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Schistosoma mansoni
cluster # 7540 cluster # 7540       Sequences # 5       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7540#0 length = 1264 sequences # 5  
consensusID : consensus_7540#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 1264
fasta sequence 
                              [CCTCCAGGCCAANATTCGGCACGAGGAAAAAATAATTTGTGTTGTTTCTGCATATTGGTTTATTTCCATTTCTTTGGTATTTATAAATAAATGGTTATTGAGCGATAAGTCTGTATCGCTAAATGCACCGATATCTATTACTTGGTTTCAATGTGCAGTTACAGCGTTTCTATGTTATTTAACATCGTATGCAGCTCTGCTGTTACCTAGTCATGTGAAGTTTCCACAGTTGAACTTTTCCTTTAAAACGTCGATTGAAATCTTGCCACTGTCTATAATATTTGTTTCAATGGTCTGTTTTAACAACCTATGCCTGAAGTATTTAAGTGTTTCGTTTTATTTTTTAGCACGATCACTAACTACAATCTTCAATGTTATATTTACCTATTTACTGCTAAATACGAAAACTTCAACGAAGGCATTGATTTGTTGTGCTGTCATAATTGTTGGATATTGTGCTGGAGTAATTGTTGAGGGTAATTTAGGTTCTTTAAGTTGGATTGGATTAGTGTTTGGTATTGCATCTAGCATTACTTGTGCATTAAATTCTATCTACACAGCAAAATGTTTACCAAAAGTGGAAGGCAGTGTATGGAGACTTACATTTTACAATAATCTTAATTCCCTTTTTTTATCAATCCCTATTATTGGCTTATTGGAATATCAACCAATTAAAGAACATCTTTTTCAGACTAGTGCTTATTTCTGGTTTGTTATGATAATTAGTGGAATATTTGGATTTGCTATTGGTTACATCAGTACACTGCAAATTCAAGTGACCAGTCCATTAACTCATAATGTTTCCGGTACTGCTAAGGCAGCTGCACAAACAGTACTAGCTGTGATAATTTATCACGAAATCAAATCAATTTCATGGTGGCTTAGTAATATTGTTGTTTTAGGCGGATCAGCAGTTTATGCAGCTGTTCGACATGTAGAAAATGAAAAAAAACCTAAAGGATCAATGAATNNTAATCGAAATGAATATTCTTTTTGCTAGTGTGGGTTTGTGNTGGGTGATGATGATGATGTTAATGATGCCAAACGTGGTCTTCTCAATTTTGTGAATAATAACAATCATAATGATGAAGATGATTTATATGATAAGAGCCGTGTATTATCTTCATCCAAAAATTCAAAAGTTTAATAATTTCTTGATGTTTTCTTGTATTTTGTCTTTTGTTTTGTAAAGGGATTAAACTTTTTTGCTCTCTATGGGTTTCTTAATAACTTGATTTCACTGTGATATGAAATAAATGTTTAA]

[+] EMBL CD080186             [CCTCCAGGCCAANATTCGGCACGAGGAAAAAATAATTTGTGTTGTTTCTGCATATTGGTTTATTTCCATTTCTTTGGTATTTATAAATAAATGGTTATTGAGCGATAAGTCTGTATCGCTAAATGCACCGATATCTATTACTTGGTTTCAATGTGCAGTTACAGCGTTTCTATGTTATTTAACATCGTATGCAGCTCTGCTGTTACCTAGTCATGTGAAGTTTCCACAGTTGAACTTTTCCTTTAAAACGTCGATTGAAATCTTGCCACTGTCTATAATATTTGTTTCAATGGTCTGTTTTAACAACCTATGCCTGAAGTATTTAAGTGTTTCGTTTTATTTTTTAGCACGATCACTAACTACAATCTTCAATGTTATATTTACCTATTTACTGCTAAATACGAAAACTTCAACGAAGGCATTGATTTGTTGTGCTGTCATAATTGTTGGATATTGTGCTGGAGTAATTGTTGAGGGTAATTTAGGTTCTTTAAGTTGGATTGGATTAGTGTTTGGTATTGCATCTAGCATTACTTGTGCATTAAATTCTATCTACACAGCAAAATGTTTACCAAAAGTGGAAGGCAGTGTATGGAGACTTACATTTTACAATAATCTTAATTCCCTTTTTTTATCAATCCCTATTATTGGCTTATTGGAATATCAACCAATTAAAGAACATCTTTTTCAGACTAGTGCTTATTTCTGGTTTGTTATGATAATTAGTGGAATATTTGGATTTGCTATTGGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD158032             [                  gatgattaAAAAAATAATTTGTGTTGTTTCTGCATATTGGTTTATTTCCATTTCTATGGGATTTATAAATAAATGGTTATTGAGCGATAAGTCTGTATCGCTAAATGCACCGATATCTATTACCTGGTTTCAAAGTGCAGTTACAGCGTTTCTATGTTATTTAACATCGTAAGCAGCTCTGCTGTTACCTAGTCATGTGAAGTTTCCACAGTTGAACTTTTCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD134557             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GCATTGATTTGTTGTGCTGTCATAATTGTTGGATATTGTGCTGGAGTAATTGTTGAGGGTAATTTAGGTTCTTTAAGTTGGATTGGATTAGTGTTTGGTATTGCATCTAGCATTACTTGTGCATTAAATTCTATCTACACAGCAAAATGTTTACCAAAAGTGGAAGGCAGTGTATGGAGACTTACATTTTACAATAATCTTAATTCCCTTTTTTTATCAATCCCTATTATTGGCTTATTGGAATATCAACCAATTAAAGAACATCTTTTTCAGACTAGTGCTTATTTCTGGTTTGTTATGATAATTAGTGGAATATTTGGATTTGCTATTGGTTACATCAGTACACTGCAAATTCAAGTGACCAGTCCCTTAACTCATAATGTTTCCGGTACTGCTAAGGCAGCTGCACAAACAGTACTAGCTGTGATAATTTATCACGAAATCAAATCAATTTCATGGTGGCTTAGTAATATTGTTGTTTTAGGCGGATCAGCAGTTTATGCANCTGTTCGACATGTAGAAAATGAAAAAAAACCTAAAGGATCAATGAATNNTAATCGAAATGAATATTCTTTTTGCTAGTGTGGGTTTGTGNTGGGTGATGATGATGATGTT                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD084313             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gacgaggGATTTGTTGTGCTGTCATAATTG TGGATATTGTGCTGGAGTAATTGTTGAGGGTAATTTAGGTTCTTTAAGTTGGATTGGATTAGTGTTTGGTATTGCATCTAGCATTACTTGTGCATTAAATTCTATCTACACAGCAAAATGTTTACCAAAAGTGGAAGGCAGTGTATGGAGACTTACATTTTACAATAATCTTAATTCCCTTTTTTTATCAATCCCTATTATTGGCTTATTGGAATATCAACCAATTAAAGAACATCTTTTTCAGACTAGTGCTTATTTCTGGTTTGTTATGATAATTAGTGGAATATTTGGATTTGCTATTGGTTACATCAGTACACTGCAAATTCAAGTGACCAGTCCATTAACTCATAATGTTTCCGGTACTGCTAAGGCAGCTGCACAAACAGTACTAGCTGTGATAATTTATCACGAAATCAAATCAATTTCATGGTGGCTTAGTAATATTGTTGTTTTAGGCGGATCAGCAGTTTATGCAGCTGTTCGACATGTAGAAAATGAAAAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL AI976512             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TTGGATTTGCTATTGGTTACATCAGTACAC GCAAATTCAAGTGACCAGTCCATTAACTCATAATGTTTCCGGTACTGCTAAGGCAGCTGCACAAACAGTACTAGCTGTGATAATTTATCACGAAATCAAATCAATTTCATGGTGGCTTAGTAATATTGTTGTTTTAGGCGGATCAGCAGTTTATGCAGCTGTTCGACATGTAGAAAATGAAAAAAAACCTAAAGGATCAATGAATTTTAATCGAAATGATAATTC TTTTGCTAGTGTGG  TTGTTGTTGGTGATGATGATGATGTTAATGATGCCAAACGTGGTCTTCTCAATTTTGTGAATAATAACAATCATAATGATGAAGATGATTTATATGATAAGAGCCGTGTATTATCTTCATCCAAAAATTCAAAAGTTTAATAATTTCTTGATGTTTTCTTGTATTTTGTCTTTTGTTTTGTAAAGGGATTAAACTTTTTTGCTCTCTATGGGTTTCTTAATAACTTGATTTCACTGTGATATGAAATAAATGTTTAA]




>consensus_7540#0
CCTCCAGGCCAANATTCGGCACGAGGAAAAAATAATTTGTGTTGTTTCTGCATATTGGTT
TATTTCCATTTCTTTGGTATTTATAAATAAATGGTTATTGAGCGATAAGTCTGTATCGCT
AAATGCACCGATATCTATTACTTGGTTTCAATGTGCAGTTACAGCGTTTCTATGTTATTT
AACATCGTATGCAGCTCTGCTGTTACCTAGTCATGTGAAGTTTCCACAGTTGAACTTTTC
CTTTAAAACGTCGATTGAAATCTTGCCACTGTCTATAATATTTGTTTCAATGGTCTGTTT
TAACAACCTATGCCTGAAGTATTTAAGTGTTTCGTTTTATTTTTTAGCACGATCACTAAC
TACAATCTTCAATGTTATATTTACCTATTTACTGCTAAATACGAAAACTTCAACGAAGGC
ATTGATTTGTTGTGCTGTCATAATTGTTGGATATTGTGCTGGAGTAATTGTTGAGGGTAA
TTTAGGTTCTTTAAGTTGGATTGGATTAGTGTTTGGTATTGCATCTAGCATTACTTGTGC
ATTAAATTCTATCTACACAGCAAAATGTTTACCAAAAGTGGAAGGCAGTGTATGGAGACT
TACATTTTACAATAATCTTAATTCCCTTTTTTTATCAATCCCTATTATTGGCTTATTGGA
ATATCAACCAATTAAAGAACATCTTTTTCAGACTAGTGCTTATTTCTGGTTTGTTATGAT
AATTAGTGGAATATTTGGATTTGCTATTGGTTACATCAGTACACTGCAAATTCAAGTGAC
CAGTCCATTAACTCATAATGTTTCCGGTACTGCTAAGGCAGCTGCACAAACAGTACTAGC
TGTGATAATTTATCACGAAATCAAATCAATTTCATGGTGGCTTAGTAATATTGTTGTTTT
AGGCGGATCAGCAGTTTATGCAGCTGTTCGACATGTAGAAAATGAAAAAAAACCTAAAGG
ATCAATGAATNNTAATCGAAATGAATATTCTTTTTGCTAGTGTGGGTTTGTGNTGGGTGA
TGATGATGATGTTAATGATGCCAAACGTGGTCTTCTCAATTTTGTGAATAATAACAATCA
TAATGATGAAGATGATTTATATGATAAGAGCCGTGTATTATCTTCATCCAAAAATTCAAA
AGTTTAATAATTTCTTGATGTTTTCTTGTATTTTGTCTTTTGTTTTGTAAAGGGATTAAA
CTTTTTTGCTCTCTATGGGTTTCTTAATAACTTGATTTCACTGTGATATGAAATAAATGT
TTAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)