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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7555#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 873 fasta sequence
[ATTCTGTAAATCCAAACTACCCATATCTACTTTAAATTGCTGGCATGAATTATTGCAAACGGACGCGGCTGTTGTAGCAGAAGTGGTAAGAATTTGTGTATTTGTCACTTTTATCGATGCTCTGCAAAAGTATCGCCGATCGCCGGCTGCTTGTTCGTTATCGATTGATAATGACCATGGTTATGATGGTGATTATGAAATAATTTAACTTGCTTGCTAGGTAAATATGATAATTTAGTCACAGGAACTGATGGTTTATAAATAGCCTGACCATCACCAGATTTACGTTCTATTCTTTCTCGATCTGTTTTATGCTTACGATCAGCTCCTTTCATTTTAAAT-ACTTTAATTT-GACAAGCGAATGAGCCCAAATGTTGGTTAGTATCATATTCAAAATGTTCTACCCGAAATCGAAAAGGAATTCCTTTTTCACCACCGTGCTTCTTAGCAGTAAACTCAGTACTGACACAATTAAATCGTAAACCAATAGTACATTTCGGATATTTCCATATACATAATATATCATCTGATGGAGTATTTTCTCTATCTAATTCTTCATAATCATTCGATCTTTTATAATCTACGTCTATGAGGTTTTCACCAGGGTGTGTTTGATGCCAGTTATCCCAATGCTCGTGTTCATTTAATTCCATCTGTTTGTCATAGAAAGTAACTCGAATCCATGTCTTGATAAATGTTATCTCCGGTGTTTTCGAGTTTAACTTAAGCTCATACGTTTGTCCTTGATTTAGGTAAGTTAAAGACGCTACACCTAATCGTGTAGCCGACGACGTTGGAGCTTTCAAAATGTTATCAAACAAATGAGAGTTTGTATCAGCCATCGAGACAAAAGTATTAGCAACAGTCTGTGCC]
[+] EMBL CD187933 [ATTCTGTAAATCCAAACTACCCATATCTACTTTAAATTGCTGGCATGAATTATTGCAAACGGACGCGGCTGTTGTAGCAGAAGTGGTAAGAATTTGTGTATTTGTCACTTTTATCGATGCTCTGCAAAAGTATCGCCGATCGCCGGCTGCTTGTTCGTTATCGATTGATAATGACCATGGTTATGATGGTGATTATGAAATAATTTAACTTGCTTGCTAGGTAAATATGATAATTTAGTCACAGGAACTGATGGTTTATAAATAGCCTGACCATCACCAGATTTACGTTCTATTCTTTCTCGATCTGTTTTATGCTTACGATCAGCTCCTTTCATTTTAAAT ACTATAATTT GACAAGCGAATGAGCCCAAATGTTGGTTAGTATCATATTCAAAATGTTCTACCCGAAATCGAAAAGGAATTCCTTTTTCACCACCGT CTTCTcg ]
[+] EMBL CD124654 [ ATTTACGTTCTATTCTTTCTCGATCTGTTTTATGCTTACGATCAGCTCCTTTCATTTTAAAT ACTTTAATTT GACAAGCGAATGAGCCCAAATGTTGGTTAGTATCATATTCAAAATGTTCTACCCGAAATCGAAAAGGAATTCCTTTTTCACCACCGTGCTTCTTAGCAGTAAACTCAGTACTGACACAATTAAATCGTAAACCAATAGTACATTTCGGATATTTCCATATACATAATATATCATCTGATGGAGTATTTTCTCTATCTAATTCTTCATAATCATTCGATCTTTTATAATCTACGTCTATGAGGTTTTCACCAGGGTGTGTTTGATGCCAGTTATCCCAATGCTCGTGTTCATTTAATTCCATCTGTTTGTCATAGAAAGTAACTCG ]
[+] EMBL CD124663 [ ATTTACGTTCTATTCTTTCTCGATCTGTTTTATGCTTACGATCAGCTCCTTTCATTTTAAAT ACTTTAATTT GACAAGCGAATGAGCCCAAATGTTGGTTAGTATCATATTCAAAATGTTCTACCCGAAATCGAAAAGGAATTCCTTTTTCACCACCGTGCTTCTTAGCAGTAAACTCAGTACTGACACAATTAAATCGTAAACCAATAGTACATTTCGGATATTTCCATATACATAATATATCATCTGATGGAGTATTTTCACTATCTAATTCTTCATAATCATTCGATCTTTTATAATCTACGTCTATGAGGTTTTCACCAGGGTGTGTTTGATGCCAGTTATCCCAATGCTCGTGTTCATTTAATTCCATCTGTTTGTCATAGAAAGTAACTCG ]
[+] EMBL CD124649 [ ATTTACGTTCTATTCTTTCTCGATCTGTTTTATGCTTACGATCAGCTCCTTTTATTTTAAATAACTTTAATTTNGACAAGCGAATGAGCCCAAATGTTGGT ]
[+] EMBL CD180676 [ GATGCCAGTTATCCCAATCCTCGTGTTCATTTAATTCCATCTGTTTGTCATAGAAAGTAACTCGAATCCATGTCTTGATAAATGTTATCTCCGGTGTTTTCGAGTTTAACTTAAGCTCATACGTTTGTCCTTGATTTAGGTAAGTTAAAGACGCTACACCTAATCGTGTAGCCGACGACGTTGGAGCTTTCAAAATGTTATCAAACAAATGAGAGTTTGTATCAGCCATCGAGACAAAAGTATTAGCAACAGTCTGTGCC]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||