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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7382#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 747 fasta sequence
[TACTATACACGATATTACTATACGACATCACGGAGTATGGGCTACATCACTAACAAACCACTGGACTTTACGCGACTATCCTAACACACTGGGCGCGTCTGGGATCTAACAGAATAATTACACTGGCCTTTCGACGAGTTTTATAAAAAACTACCGGAGGCAGGTCTTTACCGCTTATAAACCTAGGGGCTATTAACTATAATCCTGCCAAACAGATATACTACCCACTAACATATGGATCACACATCGGTCATCAACCAACTAAAGTATAAGAAATTTATTATCACGTCACACTAACGAAACAAAACACTTACAGTGTAAACGCTTTTCTCACTATATCCTCAGTAGTACTAATTAGTAATGTAATGTCAAACAACACTCGCAATAATATCAAATTTATCCACACACATTAGCTACATATATATAGATATATAAATATACATACAAATACAAATACAAATACAAATATATACTTCACTCACATCAAACCTACCTAATCATGTACAGTTAATTTCATTAACCAAGAAATGTGTCCATCCGCAACTACTACTTCTACTACTACTACTCATTGACTTTTGAAACAACTTCTGAATTGACTAGTAGTGAGCAAGAAGTTTTGTGAGAGGTTGAGAGTTGTTTAGTTTTGTTTTTTGGGGTGAATTTCTTACTGGCATTGTAATTATAGTTTTGTAAATCAACTGGTCAGTACTATTATTTTCGATGAAAAAAAGATTTGCTAATTTTAAT]
[+] EMBL CD067560 [TACTATACACGATATTACTATACGACATCACGGAGTATGGGCTACATCACTAACAAACCACTGGACTTTACGCGACTATCCTAACACACTGGGCGCGTCTGGGATCTAACAGAATAATTACACTGGCCTTTCGACGAGTTTTATAAAAAACTACCGGAGGCAGGTCTTTACCGCTTATAAACCTAGGGGCTATTAACTATAATCCTGCCAAACAGATATACTACCCACTAACATATGGATCACACATCGGTCATCAACCAACTAAAGTATAAGAAATTTATTATCACGTCACACTAACAAAACAAAACACTTACAGTGTAAACGCTTTTCTCACTATATACTGAGTAGTACTAATTAGTAATGTAATGTCAAACAACACTCGCAATAATATCAAATTTATCCACGCACATTATCTACATATATATAGATATATAAATATACATACAAATACAAATACAAATACAAATATATACTTCACTCACATCAAACCTACCTAATCATGTACAGTTAATTTCA ]
[-] EMBL CD153509 [ ATCACGTCACACTAACGAAACAAAACACTTACAGTGTAAACGCTTTTCTCACTATATCCTCAGTAGTACTAATTAGTAATGTAATGTCAAACAACACTCGCAATAATATCAAATTTATCCACACACATTAGCTACATATATATAGATATATAAATATACATACAAATACAAATACAAATACAAATATATACTTCACTCACATCAAACCTACCTAATCATGTACAGTTAATTTCATTAACCAAGAAATGTGTCCATCCGCAACTACTACTTCTACTACTACTACTCATTGACTTTTGAAACAACTTCTGAATTGACTAGTAGTGAGCAAGAAGTTTTGTGAGAGGTTGAGAGTTGTTTAGTTTTGTTTTTTGGGGTGAATTTCTTACTGGCATTGTAATTATAGTTTTGTAAATCAACTGGTCAGTACTATTATTTTCGATGAAAAAAAGATTTGCTAATTTTAAT]
[-] EMBL CD153546 [ GTCACACTAACGAAACTAGACACTTACAGTGTAAACGCTTTTCTCACTATATCCTCAGTAGTACTAATTAGTAATGTAATGTCAAACAACACTCGCAATAATATCAAATTTATCCACACACATTAGCTACATATATATAGATATATAAATATACATACAAATACAAATACAAATACAAATATATACTTCACTCACATCAAACCTACCTAATCATGTACAGTTAATTTCATTAACCAAGAAATGTGTCCATCCGCAACTACTACTTCTACTACTACTACTCATTGACTTTTGAAACAACTTCTGAATTGACTAGTAGTGAGCAAGAAGTTTTGTGAGAGGTTGAGAGTTGTTTAGTTTTGTTTTTTGGGGTGAATTTCTTACTGGCATTGTAATTATAGTTTTGTAAATCAACTGGTCAGTACTATTATTTTCGATGAAAAAAAGATTTGCTAATTTTAAT]
[-] EMBL CD153539 [ CACACTAACGAAACAAGACACTTACAGTGTAAACGCTTTTCTCACTATATCCTCAGTAGTACTAATTAGTAATGTAATGTCAAACAACACTCGCAATAATATCAAATTTATCCACACACATTAGCTACATATATATAGATATATAAATATACATACAAATACAAATACAAATACAAATATATACTTCACTCACATCAAACCTACCTAATCATGTACAGTTAATTTCATTAACCAAGAAATGTGTCCATCCGCAACTACTACTTCTACTACTACTACTCATTGACTTTTGAAACAACTTCTGAATCGACTAGTAGTGAGCAAGAAGTTTTGTGAGAGGTTGAGAGTTGTTTAGTTTTGTTTTTTGGGGTGAATTTCTTACTGGCATTGTAATTATAGTTTTGTAAATCAACTGGTCAGTACTATTATTTTCGATGAAAAAAAGATTTGCTAATTTTAAT]
[-] EMBL CD153565 [ ctAAACACTGACAGTGTAAACGCTTTTCTCACTATATCCTCAGTAGTACTAATTAGTAATGTAATGTCAAACAACACTCGCAATAATATCAAATTTATCCACACACATTAGCTACATATATATAGATATATAAATATACATACAAATACAAATACAAATACAAATATATACTTCACTCACATCAAACCTACCTAATCATGTACAGTTAATTTCATTAACCAAGAAATGTGTCCATCCGCAACTACTACTTCTACTACTACTACTCATTGACTTTTGAAACAACTTCTGAATTGACTAGTAGTGAGCAAGAAGTTTTGTGAGAGGTTGAGAGTTGTTTAGTTTTGTTTTTTGGGGTGAATTTCTTACTGGCATTGTAATTATAGTTTTGTAAATCAACTGGTCAGTACTATTATTTTCGATGAAAAAAGGATTTGCTAATTTTAAT]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||