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Schistosoma mansoni
cluster # 7573 cluster # 7573       Sequences # 5       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7573#0 length = 939 sequences # 5  
consensusID : consensus_7573#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 939
fasta sequence 
                              [ATTAAAAACCACTAATATGTAAAAGAATCTCGTATGAGAAACACTTTGACAACATACCGAAAGTTTTTGATATAAGTTTTTAATATTTATGGACTGTATACTTTGTATTCGTTTGTTTCACCTGATTACTTTACTTAATACTGTGAGCTCATTCTGATGTGAATACTAGTCATCACAACGTTTCAATACATCCATAAAGTTTCTTTTGCTTCTTATGTCTAACCACATCACATAGATAACGGAAACACCTATTATTGGATGAAAATATCTAAATGCAACCATTAACAAATAAAAAGGTCGTTAAAAACTTCTCAACTAAGTGTACACTGAAAACAGTAACTAGATATAAAAGTTTCGCTTTATAAGGATAAAGTGTGAAAATCAACAGATAATCACTTTGTAGACAAAGTGTTTTCTTAACCTACATATCTATTAATTGTAACTAGTTGACTGTGAGTGTAGTAATCCAAGTCATTTCATACTGTTTTCCCTTGTGTTGTTCTATATGGCATAATATGTCCAGTTTCTTATAGTGTTTCATGGTTTATGTTTTCTAAAAAATCATTCATGGTAACTAATCTAATGCTTTTTTTATTTGACCTGAACAAAACGGAAACGTTAGCCAATCTTCCCTTTAAGCAATCATGATCACTTTTAACTAACTGATCTTTGCTTATAAATATAAAACGTATAGACCACGTTATTAAACAGCTATTTTAGTTTACTATTCATTGTTGTTCTTTAAAATAGGTTCCATAATTTGTATATTAGTGGCTAGTGCATTTTTTTTCTAAATTTAAATAGGTTATTCACTTGAATAAATTTTCTATATAACGATATGAAAATTGCCAAAGAAGAAAATTCTCCATCATATTAACATATAGATATATGTGTGCTCTGATGTGAAAATCAAAAGTCATTCATACGTATCTATTTTAT]

[+] EMBL CD088669             [ATTAAAAACCACTAATATGTAAAAGAATCTCGTATGAGAAACACTTTGACAACATACCGAAAGTTTTTGATATAAGTTTTTAATATTTATGGACTGTATACTTTGTATTCGTTTGTTTCACCTGATTACTTTACTTAATACTGTGAGCTCATTCTGATGTGAATACTAGTCATCACAACGTTTCAATACATCCATAAAGTTTCTTTTGCTTCTTATGTCTAACCACATCACATAGATAACGGAAACACCTATTATTGGATGAAAATATCTAAATGCAACCATTAACAAATAAAAAGGTCGTTAAAAACTTCTCAACTAAGTGTACACTGAAAACAGTAACTAGATATAAAAGTTTCGCTTTATAAGGATAAAGTGTGAAAATCAACAGATAATCACTTTGTAGACAAAGTGTTTTCTTAACCTACATATCTATTAATTGTAACTAGTTGACTGTGAGTGTAGTAATCCAAGTCATTTCATACTGTTTTCCCTTGTGTTGTTCTATATGGCATAATATGTCCAGTTTCTTATAGTGTTTCATGGTTTATGTTTTCTAAAAAATCATTCATGGTAACTAATCTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD088630             [ATTAAAAACCACTAATATGTAAAAGAATCTCGTATGAGAAACACTTTGACAACATACCGAAAGTTTTTGATATAAGTTTTCAATATTTATGGACTGTATACTTTGTATTCGTTTGTTTCACCTGATTACTTTACTTAATACTGTGAGCTCATTCTGATGTGAATACTAGTCATCACAACGTTTCAATACATCCATAAAGTTTCTTTTGCTTCTTATGTCTAACCACATCACATAGATAACGGAAACACCTATTATTGGATGAAAATATCTAAATGCAACCATTAACAAATAAAAAGGTCGTTAAAAACTTCTCAACTAAGTGTACACTGAAAACAGTAACTAGATATAAAAGTTTCGCTTTATAAGGATAAAGTGTGAAAATCAACAGATAATCACTTTGTAGACAAAGTGTTTTCTTAACCTACATATCTATTAATTGTAACTAGTTGACTGTGAGTGTAGTAATCCAAGTCATTTCATACTGTTTTCCCTTGTGTTGTTCTATATGGCATAATATGTCCAGTTTCTTATAGTGTTTCATGGgt                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD088627             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tnTATAAGGATANAGTGTGANAATCAACAGATAATCACTTTGTAGACAAAGTGTTTTCTTAACCTACATATCTATTAATTGTAACTAGTTGACTGTGAGTGTAGTAATCCAAGTCATTTCATACTGTTTTCCCTTGTGTTGTTCTATATGGCATAATATGTCCAGTTTCTTATAGTGTTTCATGGTTTATGTTTTCTAAAAAATCATTCATGGTAACTAATCTAATGCTTTTTTTATTTGACCTGAACAAAACGGAAACGTTAGCCAATCTTCCCTTTAAGCAATCATGATCACTTTTAACTAACTGATCTTTGCTTATAAATATAAAACGTATAGACCACGTTATTAAACAGCTATTTTAGTTTACTATTCATTGTTGTTCTTTAAAATAGGTTCCATAATTTGTATATTAGTGGCTAGTGATTTTTTTTTCTAAATTTAAATAGGTTATTCAGTTGAATAAATTTTCTATATAACGATATGAAAATTGCCAAAGAAGAAAATTCTCCATCATATTAACATATAGATATATGTGTGCTCTGGTGTGAAAATCAAAAGTCATTCATACGTATCTATTTTAT]
[-] EMBL CD088633             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AGGATAAAGTGTGAAAATCAACAGATAATCACTTTGTAGACANAGTGTTTTCTTAACCTACATATCTATTAATTGTAACTAGTTGACTGTGAGTGTAGTAATCCAAGTCATTTCATACTGTTTTCCCTTGTGTTGTTCTATATGGCATAATATGTCCAGTTTCTTATAGTGTTTCATGGTTTATGTTTCCTAAAAAATCATTCATGGTAACTAATCTAATGCTTTTTTTATTTGACCTGAACAAAACGGAAACG TAGCCAATCTTCCCTTTAAGCAATCATGATCACTTTTAACTAACTGATCTTTGCTTATAAATATAAAACGTATAGACCACGTTATTAAACAGCTATTTTAGTTTACTATTCATTGTTGTTCTTTAAAATAGGTTCCATAATTTGTATATTAGTGGCTAGTGCATTTTTTTTCTAAATTTAAATAGGTTATTCACTTGAATAAATTTTCTATATAACGATATGAAAATTGCCAAAGAAGAAAATTCTCCATCATATTAACATATAGATATATGTGTGCTCTGATGTGAAAATCAAAAGTCATTCATACGTATCTATTTTAT]
[-] EMBL CD088717             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TAATCACTTGNTAGACAAAGTGTTTTCTTAACCTACATATCTATTAATTGTAACTAGTTGACTGTGAGTGTAGTAATCCAAGTCATTTCATACTGTTTTCCCTTGTGTTGTTCTATATGGCATAATATGTCCAGTTTCTTATAGTGTTTCATGGTTTATGTTTTCTAAAAAATCATTCATGGTAACTAATCTAATGCTTTTTTTATTTGACCTGAACAAAACGGAAACGTTAGCCAATCTTCCCTTTAAGCAATTATGATCACTTTTAACTAACTGATCTTTGCTTATAAATATAAAACGTATAGACCACGTTATTAAACAGCTATTTTAGTTTACCATTCATTGTTGTTCTTTAAAATAGGTTCCATAATTTGTATATTAGTGGCTAGTGCATTTTTTTTCTAAATTTAAATAGGTTATTCACTTGAATAAATTTTCTATATAACGATATGAAAATTGCCAAAGAAGAAAATTCTCCATCATATTAACATATAGATATATGTGTGCTCTGATGTGAAAAACAAAAGTCATTCATACGTATCTATTTTAT]




>consensus_7573#0
ATTAAAAACCACTAATATGTAAAAGAATCTCGTATGAGAAACACTTTGACAACATACCGA
AAGTTTTTGATATAAGTTTTTAATATTTATGGACTGTATACTTTGTATTCGTTTGTTTCA
CCTGATTACTTTACTTAATACTGTGAGCTCATTCTGATGTGAATACTAGTCATCACAACG
TTTCAATACATCCATAAAGTTTCTTTTGCTTCTTATGTCTAACCACATCACATAGATAAC
GGAAACACCTATTATTGGATGAAAATATCTAAATGCAACCATTAACAAATAAAAAGGTCG
TTAAAAACTTCTCAACTAAGTGTACACTGAAAACAGTAACTAGATATAAAAGTTTCGCTT
TATAAGGATAAAGTGTGAAAATCAACAGATAATCACTTTGTAGACAAAGTGTTTTCTTAA
CCTACATATCTATTAATTGTAACTAGTTGACTGTGAGTGTAGTAATCCAAGTCATTTCAT
ACTGTTTTCCCTTGTGTTGTTCTATATGGCATAATATGTCCAGTTTCTTATAGTGTTTCA
TGGTTTATGTTTTCTAAAAAATCATTCATGGTAACTAATCTAATGCTTTTTTTATTTGAC
CTGAACAAAACGGAAACGTTAGCCAATCTTCCCTTTAAGCAATCATGATCACTTTTAACT
AACTGATCTTTGCTTATAAATATAAAACGTATAGACCACGTTATTAAACAGCTATTTTAG
TTTACTATTCATTGTTGTTCTTTAAAATAGGTTCCATAATTTGTATATTAGTGGCTAGTG
CATTTTTTTTCTAAATTTAAATAGGTTATTCACTTGAATAAATTTTCTATATAACGATAT
GAAAATTGCCAAAGAAGAAAATTCTCCATCATATTAACATATAGATATATGTGTGCTCTG
ATGTGAAAATCAAAAGTCATTCATACGTATCTATTTTAT

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)