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Schistosoma mansoni
cluster # 7415 cluster # 7415       Sequences # 5       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7415#0 length = 1269 sequences # 5  
consensusID : consensus_7415#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 1269
fasta sequence 
                              [CTCGCAGCCAAGAATTCGGCACGAGGTGTATGTGAATGCGGGTCATGCTTTCATGAAGAAATCCCTGTTAATGTGTTACCTAATAAATTCTTCACTGCTAAACCTGGAAAACTAGTATCTGCCATCAATACGTTAGTCGAAAATATCTGTAAACAAAAAGTTGGCTCCAACAACCCTATCCACTATGCTTCTAACANAATGAGTAAGATGACATCCAGTG-A-TTGAAGACAAGCAGTATTGGTGGAATAACTTATTGTTCGTACAAGGCGAAAAGTCGGAGTCCTTAACACCATGTACGCAAATTCTTCGAGCGTTAATCCGCTTCGAAGACGTCTATGCTAATAGTCNAAAAAACCGTTTGACCGAAATCATTAATATTTGTCGTTCGTGTGATCATAAAAAAAGACCAGACTATAAATCAACTCGTTTAAAATTTTATATTGGATTGAGTTCATACGTCAACAGTATCGATATGTTTTGTTGGTGTCCTGGTTCACGAGATATTGCCTTTGAATATGTTCTAGCTTGGAGTAATCTACTCATAAATGAGACTGGTTCACAAGATATCGGCCGTAGTAATCTGGCTCCAGAATCATTTGGTGTGATTGAGAATTGGGCCGAATATTTATCAACGGGAAAATTAAGTTCAAAATCTTCTAGATTTATTCAAGTAGAACCAGAACCTCCTAGCATCTTTCATGAGCTCGATTCATCTAATGTTTCTGAAAATCCTATACATCTTGCTACAAAAGAGATCGTTATAGCTAAAAATCCCGAAGCAGAAACTACTAATTCTCATAACAATTCTAGGCATAGATCGGTAACTTTAATTATCGATACTGGTGAATCGTGTACTGTAGAAGAAAAATTGATGAATACAAATCCTGAGTTGTACAAATTGAGCAAAGTATGGGAATCTGTTGTTGCTAAACAACTAGAAAATGTGAATAATACAATTGTATACAAAATTGGCGAACCACTTGACTCATTGATCACATCAATTACCAAGTATTGGGGACATANTCGATGTACAATATGTTCAGAAAGTAATTAATATGAAAGTTAATTCAGTTTCCCTTTTTATTATTTATTCAATGTCTAATATTTTTTTAAACCTTCCCCAACCAAAGTTAACTTAAACAATACCAGTGATTATCTGACTGATGTTAAGTATTTTCTTTACTAATCATAAGATTAATGCATAGTTTTGTATTTTGCTATTTTATTTATCAAGGGGAGTTACATTTCTCAAGAAATAAATTTTGTTTT]

[+] EMBL CD078177             [CTCGCAGCCAAGAATTCGGCACGAGGTGTATGTGAATGCGGGTCATGCTTTCATGAAGAAATCCCTGTTAATGTGTTACCTAATAAATTCTTCACTGCTAAACCTGGAAAACTAGTATCTGCCATCAATACGTTAGTCGAAAATATCTGTAAACAAAAAGTTGGCTCCAACAACCCTATCCACTATGCTTCTAACANAATGAGTAAGATGACATCCAGTGCAGTTGAAGACAAGCAGTATTGGTGGAATAACTTATTGTTCGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD123720             [                                                    ATGAAGAAATCCCTGTTAATGTGTTACCTAATAAATTCTTCACTGCTAAACCTGCAGAACTAGTATCTGCCATCAATACGTTAGTCGAAAATATCTGTAAACAAAAAGTTGGCTCCAACAACCCTATCCACTATGCTTCTAACAAAATGAGTAAGATGACGGCCAGTGCAGTTGAAGACAAGCAGTATTGGTGGAATAACTTATTGTTCGTACAAGGCGAAAAGTCGGAGTCCTTAACACCATGTACGCAAATTCTTCGAGCGTTAATCCGCTTCGAAGACGTCTATGCTAATAGTCNAAAAAACCGTTTGACCGAAATCATTAATATTTGTCGTTCGTGTGATCAT AAAAAAGACCACACTAT AATCAACTCaag                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD126252             [                                                                                                                                                                                                                TGACATCCAGTG A TTGAAGACAAGCAGTATTGGTGGAATAACTTATTGTTCGTACAAGGCGAAAAGTCGGAGTCCTTAACACCATTTACGCTTATTCTTCGAGCGTTAATCCGCTTCGAAGACCTCTATGTTAATAGTCGAAGAAACTGTTTGACCGAAATCATTAATATTTGTCGTTCGTGTGATCATAAAAAAAGACCAGACTATAAATCAACTCGTTTAAAATTTTATATTGGATTGAGTTCATACGTCAACAGTATCGATATGTTTTGTTGGTGTCCTGGTTCACGAGATATTGCCTTTGAATATGTTCTAGCTTGGAGTAATCTACTCATAAATGAGACTGGTTCACAAGATATCGGCCGTAGTAATCTGGCTCCAGAATCATTTGGTGTGATTGAGAATTGGGCCGAATATTTATCAACGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD082430             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            gCGAAATCATTAATATTTGTCGTTCGTGTGATCATAAAAAAAGACCAGACTATAAATCAACTCGTTTAAAATTTTATATTGGATTGAGTTCATACGTCAACAGTATCGATATGTTTTGTTGGTGTCCTGGTTCACGAGATATTGCCTTTGAATATGTTCTAGCTTGGAGTAATCTACTCATAAATGAGACTGGTTCACAAGATATCGGCCGTAGTAATCTGGCTCCAGAATCATTTGGTGTGATTGAGAATTGGGCCGAATATTTATCAACGGGAAAATTAAGTTCAAAATCTTCTAGATTTATTCAAGTAGAACCAGAACCTCCTAGCATCTTTCATGAGCTCGATTCATCTAATGTTTCTGAAAATCCTATACATCTTGCTACAAAAGAGATCGTTATAGCTAAAAATCCCGAAGCAGAAACTACTAATTCTCATAACAATTCTAGGCATAGATCGGTAACTTTAATTATCGATACTGGTGAATCGTGTACTGTAGAAGAAAAATTGATGAATACAAATCCTGAGTTGTACAAATTGAGCAAAGTATGGGAATCTGTTGTTGCTAAACAACTAGAAAATGTGAATAATACAATTGTATACAAAATTGGCGAACCACTTGACTCATTGATCACATCAATTACCAAGTATTGGGGACATANTCGATGTA                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CD076029             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CCTATACATCTTGCTACAAAAGAGATCGTTATAGCTAAAAATCCCGAAGCAGAAACTACTAATTCTCATAACAATTCTAGGCATAGATCGGTAACTTTAATTATCGATACTGGTGAATCGTGTACTGTAGAAGAAAAATTGATGAATACAAATCCTGAGTTGTACAAATTGAGCAAAGTATGGGAATCTGTTGTTGCTAAACAACTAGAAAATGTGAATAATACAATTGTATACAAAATTGGCGAACCACTTGACTCATTGATCACATCAATTACCAAGTATTGGGGACATAATCGATGTACAATATGTTCAGAAAGTAATTAATATGAAAGTTAATTCAGTTTCCCTTTTTATTATTTATTCAATGTCTAATATTTTTTTAAACCTTCCCCAACCAAAGTTAACTTAAACAATACCAGTGATTATCTGACTGATGTTAAGTATTTTCTTTACTAATCATAAGATTAATGCATAGTTTTGTATTTTGCTATTTTATTTATCAAGGGGAGTTACATTTCTCAAGAAATAAATTTTGTTTT]




>consensus_7415#0
CTCGCAGCCAAGAATTCGGCACGAGGTGTATGTGAATGCGGGTCATGCTTTCATGAAGAA
ATCCCTGTTAATGTGTTACCTAATAAATTCTTCACTGCTAAACCTGGAAAACTAGTATCT
GCCATCAATACGTTAGTCGAAAATATCTGTAAACAAAAAGTTGGCTCCAACAACCCTATC
CACTATGCTTCTAACANAATGAGTAAGATGACATCCAGTGATTGAAGACAAGCAGTATTG
GTGGAATAACTTATTGTTCGTACAAGGCGAAAAGTCGGAGTCCTTAACACCATGTACGCA
AATTCTTCGAGCGTTAATCCGCTTCGAAGACGTCTATGCTAATAGTCNAAAAAACCGTTT
GACCGAAATCATTAATATTTGTCGTTCGTGTGATCATAAAAAAAGACCAGACTATAAATC
AACTCGTTTAAAATTTTATATTGGATTGAGTTCATACGTCAACAGTATCGATATGTTTTG
TTGGTGTCCTGGTTCACGAGATATTGCCTTTGAATATGTTCTAGCTTGGAGTAATCTACT
CATAAATGAGACTGGTTCACAAGATATCGGCCGTAGTAATCTGGCTCCAGAATCATTTGG
TGTGATTGAGAATTGGGCCGAATATTTATCAACGGGAAAATTAAGTTCAAAATCTTCTAG
ATTTATTCAAGTAGAACCAGAACCTCCTAGCATCTTTCATGAGCTCGATTCATCTAATGT
TTCTGAAAATCCTATACATCTTGCTACAAAAGAGATCGTTATAGCTAAAAATCCCGAAGC
AGAAACTACTAATTCTCATAACAATTCTAGGCATAGATCGGTAACTTTAATTATCGATAC
TGGTGAATCGTGTACTGTAGAAGAAAAATTGATGAATACAAATCCTGAGTTGTACAAATT
GAGCAAAGTATGGGAATCTGTTGTTGCTAAACAACTAGAAAATGTGAATAATACAATTGT
ATACAAAATTGGCGAACCACTTGACTCATTGATCACATCAATTACCAAGTATTGGGGACA
TANTCGATGTACAATATGTTCAGAAAGTAATTAATATGAAAGTTAATTCAGTTTCCCTTT
TTATTATTTATTCAATGTCTAATATTTTTTTAAACCTTCCCCAACCAAAGTTAACTTAAA
CAATACCAGTGATTATCTGACTGATGTTAAGTATTTTCTTTACTAATCATAAGATTAATG
CATAGTTTTGTATTTTGCTATTTTATTTATCAAGGGGAGTTACATTTCTCAAGAAATAAA
TTTTGTTTT

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)