATGATAATAATGATAAGCTGATTCACAACTTATAAAGTTAACTGCTGAATAAATAAGTCAAAAGCTAGTCATCAAATTAATCGATTTCTGCGTTCAGTTTCGGAAACTATTCTGTTTCGGTTTTTGGACGAGGGGGTAACGGAGGCGGTTTTTGTCTTGAGGGCGTTTGTGGGGCGACCCGTGTTGGAAAAATGGGATCAACATTTATAAGTGCGGCATCCTTGGCATGGGTCATAGTTGTAGATGAATCACTTTGTGAAGAATACACAAGAGTAAAGGGATCATCAGTTGATAAATGTGATGATCTAACATCTTCTGGTCTTTGAGGTAACGGAG-GTGGAACAATGACTGAATCAAACCAATGAGTAGATGATGATGTTGTATCATTATTGATAGTGGAGTTATTTTCAAAGTCAAGTCCAATAAGATCAATTGTGGATGATATACGATTTTTATTATTGTTATCTTGTTGTAAAATTGAATTATCCTGAAAGTTAAGATCTACACAACTGTTAACCATATGAATACTATCATTATAGGGTGTAAATAAATCATTTGAAATTGCAGTATTCAATTTTGATGAAACTTCATGAACAGGTGAATTAGTTTGAGAATGTGAAATAGAAAATA-TTTTTTAAATTTCGAATCAATTTCATTATCAGCTTGGGATAAAGGATCGGAGATATTTGTTTTCTTTGTATTAATTGAATTATTATTATTAGTTGGATAATCGTCAAATTCATCTTTACTATTATTATTACCACTACCAATACTCACTGATTGTTTAATTAATGGTGGAGCT-GGTCTAGGAGGCGGTGGACGATTACGAGGTTGTGATGGTTCAACAGCCCGGTTGATGTTTAAGTTAGTAATATCATTTTCGAAATCTTCATTATCACTATTTAAAGTTTGTTCATTGTTGTCATCAA]

[+] EMBL CD075040             [GGATGGAAAAATGATATAAATATGGGGTTTTTAGTTTTCTTTTACAACCCGGGTTCGTACTAAAAAACATGCCGCTTTAGTTGAATAATTATAAGTAAATAGGCGATTCTATCATCAGGGGAACTTAACTTATAAATATAAAATATTGGAATGATAATAATGATAAGCTGATTCACAACTTATAAAGTTAACTGCTGAATAAATAAGTCAAAAGCTAGTCATCAAATTAATCGATTTCTGCGTTCAGTTTCGGAAACTATTCTGTTTCGGTTTTTGGACGAGGGGGTAACGGAGGCGGTTTTTGTCTTGAGGGCGTTTGTGGGGCGACCCGTGTTGGAAAAATGGGATCAACATTTATAAGTGCGGCATCCTTGGCATGGGTCATAGTTGGAAATGAATCACTTTGTGAAGAATACACAAGAGTAAAGGGATCCTCAGTTGATAAATGGGATGATCTAACATCTTCTGGTCTTTGAGGGAACGGAG GGGGAACAATGACTGAATCAAACCAATGAGTAGATGATGATGTTGTATCATTAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD153174             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         GATCAACATTTATAAGTGCGGCATCCTTGTCATGGTTCATAGTTGTAGATGAATCACTTTGTGAAGAATACACAAGAGTAAAGGGATCATCAGTTGATAAATGTGATGATCTAACATCTTCTGGTCTTTGAGGTAACGGAG GTGGAACAATGACTGAATCAAACCAATGAGTAGATGATGATGTTGTATCATTATTGATAGTGGAGTTATTTTCAAAGTCAAGTCCAATAAGATCAATTGTGGATGATATACGATTTTTATTATTGTTATCTTGTTGTAAAATTGAATTATCCTGAAAGTTAAGATCTACACAACTGTTAACCATATGAATACTATCATTATAGGGTGTAAATAAATCATTTGAAATTGCAGTATTCAATTTTGATGAAACTTCATGAACAGGTGAATTAGTTTGAGAATGTGAAATAGAAAATA TTTTTTAAATTTCGAATCAATTTCATTATCAGCTTGGGATAAAGGATCGGAGATATTTGNTTTCTTTGTATTAATTGAATTATTATTATTAGTTGGATAATCGNCANATTCATCTTTACTATTATTATTACCACTACCANTACTCACTGATTGGTTAATTAATGGNNGAGCTNGGTCTAGGAGGCGTGGGACGATTACGAGGnt                                                                                                ]
[-] EMBL CD096747             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CATAGTTGTAGATGAATCACTTTGTGAAGAATACACAAGAGTAAAGGGATCATCAGTTGATAAATGTGATGATCTAACATCTTCTGGTCTTTGAGGTAACGGAG GTGGAACAATGACTGAATCAAACCAATGAGTAGATGATGATGTTGTATCATTATTGATAGTGGAGTTATTTTCAAAGTCAAGTCCAATAAGATCAATTGTGGATGATATACGATTTTTATTATTGTTATCTTGTTGTAAAATTGAATTATCCTGAAAGTTAAGATCTACACAACTGCTAACCATATGAATACTATCATTATAGGGTGTAAATAAATCATTTGAAATTGCAGTATTCAATTTTGATaa                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD153480             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AACGGAGNGTGGAACAATGACTGAATCAAACCAATGAGTAGATGATGATGTTGGGTCATTATTGATAGTGGAGTTATTTTCAAAGTCAAGTCCAATAAGATCAATTGTGGATGATATACGATTTTTATTATTGTTATCTTGTTGTAAAATTGAATTATCCTGAAAGTTAAGATCTACACAACTGTTAACCATATGAATACTATCATTATAGGGTGTAAATAAATCATTTGAAATTGCAGTATTCAATTTTGATGAAACTTCATGAACAGGTGAATTAGTTTGAGAATGTGAAATAGAAAATATTTTTTTAAATTTCGAATCAATTTCATTATCAGCTTGGGATAAAGGATCGGAGATATTTGTTTTCTTTGTATTAATTGAATTATTATTATTAGTTGGATAATCGTCAAATTCATCTTTACTATTATTATTACCACTACCAATACTCACTGATTGTTTAATTAATGGTGGAGCT GGTCTAGGAGGCGGTGGACGATTACGAGGTT                                                                                                ]
[-] EMBL AW017063             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TTCAATTTTGATGAAACTTCATGAACAGGTGAATTAGTTTGAGAATGTGAAATAGAAAATATTTTTTTAAATTTCGAATCAATTTCATTATCAGCTTGGGATAAAGGATCGGAGATATTTGTTTTCTTTGTATTAATTGAATTATTATTATTAGTTGGATAATCGTCAAATTCATCTTTACTATTATTATTACCACTACCAATACTCACTGATTGTTTAATTAATGGTGGAGCT GGTCTAGGAGGCGGTGGACGATTACGAGGTTGTGATGGTTCAACAGCCCGGTTGATGTTTAAGTTAGTAATATCATTTTCGAAATCTTCATTATCACTATTTAAAGTTTGTTCATTGTTGTCATCAA]




>consensus_7378#0
GGATGGAAAAATGATATAAATATGGGGTTTTTAGTTTTCTTTTACAACCCGGGTTCGTAC
TAAAAAACATGCCGCTTTAGTTGAATAATTATAAGTAAATAGGCGATTCTATCATCAGGG
GAACTTAACTTATAAATATAAAATATTGGAATGATAATAATGATAAGCTGATTCACAACT
TATAAAGTTAACTGCTGAATAAATAAGTCAAAAGCTAGTCATCAAATTAATCGATTTCTG
CGTTCAGTTTCGGAAACTATTCTGTTTCGGTTTTTGGACGAGGGGGTAACGGAGGCGGTT
TTTGTCTTGAGGGCGTTTGTGGGGCGACCCGTGTTGGAAAAATGGGATCAACATTTATAA
GTGCGGCATCCTTGGCATGGGTCATAGTTGTAGATGAATCACTTTGTGAAGAATACACAA
GAGTAAAGGGATCATCAGTTGATAAATGTGATGATCTAACATCTTCTGGTCTTTGAGGTA
ACGGAGGTGGAACAATGACTGAATCAAACCAATGAGTAGATGATGATGTTGTATCATTAT
TGATAGTGGAGTTATTTTCAAAGTCAAGTCCAATAAGATCAATTGTGGATGATATACGAT
TTTTATTATTGTTATCTTGTTGTAAAATTGAATTATCCTGAAAGTTAAGATCTACACAAC
TGTTAACCATATGAATACTATCATTATAGGGTGTAAATAAATCATTTGAAATTGCAGTAT
TCAATTTTGATGAAACTTCATGAACAGGTGAATTAGTTTGAGAATGTGAAATAGAAAATA
TTTTTTAAATTTCGAATCAATTTCATTATCAGCTTGGGATAAAGGATCGGAGATATTTGT
TTTCTTTGTATTAATTGAATTATTATTATTAGTTGGATAATCGTCAAATTCATCTTTACT
ATTATTATTACCACTACCAATACTCACTGATTGTTTAATTAATGGTGGAGCTGGTCTAGG
AGGCGGTGGACGATTACGAGGTTGTGATGGTTCAACAGCCCGGTTGATGTTTAAGTTAGT
AATATCATTTTCGAAATCTTCATTATCACTATTTAAAGTTTGTTCATTGTTGTCATCAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)