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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7487#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 743 fasta sequence
[AATTTAATTTGGATTGATAGGAAACTTTTGTCTACTTTGAATATTGAAAATGTACAATTAATACTAATTGACACATGTTGATTGACTGTATCACATATATGTTTTGTGGTATTGGTTATCTATCATTATTACTGTATGTGATATGGGAAACATACTACTTATTACTATATCTATCGTACTTTGTAAACACAAAGAAATATAATGCAGTAATTATATAAACTACTAATTTACATTTAAATTTGTTCAAATGAAGGTGTCTATTAATATAGTATTACGTCCTTGGTTTGAATCTCGCGAGTTGCGATCTTGGATTCGCACTGCTGTAAATTCCCAC-AA-TAAGACGAA-ACGGCCGTCTAGTGCTTCCAGGTTTTCCATGGTGGTCTAGCTTCAACTGACTCATGATCTCAATCAATAAAATGTTTGTGATATTCTAACATGATATATGAGATTTGAAATCCAAAAACTTTAGATAAATATCAACATGATCAAAATGCATACC-CC-ATCTTTTTTTTACCTAAACTTCTTACCTT-AACTATGAATCCTAAGTTCTTTTCTGACTTTTATATGATAAATTATTCATTTATTTCATATCCTGATTGACTTCACTTTCTCAAAGTCATCGAAGATCTCCAGCCCAATATATACCTAGTTTCACCTAGTTTTCATTTAATTTTATTATCAGTTAATTTGATTTGCTCCTCAGGTCATAGCTGAGAAAACTCAATTTAGAATGATGTTTTAAA]
[+] EMBL CD140896 [AATTTAATTTGGATTGATAGGAAACTTTTGTCTACTTTGAATATTGAAAATGTACAATTAATACTAATTGACACATGTTGATTGACTGTATCACATATATGTTTTGTGGTATTGGTTATCTATCATTATTACTGTATGTGATATGGGAAACATACTACTTATTACTATATCTATCGTACTTTGTAAACACAAAGAAATATAATGCAGTAATTATATAAACTACTAATTTACATTTAAATTTGTTCAAATGAAGGTGTCTATTAATATAGTATTACGTCCTTGGTTTGAATCTCGCGAGTTGCGATCTTGGATTCGCACTGCTGTAAATTCCCAC AA TAAGACGAA ACGGCCGTTCAGTGCTTCCAGATTTTCCATGGTATTCTAGCTT ]
[+] EMBL CD140931 [AATTTAATTTGGATTGATAGGAAACTTTTGTCTACTTTGAATATTGAAAATGTACAATTAATACTAATTGACACATGTTGATTGACTGTATCACGTATATGTTTTGTGGTATTGGTTATCTATCATTATTACTGTATGTGATATGGGAAACATACTACTTATTACTATATCTATCGTACTTTGTAAACACAAAGAAATATAATGCAGTAATTATATAAACTACTAATTTACATTTAAATTTGTTCAAATGAAGGTGTCTATTAATATAGTATTACGTCCTTGGTTTGAATCTCGCGAGTTGCGATCTTGGATTCGCACTGCTGAAAATTCCCAC AA TAAGACGAA ACGGCCGTTCAGTGCTTCCAGATTTTCCATGGTattc ]
[+] EMBL CD125116 [ gagTCCCACTAATTAAGACGAATTCGGCCGTCTAGTGCTTCCAGGTTTTCCATGGTGGTCTAGCTTCAACTGACTCATGATCTCAATCAATAAAATGTTTGTGATATTCTAACATGATATATGAGATTCGAAATCCAAAAACTTTAAATAAATATCAACATGATCAAAATGCATACCGCCTATCTTTTTTTTACCTAAACTTCTTACCTTAAACTATGGATCCTAAGTTCTTTTCTGACTTTTATATGATAAATTATTCATTTATTTCATATCCTGATTGACTTCACTTTCTCAAAGTCATCGAAGATCTCCAGCCCAATATATACCTAGTTTCACCTAGTGTGCATTTAATTTGATCATCAGTTAATTTGATTTGCTCCTCAGGTCATAGCTGAGAAAAGTCAATTTAGAATGAGGTcgtag ]
[+] EMBL CD125159 [ gTCCCAC AA TAAGACGAA ACGGCCGTCTAGTGCTTCCAGGTTTTCCATGGTGGTCTAGCTTCAACTGACTCATGATCTCAATCAATAAAATGTTTGTGATATTCTAACATGATATATGAGATTTGAAATCCAAAAACTTTAGATAAATATCAACATGATCAAAATGCATACC CC ATCTTTTTTTTACCTAAACTTCTTACCTT AACTATGAATCCTAAGTTCTTTTCTGACTTTTATATGATAAATTATTCATTTATTTCATATCCTGATTGACTTCACTTTCTCAAAGTCATCGAAGATCTCCAGCCCAATATATACCTAGTTTCACCTAGTTTTCATTTAATTTTATTATCAGTTAATTTGATTTGCTCCTCAGGTCATAGCTGAGAAAACTCAATTTAGAATGATGTTTTAA ]
[-] EMBL CD125216 [ TCCCAC AA TAAGACGAA ACGGCCGTCTAGTGCTTCCAGGTTTTCCATGGTGGTCTAGCTTCAACTGACTCATGATCTCAATCAATAAAATGTTTGTGATATTCTAACATGATATATGAGATTTGAAATCCAAAAACTTTAGATAAATATCAACATGATCAAAATGCATACC CC ATCTTTTTTTTACCTAAACTTCTTACCTT AACTATGAATCCTAAGTTCTTTTCTGACTTTTATATGATAAATTATTCATTTATTTCATATCCTGATTGACTTCACTTTCTCAAAGTCATCGAAGATCTCCAGCCCAATATATACCTAGTTTCACCAAGTTTTCATTTAATTTTATTATCAGTTAATTTGATTTGCTCCTCAGGTCATAGCTGAGAAAACTCAATTTAGAATGATGTTTTAAA]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||